Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5990, 314 aa
1>>>pF1KE5990 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8565+/-0.00153; mu= 12.8352+/- 0.088
mean_var=177.4003+/-61.505, 0's: 0 Z-trim(99.9): 480 B-trim: 347 in 1/46
Lambda= 0.096294
statistics sampled from 5358 (5924) to 5358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 2063 300.0 1.6e-81
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1343 200.0 2e-51
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1331 198.4 6.8e-51
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1309 195.3 5.3e-50
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1280 191.3 9.1e-49
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1243 186.1 3e-47
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1242 186.0 3.4e-47
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1231 184.4 9.7e-47
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1223 183.3 2.1e-46
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1213 181.9 5.4e-46
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1206 180.9 1.1e-45
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1202 180.4 1.6e-45
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1182 177.6 1.1e-44
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1151 173.3 2.1e-43
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1150 173.2 2.4e-43
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1146 172.6 3.5e-43
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1122 169.3 3.5e-42
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1122 169.3 3.5e-42
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1122 169.3 3.5e-42
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1122 169.3 3.5e-42
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1115 168.3 6.8e-42
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1108 167.3 1.3e-41
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1095 165.5 4.7e-41
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1090 164.8 7.6e-41
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1069 161.9 5.7e-40
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1067 161.6 7e-40
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1065 161.4 8.4e-40
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1061 160.9 1.4e-39
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1055 160.0 2.2e-39
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1051 159.4 3.3e-39
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1047 158.9 4.8e-39
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1046 158.7 5.2e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1037 157.5 1.2e-38
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1035 157.2 1.6e-38
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1034 157.1 1.7e-38
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1025 155.8 4e-38
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1020 155.1 6.4e-38
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1015 154.4 1e-37
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1015 154.4 1e-37
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1005 153.1 2.9e-37
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1001 152.5 4e-37
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 993 151.4 8.6e-37
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 992 151.2 9.5e-37
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 982 149.8 2.5e-36
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 966 147.6 1.2e-35
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 947 145.0 7.3e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 911 140.0 2.4e-33
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 909 139.7 2.8e-33
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 900 138.4 6.7e-33
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 899 138.3 7.4e-33
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 1577.3 bits: 300.0 E(32554): 1.6e-81
Smith-Waterman score: 2063; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKNRFLNFNKAMPS
::::::::::::::
CCDS32 LKNRFLNFNKAMPS
310
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1385 init1: 1168 opt: 1343 Z-score: 1036.7 bits: 200.0 E(32554): 2e-51
Smith-Waterman score: 1343; 61.8% identity (87.1% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHS-PM
:: : : .::::: :: .: .:: :::. : .::: :.:: ::..::: :: ::: ::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMS
:::: ::...:: :::::::::: :.:. .: ::: ::..::::::. :.:..::..:.
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFC
.:::.:::::::: ...: :.:. ::.:::..: .::.::: :...::.::: :::::::
CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALST
:::.:..:::.::::::..::: ::...::::..:. ::...:........ ..::::::
CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMR
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CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KLKNRFLNFNKAMPS
::.:: ..:
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1313 init1: 1313 opt: 1331 Z-score: 1027.2 bits: 198.4 E(32554): 6.8e-51
Smith-Waterman score: 1331; 62.1% identity (88.6% similar) in 306 aa overlap (1-306:25-330)
10 20 30
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYV
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CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 ATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDG
: ..:: ::..:: : .::.::::::.:::.::. .:::::::::.:.:. .::::::.
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 CLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHS
::.::::.:::::.:..::..:..:::.:::::::: .:.: .:::.::. ::..: .:.
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFN
::. :...:::::: .:::::::::.: .:::.::::..:.... ::...:: :..:
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYT
::...::::...:: . .:: :: :::. :: ::::::::::.::.::. .::.:.::::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 IFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRKLKNRFLNFNKAMPS
::: :::.::::::.::: :: :::.:.:
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1321 init1: 1296 opt: 1309 Z-score: 1011.2 bits: 195.3 E(32554): 5.3e-50
Smith-Waterman score: 1309; 59.4% identity (87.5% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
:.: .:::::::::::: ::.::: .::..::....:: ::.. . : ::.::::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
:::.:::.::. ..::::::..:.. .:::::.::..::: :: :.:.:..::.::..
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
::.:::::::::..... ..:: .: :: .::.::.:.. :.. :::::: ::::::::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTC
::.:..:::.::: . .. ...::.:.::::..:. ::.:.:. :. .:: ::::::::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRK
:::. ::.:::::::..:.::.: . .::.::::::. :: ::::::.:::..:: :: :
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKNRFLNFNKAMPS
:.:: .:
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 (343 aa)
initn: 1270 init1: 1270 opt: 1280 Z-score: 989.0 bits: 191.3 E(32554): 9.1e-49
Smith-Waterman score: 1280; 58.0% identity (86.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:32-338)
10 20 30
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMV
: . :.: .:::.::::..: ......: .
CCDS32 ALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFAL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHK
::..::.:..:: ::..::. :.:..:::::: :::..::.::::::::.: . : .:
CCDS32 FSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWI
.::: ::.::::.:::. :.:..::..:.::::.:::::::: .... .::: :::.::.
CCDS32 VISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 MGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSC
.:..:: :. ::..:::::: :::.:::::.: .:::.: : . . ....::::.:::
CCDS32 LGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKI
::.:. :: ..:.:.:.:: :.::: :: :::. ::.::::::::::.::... .::.
CCDS32 FIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 LSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRKLKNRFLNFNKAMPS
:.:::::.:: ::::::::::.:.::.:.:: :.:
CCDS32 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
310 320 330 340
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1248 init1: 1224 opt: 1243 Z-score: 961.8 bits: 186.1 E(32554): 3e-47
Smith-Waterman score: 1243; 58.7% identity (86.3% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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CCDS32 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
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CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
310 320
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CCDS32 FLLGNLSFLDMCLSTATTPKMIIDLLTDHKTISVWGCVTQMFFMHFFGGAEMTLLIIMAF
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CCDS32 LPLVIKLACIETYTLELFVIADSGLLSFTCFILLLVSYIVILVSVPKKSSHGLSKALSTL
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CCDS32 SAHIIVVTLFFGPCIFIYVWPFSSLASNKTLAVFYTVITPLLNPSIYTLRNKKMQEAIRK
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CCDS32 LRFQYVSSAQNF
310
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CCDS41 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIMAY
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CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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CCDS32 LRKWDAHSSVKF
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