Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6010, 314 aa
1>>>pF1KE6010 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2956+/-0.00112; mu= 15.9056+/- 0.067
mean_var=131.8593+/-42.914, 0's: 0 Z-trim(104.0): 371 B-trim: 917 in 2/48
Lambda= 0.111691
statistics sampled from 7194 (7661) to 7194 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 2038 340.4 1.1e-93
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1287 219.4 2.9e-57
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1214 207.7 9.8e-54
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1210 207.0 1.5e-53
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1209 206.8 1.7e-53
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1196 204.8 7.4e-53
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1194 204.4 9.3e-53
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1191 204.0 1.3e-52
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1189 203.7 1.7e-52
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1188 203.5 1.8e-52
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1178 201.9 5.6e-52
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1172 200.9 1.1e-51
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1170 200.6 1.3e-51
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1164 199.6 2.6e-51
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1155 198.2 7.2e-51
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1149 197.2 1.4e-50
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1003 173.7 1.7e-43
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 959 166.6 2.4e-41
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 956 166.1 3.3e-41
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 952 165.4 5e-41
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 952 165.4 5e-41
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 951 165.3 5.6e-41
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 947 164.6 8.9e-41
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 943 164.0 1.4e-40
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 941 163.7 1.7e-40
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 941 163.7 1.7e-40
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 937 163.0 2.7e-40
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 936 162.9 3e-40
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 934 162.5 3.7e-40
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 934 162.5 3.8e-40
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 931 162.1 5.6e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 930 161.9 5.8e-40
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 929 161.7 6.6e-40
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 929 161.7 6.6e-40
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 926 161.3 9.8e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 923 160.8 1.3e-39
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 920 160.3 1.8e-39
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 920 160.3 1.8e-39
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 920 160.3 1.8e-39
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 920 160.3 1.8e-39
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 918 160.0 2.2e-39
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 918 160.0 2.3e-39
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 918 160.0 2.3e-39
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 916 159.6 2.8e-39
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 916 159.6 2.8e-39
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 916 159.7 2.8e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 915 159.5 3.2e-39
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 913 159.2 3.9e-39
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 910 158.7 5.6e-39
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 909 158.5 6.1e-39
>>CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 2038 init1: 2038 opt: 2038 Z-score: 1795.7 bits: 340.4 E(32554): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 2038; 98.4% identity (99.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS31 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
:::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
::::::::::::::::::::::::::::::: :: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGRLLLGKRELGKE
::::::::::::::
CCDS31 LGRLLLGKRELGKE
310
>>CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 (320 aa)
initn: 1287 init1: 1287 opt: 1287 Z-score: 1141.6 bits: 219.4 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1287; 60.7% identity (86.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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CCDS46 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
::: .:::::: :::: :::.: :: : ::::::.:: :::.... ::.:::::::::.:
CCDS46 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
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CCDS46 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
.:::...::..:.... .::.:.. .::.::..::.::.::..:::. .: ....::..:
CCDS46 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
:::::::::.:::.:::::.::: .:.::::::::::...:: ::::::::::...: :
CCDS46 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKDMKDA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGRLLLGKRELGKE
: .:.
CCDS46 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
310 320
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1214 init1: 1214 opt: 1214 Z-score: 1078.2 bits: 207.7 E(32554): 9.8e-54
Smith-Waterman score: 1214; 58.6% identity (84.5% similar) in 304 aa overlap (5-308:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
: :. ::::::::.:.:: .::: .:. :::::::: :::..: ::: ::::::
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
:::..::.::. :::: :: : ::. :::.: ::. ::.. :.::..::.::: ::
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
:: .:.::::::.::::::::. :.:..: :.:.:: . ::.:: ::.:..:::.::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
.:::...::..:.. . ..::..: :. : ..: .::..:..:::.:.:. .:.:::.:
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
:.:::::: .:::.:::.:.::. : .::::::..:::..::: :::.::::::...: :
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGRLLLGKRELGKE
: .:: ::
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1210 init1: 1210 opt: 1210 Z-score: 1074.6 bits: 207.0 E(32554): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 1210; 56.4% identity (86.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
:. ::.:.. :.::::::.:.:::.::..:: :.:.:.:::..::: :: .::::::
CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
:::..:: .:. :::: :::: ..: :::.:: ::. ::.. .:::. ::.:::::::
CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
:: .:.:.::.:..::.::.: .:.. .: :. .:: . .:..:: :::. .::..::
CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
.:.::..::..:. .. .:: .: .. :...::.::..:..:::.:.::.::::::::
CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
:.:::.:: .:::.::.::.::. :..::::..:::.::::::::.::::::..::::
CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LGRLLLGKRELGKE
: :.::
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1213 init1: 1189 opt: 1209 Z-score: 1073.8 bits: 206.8 E(32554): 1.7e-53
Smith-Waterman score: 1209; 57.4% identity (83.3% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDG-TNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHT
:: .:.:.. .:::.:::. :::: ..:::.:: ::.::.:: ::..: :: ::::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 PMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAV
::::::..:::::: .::::::::: :: : .::::: :: :::.. :.:: .::.::.:
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHF
:.::: .:.:.:::: :.:.::.:. :. ..: : .:: : :. .: :::..::::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LCEMPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA
.::.:::.:..:..: . . :... . :: ::..:: ::. ::::.:...:..: ::.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV
:::::.:: .::::. . ::.:: ...:::::::..:::..::: ::::::::::. :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KGALGRLLLGKRELGKE
.::. ::.
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1235 init1: 1177 opt: 1196 Z-score: 1062.5 bits: 204.8 E(32554): 7.4e-53
Smith-Waterman score: 1196; 55.9% identity (84.6% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
:. : :. .::::::::: :. ::::.::.: .:. ::..:..: :::.::::::
CCDS34 MNWENESSPKEFILLGFSDRAWLQMPLFVVLLISYTITIFGNVSIMMVCILDPKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDK-TISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
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CCDS34 FFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNI-GCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLAVMS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLC
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CCDS34 FDRYVAVCRPLHYVVIMNYWFCLRMAAFSWLIGFGNSVLQSSLTLNMPRCGHQEVDHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EMPALIRMACISTVAIDGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFG
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CCDS34 EVPALLKLSCADTKPIEAELFFFSVLILLIPVTLILISYGFIAQAVLKIRSAEGRQKAFG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
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CCDS34 TCGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSMLNSLIYSLRNKDMKE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 ALGRLLLGKRELGKE
:. ::.
CCDS34 AFKRLMPRIFFCKK
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAV
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CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
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pF1KE6 MAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHF
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CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
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CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGKFLTLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KGALGRLLLGKRELGKE
:::: ..:
CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS46 FFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLLAVMSF
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pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
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CCDS46 VPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQKAFGT
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CCDS46 CGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEG
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310
pF1KE6 LGRLLLGKRELGKE
. ::.
CCDS46 FKRLVARVFLIKK
310
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CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
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pF1KE6 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
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pF1KE6 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLCE
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CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
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CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
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CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
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CCDS46 FKRLV-AKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
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CCDS43 MMIKKNASSEDFFILLGFSNWPQLEVVLFVVILIFYLMTLTGNLFIIILSYVDSHLHTPM
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CCDS43 YDRYVAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLVAASWVIGFTISALHSSFTFWVPLCGHRLVDHFFC
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CCDS43 EVPALLRLSCVDTHANELTLMVMSSIFVLIPLILILTTYGAIARAVLSMQSTTGLQKVFR
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CCDS43 AAKRLLGWEWGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]