Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6003
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6003, 314 aa
1>>>pF1KE6003 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5561+/-0.00124; mu= 9.1842+/- 0.072
mean_var=207.7960+/-72.623, 0's: 0 Z-trim(103.1): 401 B-trim: 428 in 1/46
Lambda= 0.088972
statistics sampled from 6728 (7238) to 6728 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 2066 278.8 3.9e-75
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1316 182.5 3.7e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1311 181.9 5.8e-46
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1275 177.2 1.4e-44
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1217 169.8 2.5e-42
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1205 168.2 7.2e-42
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1187 166.0 3.7e-41
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1184 165.6 4.7e-41
CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 ( 323) 1178 164.8 8.1e-41
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1140 159.9 2.3e-39
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1130 158.6 5.7e-39
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1125 158.0 9e-39
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1125 158.0 9e-39
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1112 156.3 2.8e-38
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1111 156.2 3.1e-38
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1104 155.3 5.8e-38
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1096 154.3 1.2e-37
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1095 154.1 1.3e-37
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1091 153.6 1.8e-37
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1077 151.8 6.3e-37
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1077 151.8 6.4e-37
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1077 151.8 6.5e-37
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1058 149.5 3.7e-36
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1056 149.2 4.3e-36
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1055 149.1 4.8e-36
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1052 148.6 5.8e-36
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1034 146.3 2.9e-35
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1031 145.9 3.8e-35
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1029 145.7 4.6e-35
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1027 145.4 5.4e-35
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1027 145.4 5.5e-35
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1023 144.9 7.8e-35
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1012 143.5 2.1e-34
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 998 141.7 7.2e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 958 136.5 2.5e-32
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 955 136.1 3.3e-32
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 953 135.9 3.9e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 949 135.4 5.6e-32
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 947 135.1 6.7e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 946 135.0 7.6e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 939 134.1 1.4e-31
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 939 134.1 1.4e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 936 133.7 1.8e-31
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 935 133.6 2e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 933 133.3 2.3e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 931 133.1 2.8e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 930 132.9 3e-31
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 925 132.4 5e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 923 132.0 5.6e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 922 131.9 6.2e-31
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 2066 init1: 2066 opt: 2066 Z-score: 1462.4 bits: 278.8 E(32554): 3.9e-75
Smith-Waterman score: 2066; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
::::::::::::::
CCDS11 LSRVIHQKKTFFSL
310
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1350 init1: 1299 opt: 1316 Z-score: 942.1 bits: 182.5 E(32554): 3.7e-46
Smith-Waterman score: 1316; 61.3% identity (86.9% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
: .::.:.:.::::::::.:::: . ..:::.:::::.::::::..::.::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
.:::.:...:. :::::.::.:..:... :: : .:..:::::..: ::.:::...:::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
::::::: :::::.:: ::. :::.::.:. .. ::::..:: ::: :.::: :::
CCDS35 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
..:::::. :: .:: :.: .: .....::. :: ::. : ..::.:::.::: ::.::
CCDS35 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
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CCDS35 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
:.... .. ::::
CCDS35 LGKLF-SRATFFSW
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1365 init1: 1307 opt: 1311 Z-score: 938.7 bits: 181.9 E(32554): 5.8e-46
Smith-Waterman score: 1311; 62.5% identity (87.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
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CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
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CCDS35 FFLSHLALTDISLSSVTVPKMLLSMQTQDQSILYAGCVTQMYFFIFFTDLDNFLLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
::::::: ::.::.::. :: ::..::.:. .:. ::::.:.: :::::.:::::::
CCDS35 DRYVAICHPLRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCADNTIPHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
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CCDS35 LVALLKLSCSDISLNELVIFTVGQAVITLPLICILISYGHIGVTILKAPSTKGIFKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
::::::::::.:::.::::. :...:. ::.. ..::::.::.::::::::::::.:::
CCDS35 CGSHLSVVSLYYGTIIGLYFLPSSSASSDKDVIASVMYTVITPLLNPFIYSLRNRDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
: :....
CCDS35 LERLFNRATVLSQ
310
>>CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 (322 aa)
initn: 1331 init1: 1270 opt: 1275 Z-score: 913.6 bits: 177.2 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 1275; 59.3% identity (86.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
: .::.:.:.::::::::.:::: . .::::.:::::.::::::..::.::::::::::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFALFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
.:::.:...:. :::::.::.:.:::.: .. : :..: :::..:.::.:::...:::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
::::::: ::::..::. :. ::: :::.. :.:::::.:.: ::::..:::.:::
CCDS35 DRYVAICHPLHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCADHIIPHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
..:::::. ::: .:. .:: . ...::: :: ::..: .::..::.::::::.::
CCDS35 LGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPSTKGICKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
::::::::...: :.::::. ..... :. . ...::.::::::::::::::.:.:::
CCDS35 CGSHLSVVTIYYRTIIGLYFLPPSSNTNDKNIIASVIYTAVTPMLNPFIYSLRNKDIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
: ...
CCDS35 LRKLLSRSGAVAHACNLNTLGG
310 320
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1250 init1: 1205 opt: 1217 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(32554): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 1217; 58.7% identity (83.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
: : ::.:.:.:::::: ::.::.: ...::.:::.:.:::::::. . .:: ::::::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
.::::::: :.::: .:.::.: : . .: . ::::::: ..: :...:::..:::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
:..::.: :::::: :. .:: ::: ::.......::::::: : :::::.: :::::
CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
.. ::::. :::..:: .:. :.:... ::: ::.:: .:. ..:::::.:: :::::
CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKGA
:::::.:: :::.:.:..:. .. :. :::. ...:::::::::::::::::: .:::
CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
:..:.
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1255 init1: 1203 opt: 1205 Z-score: 865.2 bits: 168.2 E(32554): 7.2e-42
Smith-Waterman score: 1205; 57.0% identity (81.3% similar) in 305 aa overlap (4-308:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
.::.:::.:.: :. ::::. ...:: :::.:: ::::::. : : :::::::
CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNLLIILAIGSDLHLHTPMY
10 20 30 40 50
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CCDS68 FFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYFFLMFGDLDSFFLAAMAY
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CCDS68 DRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLMARLSFCVTGEIAHFFCD
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CCDS68 ITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVPAILRVRTRGGVGKAFST
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CCDS68 CSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTPMLNPFIYSLRNKDMKGA
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310
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:.:.. ..
CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
300 310
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90 100
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CCDS35 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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CCDS35 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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CCDS35 TRVAFCAQKAIPHFYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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CCDS35 AVFVISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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290 300 310
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CCDS35 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
310 320 330
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
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CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
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CCDS32 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
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pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
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CCDS32 DRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCD
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CCDS32 LTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFST
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CCDS32 CSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGA
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310
pF1KE6 LSRVIHQKKTFFSL
: .....: :
CCDS32 LRKLVNRKITSSS
310
>>CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 (323 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
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CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
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CCDS11 DRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD
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:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS11 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
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CCDS11 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
310 320
>>CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 (313 aa)
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CCDS11 MEGKNLTSISECFLLGFSEQLEEQKPLFGSFLFMYLVTVAGNLLIILVIITDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
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CCDS11 FFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQAISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAY
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pF1KE6 DRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCD
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CCDS11 DCYVAICHPLHYILIMSPGLCIFLVSASWIMNALHSLLHTLLMNSLSFCANHEIPHFFCD
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pF1KE6 MSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFST
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CCDS11 INPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLICVLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFST
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CCDS11 LRKLIWVRKIHSP
310
314 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]