Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5994, 314 aa
1>>>pF1KE5994 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8537+/-0.00129; mu= 12.6792+/- 0.075
mean_var=150.8997+/-53.701, 0's: 0 Z-trim(101.3): 363 B-trim: 418 in 1/46
Lambda= 0.104407
statistics sampled from 6041 (6468) to 6041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 2026 317.9 6.2e-87
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1261 202.7 3e-52
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 1152 186.3 2.6e-47
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1110 180.0 2.1e-45
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1099 178.3 6.7e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1093 177.4 1.2e-44
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1065 173.2 2.3e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1060 172.5 4e-43
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1056 171.8 6e-43
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1050 170.9 1.1e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1047 170.5 1.6e-42
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1045 170.2 1.9e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1044 170.0 2.1e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1040 169.4 3.2e-42
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1038 169.2 4.3e-42
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1036 168.8 4.8e-42
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1030 167.9 9e-42
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1030 167.9 9e-42
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1027 167.5 1.2e-41
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1023 166.9 2e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1022 166.7 2.1e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1022 166.7 2.1e-41
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1021 166.6 2.4e-41
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1019 166.3 3.1e-41
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1017 166.0 3.6e-41
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 1016 165.8 4e-41
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1011 165.1 6.6e-41
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1005 164.1 1.2e-40
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1004 164.0 1.4e-40
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 998 163.1 2.6e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 996 162.8 3.2e-40
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 993 162.3 4.3e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 990 161.9 5.9e-40
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 989 161.7 6.4e-40
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 989 161.7 6.6e-40
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 987 161.4 8e-40
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 987 161.4 8.1e-40
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 985 161.1 9.9e-40
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 983 160.8 1.2e-39
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 983 160.8 1.2e-39
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 981 160.5 1.5e-39
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 976 159.8 2.5e-39
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 976 159.8 2.5e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 976 159.8 2.7e-39
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 976 159.9 2.8e-39
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 973 159.3 3.5e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 969 158.7 5.3e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 967 158.4 6.6e-39
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 958 157.1 1.7e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 958 157.1 1.7e-38
>>CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2026 init1: 2026 opt: 2026 Z-score: 1674.2 bits: 317.9 E(32554): 6.2e-87
Smith-Waterman score: 2026; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FRKVARRLQVSLSM
::::::::::::::
CCDS31 FRKVARRLQVSLSM
310
>>CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1261 init1: 1261 opt: 1261 Z-score: 1051.4 bits: 202.7 E(32554): 3e-52
Smith-Waterman score: 1261; 63.0% identity (86.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
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CCDS31 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
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CCDS31 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
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pF1KE5 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
:::.:. .::::.. .. . :.::.:::: : .:..::. .:::::: .:.:::.:::
CCDS31 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
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pF1KE5 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
:::::::.:.:. . :.::: :. ::. : :::.:::.:: .::...:.:::::::::
CCDS31 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
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CCDS31 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FRKVARRLQVSLSM
::
CCDS31 TRKALSKSKPARRP
310
>>CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1165 init1: 811 opt: 1152 Z-score: 962.7 bits: 186.3 E(32554): 2.6e-47
Smith-Waterman score: 1152; 55.9% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
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CCDS31 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
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pF1KE5 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
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CCDS31 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
::: :. .::::.. .. . :::.:::: :. .:..::. .:::::: ..:.:.:::
CCDS31 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
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pF1KE5 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
:::::::.:... . :..::.:. ::: :. :::.:::.:: .:. . . :..::::::
CCDS31 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPA-GSQAKTFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
:.::.:::.::::.::::::...: .: :...::::.:: :::::::::::::::.::.:
CCDS31 CTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FRKVARRLQVSLSM
.::. : ..:
CCDS31 LRKILNRAKLS
300 310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1163 init1: 1100 opt: 1110 Z-score: 928.5 bits: 180.0 E(32554): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 1110; 54.7% identity (82.3% similar) in 300 aa overlap (5-304:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVK
: :.::::.:.:. :.: :. :: .:: .:.....::.:::.::..:.
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LYTPMYFFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFL
:.:::::::: ::..:: :.: .::..:..: . . .::. :::::..: ::::::
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAVMAYDRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQI
::.::::::::: ::::: : .. :.:. :.. ... : ..: ..: :: :::: .:.:
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NFFFCDLPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGR
: :.:: ::::::.:::: :::. :..:.... . ..::::: :. ..::. : ::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AKTFSTCASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRN
:.::::::.. ::..:::...::::. :. :.:.::::::::::.::.::::::::.:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDVKDAFRKVARRLQVSLSM
:::: :..:.
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1137 init1: 1091 opt: 1099 Z-score: 919.5 bits: 178.3 E(32554): 6.7e-45
Smith-Waterman score: 1099; 54.5% identity (80.5% similar) in 308 aa overlap (5-312:3-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
: :.::::::.:. : :.:.::::.::: .::.::.::.::: :: .: :.::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
::::.:::.: :.:..::.... . :: : :. ::.:::.:. .: :::: :::
CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
:::::. .:: ::..:. .: :..:.:.:: .: ..: :: ::::..: .. ::::
CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
:::: :.:::. :.::.: .: : . :::::::.:. ::.:..: :: :.:::
CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
::::.:::..:.:. :::::. .:.. . ::..::::..::::::::.::::::.::.:
CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 FRKVARRLQVSLSM
:.:.. . ..:.
CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1073 init1: 699 opt: 1093 Z-score: 914.7 bits: 177.4 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1093; 54.9% identity (82.2% similar) in 304 aa overlap (5-308:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
: :.::::::.:. : :.:.:::.:.:: .::.::::: ::...:. : .:.::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]