Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6006, 314 aa
1>>>pF1KE6006 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9498+/-0.000497; mu= 17.5532+/- 0.031
mean_var=100.2830+/-28.092, 0's: 0 Z-trim(107.9): 367 B-trim: 982 in 1/52
Lambda= 0.128074
statistics sampled from 15482 (15995) to 15482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 6.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1041 203.7 4e-52
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 849 168.2 1.9e-41
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 835 165.6 1.2e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 835 165.6 1.2e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 835 165.6 1.2e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 833 165.2 1.5e-40
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 813 161.5 1.9e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 801 159.3 9.2e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 794 158.0 2.2e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 789 157.1 4.2e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 782 155.8 1e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 780 155.5 1.4e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 775 154.5 2.5e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 770 153.6 4.8e-37
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 766 152.9 8.1e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 766 152.9 8.1e-37
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 755 150.8 3.3e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 742 148.4 1.7e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 720 144.4 2.9e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 525 108.3 2.1e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 477 99.5 9.7e-21
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 235 55.0 3.6e-07
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 235 55.0 3.8e-07
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 219 51.9 2.3e-06
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 216 51.3 3.6e-06
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 216 51.3 3.6e-06
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 216 51.4 3.6e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 215 51.1 3.7e-06
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 216 51.5 4.2e-06
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 216 51.5 4.2e-06
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 216 51.6 4.8e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 213 50.7 4.9e-06
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 216 51.6 5.1e-06
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 216 51.7 5.2e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 207 49.7 1.1e-05
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 206 49.4 1.2e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 205 49.2 1.3e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 205 49.2 1.3e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 205 49.3 1.4e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 205 49.3 1.4e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 205 49.3 1.5e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 205 49.4 1.6e-05
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 200 48.4 2.7e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 200 48.5 3e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 200 48.5 3.1e-05
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 200 48.5 3.2e-05
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 200 48.6 3.4e-05
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 198 48.1 3.7e-05
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 197 47.8 3.9e-05
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1061 init1: 1033 opt: 1041 Z-score: 1056.7 bits: 203.7 E(85289): 4e-52
Smith-Waterman score: 1041; 49.0% identity (79.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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NP_001 MENRN--NMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
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NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
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pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
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310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
: :
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTP
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pF1KE6 AFDRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFY
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pF1KE6 CDVPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILM-MLRSHTGEGRRKAI
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE6 STCTSHITVVTLHFVPCIYVYARP-FTALP-TDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE6 LAMRKLKRRLGQSERILIQ
: .:. :
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
:...:. .:::: . :.. :. :... :: . .. . . :. :: ::. :.. :.::
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: ::..:: : . : :: :... . :: .: .::..:.:::.::.:::. .: :
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pF1KE6 MRKLKRRLGQSERILIQ
..:. :.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 835; 40.9% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-305:1-308)
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pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
:. : . :.:: .::.... . ...::.:.. .:..:..::.::...:. .: ::::::
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pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE6 CTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPT--DTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE6 MRKLKRRLGQSERILIQ
..:. :.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 830 init1: 631 opt: 835 Z-score: 850.8 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 835; 40.9% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-305:11-318)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVT
:. : . :.:: .::.... . ...::.:.. .:..:..::.::...:.
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE6 DVFSLSVMAFDRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE6 PNVLDTFYCDVPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYT-VILMMLRSHT
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KE6 TLRNQEMKLAMRKLKRRLGQSERILIQ
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 815 init1: 576 opt: 833 Z-score: 848.9 bits: 165.2 E(85289): 1.5e-40
Smith-Waterman score: 833; 41.0% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
: ..::: . ::..::.... ::. .:: :....: :..::. ... . .:.::::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRS-HTGEGRRKAIST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTA--LPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 MRKLKRRLGQSERILIQ
. .. :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 812 init1: 601 opt: 813 Z-score: 829.0 bits: 161.5 E(85289): 1.9e-39
Smith-Waterman score: 813; 40.5% identity (73.9% similar) in 306 aa overlap (5-304:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE6 YFLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE6 FDRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE6 DVPQVLKLACTDTFTLELL---MISNNGLVSWFVFFFLLISYTVI-LMMLRSHTGEGRRK
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALV---IMISYGYIGISIMKITSAKGRSK
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pF1KE6 AISTCTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPT--DTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQE
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NP_001 AFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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300 310
pF1KE6 MKLAMRKLKRRLGQSERILIQ
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NP_001 IKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 786 init1: 579 opt: 801 Z-score: 816.9 bits: 159.3 E(85289): 9.2e-39
Smith-Waterman score: 801; 41.0% identity (73.3% similar) in 300 aa overlap (5-300:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQ-SRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE6 YFLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE6 FDRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE6 DVPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYT-VILMMLRSHTGEGRRKAIS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTA--ISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKL
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE6 AMRKLKRRLGQSERILIQ
:. .
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 643 init1: 528 opt: 794 Z-score: 810.1 bits: 158.0 E(85289): 2.2e-38
Smith-Waterman score: 794; 38.9% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (5-301:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
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pF1KE6 FLLRNLSILDI-CFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMA
.: .:...:: : .:: ::.: .:. .:::..::..:.:.: ::.. ...::
NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSII-PKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
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pF1KE6 FDRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYC
.:::.:: :::: :::.. :..:. . . ..: .. .:.. : :::::..: :.:
NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 DVPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYT-VILMMLRSHTGEGRRKAIS
..: .: :.:. . :... . .. :.. ::: .:. .:: .: ::.:::.:
NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 TCTSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTA--LPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKL
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NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
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300 310
pF1KE6 AMRKLKRRLGQSERILIQ
..::.
NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 806 init1: 591 opt: 789 Z-score: 805.0 bits: 157.1 E(85289): 4.2e-38
Smith-Waterman score: 789; 39.9% identity (74.7% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTG-EGRRKAIST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 CTSHITVVTLHFVPCIYVY---ARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKL
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTA-SVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKG
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NP_001 ALERLLSRADSCP
300 310
314 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:40:26 2016 done: Tue Nov 8 08:40:27 2016
Total Scan time: 6.030 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]