FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6005, 314 aa
1>>>pF1KE6005 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8236+/-0.00123; mu= 12.7667+/- 0.072
mean_var=183.3399+/-66.496, 0's: 0 Z-trim(102.2): 365 B-trim: 413 in 1/45
Lambda= 0.094721
statistics sampled from 6406 (6845) to 6406 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 2057 294.4 7.4e-80
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1874 269.4 2.5e-72
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1140 169.1 3.9e-42
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1133 168.2 7.5e-42
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1132 168.0 8.3e-42
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1124 167.0 1.8e-41
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1118 166.2 3.2e-41
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1109 164.9 7.4e-41
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1091 162.5 4.1e-40
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1086 161.8 6.6e-40
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1084 161.5 7.9e-40
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1079 160.8 1.3e-39
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1074 160.1 2e-39
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1074 160.1 2.1e-39
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1071 159.7 2.7e-39
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1071 159.7 2.7e-39
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1070 159.6 2.9e-39
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1063 158.6 5.8e-39
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1056 157.7 1.1e-38
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1056 157.7 1.1e-38
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1048 156.6 2.5e-38
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1047 156.4 2.6e-38
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1041 155.6 4.6e-38
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1039 155.4 5.7e-38
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1031 154.3 1.2e-37
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1028 153.8 1.6e-37
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1026 153.6 2e-37
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1014 151.9 5.9e-37
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1011 151.5 7.9e-37
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1004 150.6 1.6e-36
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 996 149.5 3.3e-36
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 996 149.5 3.3e-36
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 984 147.8 1e-35
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 972 146.2 3.2e-35
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 954 143.7 1.7e-34
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 936 141.3 9.7e-34
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 914 138.3 8.2e-33
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 913 138.1 8.6e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 896 135.9 4.5e-32
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 851 129.7 3e-30
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 846 129.0 4.8e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 842 128.5 7.7e-30
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 836 127.6 1.2e-29
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 812 124.3 1.2e-28
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 798 122.4 4.6e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 785 120.6 1.6e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 760 117.2 1.7e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 748 115.6 5.3e-26
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 684 106.8 2.2e-23
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 651 102.3 5.1e-22
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2057 init1: 2057 opt: 2057 Z-score: 1547.2 bits: 294.4 E(32554): 7.4e-80
Smith-Waterman score: 2057; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IRESILGVFPRKDM
::::::::::::::
CCDS31 IRESILGVFPRKDM
310
>>CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1897 init1: 1871 opt: 1874 Z-score: 1412.0 bits: 269.4 E(32554): 2.5e-72
Smith-Waterman score: 1874; 90.8% identity (96.2% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
: :::: :::..::::::::::::: :::::::.:::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 MLPSNITSTHPAVFLLVGIPGLEHLHAWISIPFCFAYTLALLGNCTLLFIIQADAALHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
:::::::::.:::::::..::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 MYLFLAMLATIDLVLSSTTLPKMLAIFWFRDQEINFFACLVQMFFLHSFSIMESAVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY
::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 AFDRYVAICKPLHYTTVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRRFHYCRGPVIAHCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::: :::::::::::
CCDS31 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLFVILSYVFILQAVLQLASQEARYKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
:::::::::::. :: ::::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 GTCVSHIGAILSTYTPVVISSVMHRVARHAAPRVHILLAIFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IRESILGVFPRKDM
::: .:..: ::.:
CCDS31 IREYVLSLFQRKNM
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1146 init1: 791 opt: 1140 Z-score: 869.9 bits: 169.1 E(32554): 3.9e-42
Smith-Waterman score: 1140; 53.7% identity (81.2% similar) in 309 aa overlap (1-309:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAA
::.:: : ::..:::.:::::: .::::..:: ..: .::::: .::..::.. .
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAV
:::::: ::::: .::: ::....::::.:::: .::.: .::..:::.: :. ::: :
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVI
:.:::::::.::::::.:: .::...:. :. :: :.. ...:: ::: . .: .:
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
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180 190 200 210 220 230
pF1KE6 AHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEAR
: :::::...::::.. . : .:.. . ...::..:.::::. :: ::. : : :::
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEAR
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 YKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGV
::..:: ::::.::::.: . .: . :: ... ..::.:::.:.. :: .::.::::
CCDS31 LKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KTKQIRESILGVFPRKDM
.:::::: .: .:
CCDS31 RTKQIRERVLRIFLKTNH
300 310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1177 init1: 791 opt: 1133 Z-score: 864.8 bits: 168.2 E(32554): 7.5e-42
Smith-Waterman score: 1133; 51.0% identity (81.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
: : .. ::..:.:.:::::: .:.::: ::: .: .::::: :.::.:... .:.::
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
:. :::.:..:::.::....:.::.:::: .:::. ::.::::..:.:. ::. :::::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRGPVIAHCY
:::::::.: ::::. .::..... :.: : : : : :. .:. . .:.. .::: :
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF
::::....:.::. .:.:::. :. :.: :.:.:. .::..::.::. : :..:. ::.
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV-LNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKAL
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
.:: .:.:.: .:: :.: . :: ... ..:::.::.::..:: .:::::::.:::
CCDS31 STCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQ
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IRESILGVFPRKDM
::: .: :: .:
CCDS31 IRERVLYVFTKK
300 310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1146 init1: 1127 opt: 1132 Z-score: 864.0 bits: 168.0 E(32554): 8.3e-42
Smith-Waterman score: 1132; 53.4% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (2-309:9-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQA
:.:... : ::: ::::::..:::::::.:. : ... ::::.:.::..
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSAT----FLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 DAALHEPMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIME
. .:::::::::.::: ::: :: .:: .:.::: :::. ::.::.::.: ::..:
CCDS31 ERSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SAVLLAMAFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHYCRG
:.:::.:::::.::::.::::...::...: .::.....:.:.:. ::::.:. : :: .
CCDS31 SSVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQ
::..: :: :. :..:::.: . :.:::. : . : .: ::...:: .::..:: .::.
CCDS31 PVLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 EARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPH-VHILLANFYLLFPPMVNPI
:.::..:::::: :.: ::: .. ::.:: ...: :: :..... .::::::..:::
CCDS31 AERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQA-PHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPI
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 IYGVKTKQIRESILGVFPRKDM
.:.:::::::. . .:
CCDS31 VYSVKTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1138 init1: 605 opt: 1124 Z-score: 858.1 bits: 167.0 E(32554): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 1124; 51.5% identity (82.6% similar) in 305 aa overlap (11-314:11-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
:..: :.:::::: ::.:.:::: : .:..:: :.: ... . .::.:
CCDS31 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
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CCDS31 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
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CCDS31 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
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300 310
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CCDS31 QIRESLLQI-PRIEMKIR
310
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CCDS44 NVTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAIDLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQM
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CCDS44 LLGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHI
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CCDS44 LQAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHHVPHHVHVLLATRYL
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CCDS44 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
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CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
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CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHT
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CCDS31 YCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHKA
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CCDS31 LSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGART
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pF1KE6 KQIRESILGVFPRKDM
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CCDS31 KEIRSRLLKLLHLGKTSI
310
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CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSILIVVIVMERNLHVP
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CCDS53 MYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAM
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CCDS53 AFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSY
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CCDS53 CEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKAL
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CCDS53 IREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
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CCDS77 MSSCN--FTHAT-FVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAP
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CCDS77 CVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]