Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6008, 314 aa
1>>>pF1KE6008 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8801+/-0.00066; mu= 18.3073+/- 0.040
mean_var=91.4989+/-24.526, 0's: 0 Z-trim(104.1): 307 B-trim: 733 in 1/47
Lambda= 0.134081
statistics sampled from 12149 (12532) to 12149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.457), E-opt: 0.2 (0.147), width: 16
Scan time: 5.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1028 210.1 4.9e-54
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 960 196.9 4.4e-50
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 929 190.9 2.8e-48
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 929 190.9 2.9e-48
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 902 185.7 1e-46
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 863 178.2 2e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 863 178.2 2e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 830 171.8 1.6e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 820 169.8 6.2e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 810 167.9 2.4e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 803 166.5 6e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 769 160.0 5.8e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 750 156.3 7.3e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 744 155.2 1.7e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 742 154.8 2.2e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 523 112.4 1.2e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 464 101.0 3.4e-21
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 202 50.3 6.1e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 190 48.1 3.5e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 190 48.1 3.5e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 179 46.0 0.00017
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 179 46.0 0.00017
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 178 45.9 0.0002
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 178 45.9 0.00021
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 176 45.4 0.00023
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 176 45.4 0.00024
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 176 45.4 0.00024
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 176 45.4 0.00024
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 172 44.5 0.00035
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 172 44.5 0.00035
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 172 44.5 0.00037
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 171 44.3 0.00041
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 170 44.1 0.00044
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 170 44.2 0.0005
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 170 44.2 0.0005
NP_056542 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 311) 166 43.3 0.00076
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 167 43.7 0.00079
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 167 43.7 0.00087
NP_001049 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 407) 166 43.5 0.0009
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 164 43.0 0.001
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NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 162 42.7 0.0016
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 160 42.3 0.0019
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 160 42.3 0.0019
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 160 42.3 0.002
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF
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NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE6 NAFMKVVEKAKYSLDSVF
.: ::.
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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pF1KE6 AFMKVVEKAKYSLDSVF
: .: ..: :
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310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF
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310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY
:.. ::::.::::. :. : ::..: .:: :. ::: .:. . .:: ::::::
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pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY
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pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF
. ::: .. .:.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 929; 44.8% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:15-322)
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pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILIL
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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110 120 130 140 150 160
pF1KE6 ENYLLSSMAYDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCM
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 SNVIHHFFCDKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHT
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GKGYQKPLSTCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE6 TLRNKDVKNAFMKVVEKAKYSLDSVF
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 925 init1: 900 opt: 902 Z-score: 959.5 bits: 185.7 E(85289): 1e-46
Smith-Waterman score: 902; 44.2% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE6 PMYFFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSS
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE6 MAYDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE6 FCDKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKP
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE6 LSTCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE6 KNAFMKVVEKAKYSLDSVF
..: ...
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 898 init1: 732 opt: 882 Z-score: 938.6 bits: 181.8 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 882; 43.2% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE6 DRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE6 KPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE6 CGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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300 310
pF1KE6 FMKVVEKAKYSLDSVF
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NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 897 init1: 813 opt: 872 Z-score: 928.0 bits: 179.9 E(85289): 5.9e-45
Smith-Waterman score: 872; 43.8% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (3-305:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAP-ELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE6 YFFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE6 YDRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE6 DKPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE6 TCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKN
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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pF1KE6 AFMKVVEKAKYSLDSVF
:. .. .:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 870 init1: 849 opt: 863 Z-score: 918.6 bits: 178.2 E(85289): 2e-44
Smith-Waterman score: 863; 43.6% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-307)
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pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE6 FFLSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE6 DRYAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 KPAVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFA-LLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLS
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE6 TCGSHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKN
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]