Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6006, 314 aa
1>>>pF1KE6006 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5665+/-0.00115; mu= 13.9205+/- 0.068
mean_var=132.0807+/-45.355, 0's: 0 Z-trim(102.4): 430 B-trim: 824 in 2/47
Lambda= 0.111598
statistics sampled from 6377 (6921) to 6377 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 2047 341.8 4e-94
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1677 282.3 3.4e-76
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1614 272.1 3.9e-73
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1427 242.0 4.5e-64
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1389 235.9 3.1e-62
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1373 233.3 1.8e-61
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1318 224.5 8.7e-59
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1149 197.2 1.3e-50
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1145 196.6 2.1e-50
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1141 196.0 3.3e-50
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1137 195.3 5.1e-50
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1136 195.2 5.7e-50
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1123 193.1 2.4e-49
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1112 191.3 8.3e-49
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1111 191.2 9.9e-49
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1100 189.4 3.4e-48
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1093 188.2 6.9e-48
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1090 187.8 9.7e-48
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1088 187.4 1.2e-47
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1085 186.9 1.7e-47
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1083 186.6 2.1e-47
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1081 186.3 2.6e-47
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1081 186.3 2.6e-47
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1077 185.6 4.1e-47
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1070 184.5 9e-47
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1061 183.1 2.6e-46
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1054 182.0 5.4e-46
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1052 181.6 6.7e-46
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1051 181.5 7.5e-46
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1049 181.1 9.4e-46
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1043 180.2 1.9e-45
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1041 179.9 2.3e-45
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1037 179.2 3.5e-45
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1036 179.1 4.1e-45
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1036 179.1 4.5e-45
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1032 178.4 6.2e-45
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1029 177.9 8.7e-45
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1029 177.9 8.7e-45
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1011 175.0 6.5e-44
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1010 174.9 7.3e-44
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1010 174.9 7.3e-44
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1010 174.9 7.3e-44
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1009 174.7 8.2e-44
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1005 174.1 1.3e-43
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1003 173.7 1.6e-43
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 987 171.2 9.8e-43
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 985 170.8 1.2e-42
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 950 165.2 5.9e-41
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 939 163.4 2e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 932 162.3 4.4e-40
>>CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2047 init1: 2047 opt: 2047 Z-score: 1803.3 bits: 341.8 E(32554): 4e-94
Smith-Waterman score: 2047; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
::::::::::::::
CCDS31 LKRRLGQSERILIQ
310
>>CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1673 init1: 1673 opt: 1677 Z-score: 1481.4 bits: 282.3 E(32554): 3.4e-76
Smith-Waterman score: 1677; 82.3% identity (93.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
:. : :::::: :::.:::.. : ::: :: :::::::.::.::::::::::.::::::
CCDS31 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
::::::.:::::::: ::::::.::::. ::::...:.::.:.::::::::.::::::::
CCDS31 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
: :.::::::::.::::::.::.:: :::.:::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
:::::::.:::::.::.:::::::::. . :.:::.::::::: :::..: :::::::::
CCDS31 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
:::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::.:::::::::: :::.
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
::::: :::
CCDS31 LKRRLVPSERE
310
>>CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1605 init1: 1605 opt: 1614 Z-score: 1426.5 bits: 272.1 E(32554): 3.9e-73
Smith-Waterman score: 1614; 79.4% identity (91.6% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
:...: :::::: :::.::.::.: ::: ::.:::.:::.::.::::::::::.::::::
CCDS53 MEMENCTRVKEFIFLGLTQNREVSLVLFLFLLLVYVTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
:::.:::: ::::::::.::::.::::: :::::. : ::::.:::.::.:::::::::.
CCDS53 FLLHNLSIADICFSSITVPKVLVDLLSERKTISFNHCFTQMFLFHLIGGVDVFSLSVMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
:::.:::::::: ::::: .: :: ::.:.:::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYVAISKPLHYATIMSRDHCIGLTVAAWLGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
: .::::: :: : :::::::::::.. . ::.::.:: ::: . .:..:::::::::::
CCDS53 VHRVLKLAHTDIFILELLMISNNGLLTTLWFFLLLVSYIVILSLPKSQAGEGRRKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
:::::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::.::::::.::: :::.
CCDS53 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPMDKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNHEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
::::: :.:
CCDS53 LKRRLVPSDRK
310
>>CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1427 init1: 1427 opt: 1427 Z-score: 1263.8 bits: 242.0 E(32554): 4.5e-64
Smith-Waterman score: 1427; 68.0% identity (88.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
::: :.: :::: :: .:.:::: ::. .: ::..:..:: ::.::.::::.::::::
CCDS31 MDQINHTNVKEFFFLELTRSRELEFFLFVVFFAVYVATVLGNALIVVTITCESRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
::::: :.::: :::::.:: :.::::. ::::.. :..:.::::. ::::.: :::::.
CCDS31 FLLRNKSVLDIVFSSITVPKFLVDLLSDRKTISYNDCMAQIFFFHFAGGADIFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
:::.::.:::::.:.: . ..:.:::::.: .::: :. :.::.::::::.::.:::
CCDS31 DRYLAIAKPLHYVTMMRKEVWVALVVASWVSGGLHSIIQVILMLPFPFCGPNTLDAFYCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
: ::.::::::::.:::.::::::::. . :..:: ::::::.:::::.:::: ::.:::
CCDS31 VLQVVKLACTDTFALELFMISNNGLVTLLWFLLLLGSYTVILVMLRSHSGEGRNKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
:::. :::::::::.:.: ::: .:: ::.::.. :::.:.::::::.::::::: ::..
CCDS31 TSHMLVVTLHFVPCVYIYCRPFMTLPMDTTISINNTVITPMLNPIIYSLRNQEMKSAMQR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
:.:::: ::
CCDS31 LQRRLGPSESRKWG
310
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1421 init1: 1357 opt: 1389 Z-score: 1230.8 bits: 235.9 E(32554): 3.1e-62
Smith-Waterman score: 1389; 63.9% identity (90.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
:. .: :.:. :..::..:..::.. :: ...:::.::..::.::::::: . .::::::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
::::::...:.:.:..:.::.:.:.: ::::::..::..:.::::::::. :: :::::.
CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
:::::::.::.:.:::. :.::.::.:::::::::.:..:.:::::::::.::.::::
CCDS42 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
:::::.:::::: ::.:::::.::. . :..:::::::::.:::::.:..:::: :::
CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
:.:: ::.. :.::::.:. ::: . : :.:...::..:.:::.:::::::.:: :::.
CCDS42 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LKRRLGQSERILIQ
: . :
CCDS42 LGKCLVICRE
310
>>CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 (307 aa)
initn: 1371 init1: 1345 opt: 1373 Z-score: 1216.9 bits: 233.3 E(32554): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 1373; 65.0% identity (87.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
:. : : :..:.:::..:.:::.. :: ....::.::.:::.::..::: .:.::::::
CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 ASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMKK
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CCDS31 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
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CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
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CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
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CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]