Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6008, 314 aa
1>>>pF1KE6008 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3217+/-0.0016; mu= 15.6654+/- 0.093
mean_var=139.3629+/-45.282, 0's: 0 Z-trim(98.9): 390 B-trim: 667 in 2/44
Lambda= 0.108643
statistics sampled from 5061 (5540) to 5061 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 1.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 2014 328.4 4.5e-90
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1488 246.0 2.9e-65
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1484 245.3 4.5e-65
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1413 234.2 1e-61
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1303 216.9 1.6e-56
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1068 180.1 1.9e-45
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1060 178.9 4.6e-45
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1056 178.3 7.3e-45
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1043 176.2 2.9e-44
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1030 174.2 1.2e-43
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1028 173.9 1.5e-43
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1025 173.4 2e-43
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1025 173.4 2e-43
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1024 173.2 2.3e-43
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1021 172.7 3.2e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1014 171.6 6.7e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1013 171.5 7.5e-43
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 997 169.0 4.5e-42
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 995 168.7 5.3e-42
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 989 167.7 1e-41
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 989 167.7 1e-41
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 988 167.6 1.1e-41
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 987 167.4 1.3e-41
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 987 167.4 1.3e-41
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 986 167.4 1.5e-41
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 984 167.0 1.9e-41
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 979 166.2 3.1e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 978 166.0 3.4e-41
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 974 165.4 5.3e-41
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 966 164.1 1.2e-40
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 962 163.5 1.9e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 961 163.4 2.2e-40
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 960 163.2 2.4e-40
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 960 163.2 2.4e-40
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 958 162.9 3e-40
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 950 161.6 7.1e-40
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 950 161.7 7.3e-40
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 947 161.1 9.7e-40
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 945 160.8 1.2e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 944 160.7 1.4e-39
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 944 160.7 1.4e-39
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 944 160.7 1.4e-39
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 940 160.1 2.1e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 936 159.5 3.5e-39
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 933 159.0 4.5e-39
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 932 158.8 5e-39
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 931 158.6 5.6e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 929 158.3 6.9e-39
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 929 158.3 6.9e-39
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 928 158.2 7.7e-39
>>CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2014 init1: 2014 opt: 2014 Z-score: 1730.6 bits: 328.4 E(32554): 4.5e-90
Smith-Waterman score: 2014; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KVVEKAKYSLDSVF
::::::::::::::
CCDS31 KVVEKAKYSLDSVF
310
>>CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1537 init1: 1488 opt: 1488 Z-score: 1285.1 bits: 246.0 E(32554): 2.9e-65
Smith-Waterman score: 1488; 72.3% identity (90.3% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
:::.:::..:::::::: :::::::: : .::.:::.::::.:.::. :: ::.:::::
CCDS31 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
::::::. . ::::::: :..:.:::::.:::.::::::.. ..:::::::::.::::::
CCDS31 LSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
:::::.:::::::::: ::: :::: :. :::::::. :::: :::: :: .:::::: :
CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
::..:.::..:::::.:. . :::.:.:::: :::: ::.::::: :... ::::::::.
CCDS31 AVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
::.::. .:: :.:.::..:::::::::::.: :::::.::::.:.::.::::.::.::
CCDS31 SHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KVVEKAKYSLDSVF
::::::: :.
CCDS31 KVVEKAKLSVGWSV
310
>>CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1513 init1: 1484 opt: 1484 Z-score: 1281.8 bits: 245.3 E(32554): 4.5e-65
Smith-Waterman score: 1484; 71.1% identity (91.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
::: :::..:::::::..::::.::::.::.:::.:: :::::..:::.:: ::::::::
CCDS31 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
::::::. .::::::::::..:.: ::.:::.:::.:::: ...::::::::.::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
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pF1KE6 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
:::::.:::::::::. : ::::.: :: ::::::..:: : :::: ::..:::::: :
CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
::..:.::.:: ::.:::..::::.::.::: .::::::.::::: :..::.:: ::::.
CCDS31 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
::. :. .:: :::..:..:::::::::::.:::::.::::::.:.::.:::..:.:::
CCDS31 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KVVEKAKYSLDSVF
::... :.
CCDS31 KVLRRQKFL
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1445 init1: 1413 opt: 1413 Z-score: 1221.5 bits: 234.2 E(32554): 1e-61
Smith-Waterman score: 1413; 66.9% identity (88.2% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
:::::::.::::.:::. ::::.::::.: .::::::.:::::: :::::: ::::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
::::::. .::::::::::..:.: :: : :.:::.:.:: ..: :.:..::.::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
:::.:.:::::::::: :::::::: :. :::::::. :.::::::: :::..::::: :
CCDS31 YAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
..::.::...:::... .. .:: .:..:: :::::::.:::.: .. .: :: .:::.
CCDS31 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
::: :. .:: : :.::.::.::: : :::.:::::...::::.:.::.::::.::.::
CCDS31 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KVVEKAKYSLDSVF
:.: ::: :. .:
CCDS31 KTVGKAKASIGFIF
310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1322 init1: 875 opt: 1303 Z-score: 1128.4 bits: 216.9 E(32554): 1.6e-56
Smith-Waterman score: 1303; 64.6% identity (87.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
:::.:::.::::::::. :.::.::.. : .:::::: :: ::...: :::::::::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
::::::. .::::::.::....: ::::::..::::.:: . ::::: :::.::::::
CCDS31 LSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
.:::: :::::::::. ::: :: : :: :::::::. . ::::::: :: :.::::: :
CCDS31 HAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
...:.::. .::.:. :....:::::.::: ::::.:: ::: . :...: .: .:::.
CCDS31 PLLALSCSDTRISKLV-VFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFSTCA
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
::: :. .:: :.:.::..:.::.:.:::::::::::..::::.:..:.::::.::.:.
CCDS31 SHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSALW
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 KVVEKAKYSLDSVF
:...:
CCDS31 KILNKLYPQY
300
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1121 init1: 1061 opt: 1068 Z-score: 929.3 bits: 180.1 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 1068; 51.2% identity (81.2% similar) in 303 aa overlap (3-305:11-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSH
:.:::.::.::::.. :.:: :: .: :::. ...::::::.:: .:
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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