FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6002, 314 aa
1>>>pF1KE6002 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7640+/-0.00126; mu= 12.8480+/- 0.073
mean_var=164.4554+/-58.910, 0's: 0 Z-trim(102.4): 369 B-trim: 818 in 2/45
Lambda= 0.100012
statistics sampled from 6434 (6938) to 6434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 2083 313.6 1.3e-85
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CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1209 187.5 1.2e-47
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CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1197 185.7 3.9e-47
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1190 184.7 7.9e-47
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1187 184.3 1.1e-46
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1185 184.0 1.3e-46
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1166 181.3 8.8e-46
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CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1158 180.1 2e-45
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1141 177.7 1.1e-44
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1138 177.2 1.5e-44
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1133 176.5 2.4e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1132 176.3 2.6e-44
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1112 173.5 1.9e-43
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CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1087 169.9 2.4e-42
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1055 165.3 5.9e-41
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 1050 164.6 1e-40
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1038 162.8 3.2e-40
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CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 969 152.9 3.3e-37
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 958 151.2 9.5e-37
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 949 149.9 2.3e-36
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 940 148.7 5.8e-36
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CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 824 132.0 6.7e-31
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 809 129.8 2.9e-30
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 805 129.2 4.2e-30
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 781 125.7 4.7e-29
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 771 124.4 1.4e-28
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 769 124.0 1.5e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 761 122.8 3.4e-28
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 750 121.2 1e-27
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 724 117.5 1.4e-26
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 600 99.6 3.4e-21
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 582 97.0 2.1e-20
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 581 96.8 2.2e-20
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2083 init1: 2083 opt: 2083 Z-score: 1650.5 bits: 313.6 E(32554): 1.3e-85
Smith-Waterman score: 2083; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
::::::::::::::
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1279 init1: 1279 opt: 1292 Z-score: 1033.7 bits: 199.4 E(32554): 3e-51
Smith-Waterman score: 1292; 59.3% identity (86.9% similar) in 305 aa overlap (8-312:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
:.:..: :.: :.:::: .: :.:: .:. :::.. :: ::: .: : ::
CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
:.::: :.:.::. :::.:: ::::.:...:. : ::. .::.::::::: :.:::::::
CCDS31 HQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
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CCDS31 LAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
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CCDS31 HAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
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CCDS31 KALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
::::: . : :
CCDS31 TKQIRLGILHKFVLRRRF
300 310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1209; 58.1% identity (83.9% similar) in 298 aa overlap (15-312:10-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
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CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSL
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pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
::::: :::::.. :...:. :::::: : ..::.:. :::. :.:.:: ::..::..:
CCDS31 HEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGIL
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pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
:.:.:::.:::: ::.:...::. ::. .:: . .:: .:::::..::.: : : :::
CCDS31 LAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLS
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pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
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CCDS31 HSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERL
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pF1KE6 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
:::::::::: ::: ::.::::.:..:::::..: ..:.:. .::. :::.::..::.:
CCDS31 KALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
::.:: . . :
CCDS31 TKEIRRAIFRMFHHIKI
300 310
>>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa)
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Smith-Waterman score: 1209; 56.4% identity (83.9% similar) in 305 aa overlap (8-312:2-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
.: . . :::.: ::::::. :.:...:: ::.:.. ::: ..::..:::::
CCDS77 MSSCNFTHATFVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSL
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pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
: :::::: ::: :::.:: :.: .:..:: .:::: .::..:.:::: .: .::..:
CCDS77 HAPMYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTIL
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pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
:.:::::.:::::::.....:.::: ..::.:.. :. ..::::...::. .: : :::
CCDS77 LAMAFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
::::.::.::::: :: : .::. .:. ..:.: ..: .:: ::.::::.. :..::
CCDS77 HSYCVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERA
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pF1KE6 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
::..:::::: .:: ::.:.:::::.::::.. .:.:::: .:::.:::.:::.:..:
CCDS77 KAFGTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
::::: :: :
CCDS77 TKQIRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
300 310 320
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
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Smith-Waterman score: 1197; 60.2% identity (81.2% similar) in 309 aa overlap (5-313:2-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
:. :.: .::.: :.:::: :::::::.: :::..: :: ::::::::: ::
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSL
10 20 30 40 50
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pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
::::: ::::::. :::::: .:::::.:: .: ::: .::::: :::: :: ::::::
CCDS31 HEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
: :.::::.:: .::.:.::::.. ...::.: .:. :..:.:: :. . :: . ::
CCDS31 LIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLS
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
:::::::.::::::.: . . :::.: . . .: .:: ::.:::.:::.:::. :..
CCDS31 HSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
:::::::::::::..:: :.:.:.:.:::.... :..:.:. . :: ::. ::::: ::
CCDS31 KALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
::::: ::. .:
CCDS31 TKQIRVRVVAKLCQRKI
300 310
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1202 init1: 823 opt: 1190 Z-score: 954.2 bits: 184.7 E(32554): 7.9e-47
Smith-Waterman score: 1190; 60.6% identity (84.2% similar) in 292 aa overlap (17-308:12-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
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CCDS31 MSVLNNSEVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
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CCDS31 HEPMYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
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CCDS31 LIMSLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
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CCDS31 HSYCLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTM-LDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERL
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
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CCDS31 KALNTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
:.:: ...
CCDS31 TRQIWEKILGKLLNVCGR
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FIIKTERSLHEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHC
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CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
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CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
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CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SIASRAERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPV
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CCDS31 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
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300 310
pF1KE6 MNPIVYSVKTKQIRDRVTHAFCY
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CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
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pF1KE6 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
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CCDS31 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNL
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CCDS31 HEPMYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGIL
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pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
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CCDS31 LAMAYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLS
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pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
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CCDS31 HAFCLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERA
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CCDS31 KALITCVSHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVK
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310
pF1KE6 TKQIRDRVTHAFCY
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CCDS31 TKQIQNAILHLFTTHRIGT
300 310
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSL
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CCDS31 HGPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACFAQEFFIHGFSVLESSVL
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pF1KE6 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
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CCDS31 LIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRSLRYCKKNQLS
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pF1KE6 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
:::::::.::::::.: . . :::.: . . .: .:: ::.:::.:: .:::. :..
CCDS31 HSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVPGIASKKEEL
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CCDS31 TKQIRVRVVAKLCQWKI
300 310
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CCDS31 MLPSNITSTHPAVFLLVGIPGLEHLHAWISIPFCFAYTLALLGNCTLLFIIQADAAL
10 20 30 40 50
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CCDS31 HEPMYLFLAMLATIDLVLSSTTLPKMLAIFWFRDQEINFFACLVQMFFLHSFSIMESAVL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]