Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5992
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5992, 314 aa
1>>>pF1KE5992 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1090+/-0.0013; mu= 10.8269+/- 0.077
mean_var=134.9736+/-45.780, 0's: 0 Z-trim(100.9): 377 B-trim: 747 in 2/44
Lambda= 0.110395
statistics sampled from 5841 (6304) to 5841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 1.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 2031 335.9 2.4e-92
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1178 200.1 1.9e-51
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1167 198.3 6.3e-51
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1149 195.5 4.6e-50
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1116 190.2 1.8e-48
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1106 188.6 5.4e-48
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1086 185.5 5e-47
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1084 185.1 6e-47
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1081 184.6 8.4e-47
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1074 183.5 1.8e-46
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1074 183.6 1.9e-46
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1063 181.8 6.1e-46
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1063 181.8 6.3e-46
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1058 181.0 1.1e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1056 180.7 1.3e-45
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1052 180.0 2.1e-45
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1049 179.5 2.9e-45
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1049 179.6 3.2e-45
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1048 179.4 3.5e-45
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1043 178.6 5.7e-45
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 1038 177.8 1e-44
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1037 177.6 1.1e-44
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1033 177.0 1.7e-44
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1031 176.7 2.1e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1031 176.7 2.1e-44
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1030 176.5 2.3e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1029 176.4 2.6e-44
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1026 175.9 3.6e-44
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1022 175.2 5.7e-44
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1019 174.8 8e-44
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1012 173.6 1.7e-43
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1011 173.5 1.9e-43
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1008 173.0 2.6e-43
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1005 172.5 3.7e-43
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1002 172.1 5.2e-43
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 998 171.4 8.2e-43
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 996 171.1 9.9e-43
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 995 170.9 1.1e-42
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 995 170.9 1.1e-42
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 993 170.6 1.4e-42
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 993 170.6 1.4e-42
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 992 170.5 1.6e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 991 170.3 1.7e-42
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 990 170.2 2e-42
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 987 169.7 2.7e-42
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 986 169.5 3e-42
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 986 169.5 3e-42
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 985 169.3 3.3e-42
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 985 169.3 3.3e-42
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 983 169.0 4.2e-42
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 1771.4 bits: 335.9 E(32554): 2.4e-92
Smith-Waterman score: 2031; 99.7% identity (99.7% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNLLIYSLRNKDVK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 DAAEKVLRSKVDSS
::::::::::::::
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1199 init1: 1177 opt: 1178 Z-score: 1037.0 bits: 200.1 E(32554): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1178; 56.1% identity (83.5% similar) in 303 aa overlap (5-307:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
. :::. :::...:: :...:::.:: .:.. ..::: :..:. :. :: :
CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
::.:::::::.:. . :.::::.:::. :::: ::::::..:: .:::.: .:::::
CCDS31 MYYFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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CCDS31 AYDRYAAICNPLLYTTLMSRRVCVCFIVLAYFSGSTTSLVHVCLTFRLSFCGSNIVNHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
::.:::: :::::: ::. :: . : .. :..:.:::: ::..::.:.: .::.:::
CCDS31 CDIPPLLALSCTDTQINQLLLFALCSFIQTSTFVVIFISYFCILITVLSIKSSGGRSKTF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNLLIYSLRNKDVK
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CCDS31 STCASHLIAVTLFYGALLFMYLQPTTSYSLDTDKVVAVFYTVVFPMFNPIIYSFRNKDVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 DAAEKVLRSKVDSS
.: .:.:
CCDS31 NALKKLLERIGYSNEWYLNRLRIVNI
300 310 320
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1149 init1: 1149 opt: 1167 Z-score: 1027.8 bits: 198.3 E(32554): 6.3e-51
Smith-Waterman score: 1167; 57.2% identity (80.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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CCDS31 MLLTDRN-TSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
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pF1KE5 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
::::::.:::::.:: : :.::::::.. ....::. ::..::.:::::. ::::.::.:
CCDS31 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
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pF1KE5 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
::::.::::::::::: ::. .:. :.: :: : :: : :. : . :.:::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
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pF1KE5 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
:.. ::.:::.:: ::.::: .. :: ..:.. :: ::....::.:: :::.:.:
CCDS31 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNLLIYSLRNKDVK
::::::::..::..::.::.: :. : .: :. :::::. ::.:: :::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 DAAEKVLRSKVDSS
:.. ..: .::
CCDS31 DTVTEILDTKVFSY
300 310
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1175 init1: 1146 opt: 1149 Z-score: 1012.2 bits: 195.5 E(32554): 4.6e-50
Smith-Waterman score: 1149; 55.5% identity (80.6% similar) in 310 aa overlap (2-311:6-315)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPH
: :: : ::::.:::. :.:: ::: .:: .: ..::.:...::.::
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFI
:.::::::::.::::: : :...::::::...:::.::..::: ::::: .: :: :.
CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVI
:: ::::::.:: ::::: :..: ::. ::. :.:.: .. .::...: :..: .: :
CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGR
:::.:: ::::::::.:: .: .. ...: . : : .:..:::. :...:::. :. ::
CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNLLIYSLRN
.:.::::::.: .:::. ::.::.: ::. :: . ::..:::::..::::: :::::.:
CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDVKDAAEKVLRSKVDSS
:::: : .:.: ...
CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1103 init1: 1103 opt: 1116 Z-score: 983.9 bits: 190.2 E(32554): 1.8e-48
Smith-Waterman score: 1116; 54.4% identity (81.8% similar) in 307 aa overlap (7-313:5-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
: : :.::::::. :::.. :::.:: .:.. :..:.:. ::... .:.::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
.:::::.:::::.:: : ::::::.:.....:.::. :: .:::.::: . :: :.::.:
CCDS31 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
::::.::::::::: :.::. . ..: :. :.. ::.:.:.:. . . .:::::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
:::::::.:.:.:.:.:: :: .. : . ..::. ::..:: ..:::.: .:.:.:
CCDS31 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNLLIYSLRNKDVK
::::::::..:. .::.:.:: ::: : ..::. .::::. ::.:: ::::::::::.
CCDS31 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 DAAEKVLRSKVDSS
: .::. ::. :
CCDS31 KALRKVMGSKIHS
300 310
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1106 init1: 1106 opt: 1106 Z-score: 975.1 bits: 188.6 E(32554): 5.4e-48
Smith-Waterman score: 1106; 51.3% identity (80.1% similar) in 302 aa overlap (6-307:5-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
:: :.::.:::::. .:...: ::..:: :: . : :..:. ::..: ::. :
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMP
10 20 30 40 50
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310
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CCDS31 NAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
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CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
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CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
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CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
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CCDS31 MYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVM
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CCDS31 AFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFF
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CCDS31 CDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKAL
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CCDS31 STCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVK
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CCDS31 EALKK-LKNKILF
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CCDS31 MADDNFTVVTEFILLGLTDHAELKAVLFVVFLVIYAITLLRNLGMILLIQITSKLHTP
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CCDS31 MYFLLSCLSFVDACYSSAIAPKMLVNLLVVKATISFSACMVQHLCFGVFITTEGFLLSVM
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CCDS31 AYDRYVAIVSPLLYTVAMSDRKCVELVTGSWIGGIVNTLIHTISLRRLSFCRLNAVSHFF
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CCDS31 CDIPSLLKLSCSDTSMNELLLLTFSGVIAMATFLTVIISYIFIAFASLRIHSASGRQQAF
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CCDS31 STCASHLTAVTIFYGTLIFSYIQPSSQYFVEQEKVVSMFYTLGIPMLNLLIHSLRNKDVK
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CCDS31 EAVKRAIEMKHFLC
300 310
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CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTP
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CCDS31 MYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLM
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300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]