Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5996
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5996, 314 aa
1>>>pF1KE5996 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7322+/-0.000613; mu= 19.1720+/- 0.038
mean_var=98.5320+/-25.546, 0's: 0 Z-trim(105.4): 283 B-trim: 814 in 1/47
Lambda= 0.129207
statistics sampled from 13226 (13596) to 13226 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.48), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 5.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1051 207.3 3.2e-53
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1005 198.8 1.2e-50
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 952 188.9 1.2e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 952 188.9 1.2e-47
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 952 188.9 1.2e-47
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 935 185.7 1e-46
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 930 184.8 2e-46
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 902 179.6 7.5e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 902 179.6 7.5e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 902 179.6 7.5e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 883 176.0 8.5e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 855 170.8 3.2e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 823 164.8 2e-40
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 814 163.2 6.4e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 803 161.1 2.7e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 801 160.7 3.4e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 801 160.7 3.4e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 788 158.3 1.9e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 779 156.6 5.8e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 754 152.0 1.5e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 544 112.8 9.2e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 492 103.1 7.6e-22
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 198 48.4 2.7e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 198 48.4 2.7e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 195 47.8 3.4e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 195 47.8 3.7e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 186 46.2 0.00012
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 179 44.8 0.00029
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 179 44.9 0.00031
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 178 44.6 0.00032
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 179 44.9 0.00032
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 176 44.4 0.0005
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 176 44.5 0.00055
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 174 43.9 0.00056
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 174 44.0 0.00058
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 174 44.0 0.00063
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 169 43.0 0.0011
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 169 43.1 0.0012
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 168 42.9 0.0013
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 168 43.0 0.0015
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 168 43.0 0.0015
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 166 42.4 0.0015
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 164 42.0 0.002
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 164 42.2 0.0024
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 164 42.2 0.0024
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 161 41.5 0.0029
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 160 41.4 0.0037
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 160 41.4 0.0039
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 160 41.4 0.0039
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 160 41.4 0.0039
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1072 init1: 1021 opt: 1051 Z-score: 1076.4 bits: 207.3 E(85289): 3.2e-53
Smith-Waterman score: 1051; 50.6% identity (78.6% similar) in 308 aa overlap (2-309:4-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
.: : .:.:.::::.. :::. ::. : :: .:..::::.:.:: :: ::.:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::.:::.:: : :...:: ..: .: : :.::. .: :::.:...::.: :.. :::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:::::.:.:: :. :. :: ..: :.. :.:: ..:. . ::::: :: .::::::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLST
: .. ::::: ..: . ... :: .::::: ::......:..:::. .. .::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
::::. :. .::.: :. ::.::::.:.. ::.: ::::.::::::::.::::.::::.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FKKVVEKAKLSVGWSV
. .:. . . :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1018 init1: 997 opt: 1005 Z-score: 1030.1 bits: 198.8 E(85289): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 1005; 50.0% identity (78.5% similar) in 302 aa overlap (3-303:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNP
: : ::.:::::. . :::. ::. : .: : :.::.:...:: : :..:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASM
:::::::::.::.:: : ..: ....:: :.: ::: .:: :.:.: .:: .:...::.:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFF
:::::.:.:.:: ::..:. .: :: . ::: : ... .::. .: :..: .: ..:::
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDIPAVMVLSCSDRHISELVL-IYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKP
::.: .. :::.: :.: .: : : .: : ...:.::: ::....::..: : .:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEI-ICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEV
.::::::. .: :. ::..:.: .:: .: .:::. ::::. ::.::::.::::::.:
NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KSAFKKVVEKAKLSVGWSV
:.: .::.
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 976.7 bits: 188.9 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 952; 46.4% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
:.. :..:.::::. . . : ::. : .:. :..::: ::. . :::::.:::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::::::.::.:.: ...: ..:. ..: ..::. .: .:::. :. ..:.::: :::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:...:::.:::::. :: .:: :. : .. . ::. .:: :::: .: . :::::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLST
. .. ::::: :..:.... .. .. .: :: :: : :.::. :.. : .::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
:.::. .: .::.::: .:..: :::: . : :: :.::.: :::::..:::::. .:.:
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FKKVVEKAKLSVGWSV
.:::: .. .::
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 976.7 bits: 188.9 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 952; 46.4% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
:.. :..:.::::. . . : ::. : .:. :..::: ::. . :::::.:::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::::::.::.:.: ...: ..:. ..: ..::. .: .:::. :. ..:.::: :::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:...:::.:::::. :: .:: :. : .. . ::. .:: :::: .: . :::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLST
. .. ::::: :..:.... .. .. .: :: :: : :.::. :.. : .::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
:.::. .: .::.::: .:..: :::: . : :: :.::.: :::::..:::::. .:.:
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FKKVVEKAKLSVGWSV
.:::: .. .::
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 976.5 bits: 188.9 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 952; 46.4% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (3-310:15-322)
10 20 30 40
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIF
:.. :..:.::::. . . : ::. : .:. :..::: ::. .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 WDSCLHNPMYFFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATV
:::::.::::::::::.::.:.: ...: ..:. ..: ..::. .: .:::. :. .
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ENYLLASMAYDRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCK
.:.::: ::::...:::.:::::. :: .:: :. : .. . ::. .:: ::::
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SNEVHHFFCDIPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHS
.: . :::::. .. ::::: :..:.... .. .. .: :: :: : :.::. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ASVYQKPLSTCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVY
.. : .:::.::. .: .::.::: .:..: :::: . : :: :.::.: :::::..:
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 SLRNKEVKSAFKKVVEKAKLSVGWSV
::::. .:.:.:::: .. .::
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 953 init1: 931 opt: 935 Z-score: 959.6 bits: 185.7 E(85289): 1e-46
Smith-Waterman score: 935; 45.5% identity (77.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPM
: ::.: :::::... .. :: : ::: .:. ::..:::: :: ::.::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMA
::::::::..: :: :...: .....: :...:.. .: :..:: ... :. :...::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFC
::::::.:.:: :.. :. :.:. ...:.:. :. . .. : ..: :: :: ..::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLS
:.: ...:::.: . ... .. : . . :::.::: .: :.:.:. ::. .: ..
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
:::::. ::..:: . ::.::. ::. : . :..: ::::.::::::::.:::::::.:.
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 AFKKVVEKAKLSVGWSV
:.:.. ..
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 992 init1: 929 opt: 930 Z-score: 954.5 bits: 184.8 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 930; 44.9% identity (76.4% similar) in 301 aa overlap (3-303:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHN
: . :::.:..: .:.: .:.. ..:..::.::: ::.: . :: ::.
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLAS
::::::::::..:.::... : ..... .:.::: .: :.:. .:..:.: ::.
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAYDRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHF
:.::::::::.:::::. : : ::..:.. :: :...:.. :: . .: .: ::
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCDIPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKP
::..::.. ::: : :..::.:. . :. ..: :..:: :: : .::.:.:.. ::
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEV
..::..:..::..:. . ::::: :..:.: :. .:::.: : ::::.:.:::: :
NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KSAFKKVVEKAKLSVGWSV
..: :...
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 902 init1: 877 opt: 902 Z-score: 926.2 bits: 179.6 E(85289): 7.5e-45
Smith-Waterman score: 902; 45.9% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
.:.: :..::::::..: . .: ::. : .:..:..:: :..:: :: ::.:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::.:::::: :...:.: ..: :: : :.: ...::::... .:.. .: ::: :::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:::.::: :.:.. : .:::::: :.. ::... ..:. ::.: .:... . :. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIA-LLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLS
. ::. :.: : .: : :.: :. .... . ..:.:: :. ::::..: .: .
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
:::::. .:.. ::. :: :.:: :: :. .:. :::... :::::..:::::::::.
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AFKKVVEKAKLSVGWSV
:..:.. :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 902 init1: 877 opt: 902 Z-score: 926.2 bits: 179.6 E(85289): 7.5e-45
Smith-Waterman score: 902; 45.9% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
.:.: :..::::::..: . .: ::. : .:..:..:: :..:: :: ::.:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::.:::::: :...:.: ..: :: : :.: ...::::... .:.. .: ::: :::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:::.::: :.:.. : .:::::: :.. ::... ..:. ::.: .:... . :. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIA-LLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLS
. ::. :.: : .: : :.: :. .... . ..:.:: :. ::::..: .: .
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
:::::. .:.. ::. :: :.:: :: :. .:. :::... :::::..:::::::::.
NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AFKKVVEKAKLSVGWSV
:..:.. :
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 902 init1: 877 opt: 902 Z-score: 926.2 bits: 179.6 E(85289): 7.5e-45
Smith-Waterman score: 902; 45.9% identity (76.7% similar) in 305 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMY
.:.: :..::::::..: . .: ::. : .:..:..:: :..:: :: ::.:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAY
:::.:::::: :...:.: ..: :: : :.: ...::::... .:.. .: ::: :::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCD
:::.::: :.:.. : .:::::: :.. ::... ..:. ::.: .:... . :. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPAVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIA-LLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLS
. ::. :.: : .: : :.: :. .... . ..:.:: :. ::::..: .: .
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
:::::. .:.. ::. :: :.:: :: :. .:. :::... :::::..:::::::::.
XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AFKKVVEKAKLSVGWSV
:..:.. :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
314 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:36:53 2016 done: Tue Nov 8 08:36:54 2016
Total Scan time: 5.820 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]