Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5981
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5981, 313 aa
1>>>pF1KE5981 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9011+/-0.00127; mu= 12.4336+/- 0.074
mean_var=150.4820+/-50.896, 0's: 0 Z-trim(102.3): 358 B-trim: 795 in 2/46
Lambda= 0.104552
statistics sampled from 6424 (6872) to 6424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 2088 327.6 7.6e-90
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1848 291.4 6.1e-79
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1441 230.0 1.8e-60
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1372 219.6 2.5e-57
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1267 203.8 1.4e-52
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1191 192.3 4.1e-49
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1139 184.5 9.5e-47
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1136 184.0 1.3e-46
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1071 174.2 1.2e-43
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1067 173.6 1.8e-43
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1055 171.8 6.2e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1048 170.7 1.3e-42
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1030 168.0 8.4e-42
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1027 167.6 1.2e-41
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1025 167.3 1.4e-41
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1015 165.8 4.1e-41
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1000 163.5 2e-40
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 998 163.2 2.4e-40
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 982 160.8 1.3e-39
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 973 159.4 3.3e-39
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 958 157.2 1.6e-38
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 946 155.4 5.4e-38
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 925 152.2 4.9e-37
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 919 151.3 9.7e-37
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 896 147.9 1.1e-35
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 875 144.7 9.3e-35
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 874 144.5 1e-34
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 870 143.9 1.5e-34
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 865 143.1 2.6e-34
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 851 141.0 1.1e-33
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 848 140.6 1.6e-33
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 844 140.0 2.3e-33
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 840 139.4 3.6e-33
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 836 138.8 5.5e-33
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 828 137.6 1.3e-32
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 823 136.8 2.1e-32
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 814 135.5 5.4e-32
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 812 135.2 7.1e-32
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 790 131.8 6.6e-31
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 740 124.3 1.2e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 733 123.2 2.6e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 732 123.1 2.9e-28
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 725 122.1 6.5e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 711 119.9 2.6e-27
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 704 118.9 5.3e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 697 117.8 1.1e-26
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 689 116.6 2.6e-26
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 641 109.4 3.9e-24
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 635 108.4 7.2e-24
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 634 108.3 8.3e-24
>>CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 2088 init1: 2088 opt: 2088 Z-score: 1726.5 bits: 327.6 E(32554): 7.6e-90
Smith-Waterman score: 2088; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RETVLRIFFKTDH
:::::::::::::
CCDS53 RETVLRIFFKTDH
310
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1883 init1: 1836 opt: 1848 Z-score: 1530.8 bits: 291.4 E(32554): 6.1e-79
Smith-Waterman score: 1848; 89.1% identity (95.5% similar) in 313 aa overlap (1-313:5-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQS
: .: :::: ::::::::::::::::::: ::: :::.:::::.:..::::::::
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LHEPMYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIV
::::::: :::::::::.:::::::::::::::: ::::::: ::.::::::::.:::::
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LVAMAFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRII
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARL
:::::::::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::..::::::::::::::::
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEARL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALNTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVR
:::::::::::::::: :::::::.:: :::.:::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS31 KALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYGVR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKHIRETVLRIFFKTDH
::.::: :::::.::.:
CCDS31 TKQIRERVLRIFLKTNH
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1483 init1: 1441 opt: 1441 Z-score: 1199.1 bits: 230.0 E(32554): 1.8e-60
Smith-Waterman score: 1441; 66.7% identity (87.5% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
:: :::.:. :::::::::. .::::.::: :::::..:: .:.:::.::.:::.:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
:.: ::::. :::.:::.::::::::::::..:::::: : ::::::.:: ::...::.:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
:.::..:::.:: ::::::.: ::..:...: :.: .: :.:::.:::::::: :.::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
::: :.: :::: ::.::..:: :: ...::.:: :.. :: ::: ::: ..::::.:
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYIIVDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
:::::. :.: : :::::::.:: ::..::.::::.::::::::::.:::::::::::.:
CCDS31 TCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RETVLRIFFKTDH
:: ...:: . .
CCDS31 REQIVKIFVQKE
310
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 1393 init1: 1368 opt: 1372 Z-score: 1142.6 bits: 219.6 E(32554): 2.5e-57
Smith-Waterman score: 1372; 65.0% identity (88.1% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
: . :::::: :::::::::::: .:::::::: .::.:::.:: .:..::.:..:::.:
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
:.: :::: . :..::::::::::::::.:.. : : . :.:::::: ::.::: :::::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVL-RSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHT
:.: :.:::.:: :. :::.:..:.: :..:. :.: .::: ..:.:::::::...::::
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVI-GLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKAL
::::::.:.:.:::::.::..:: .: :..:. .: ::...:: ::: ::. :::::.:
CCDS31 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKSL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NTCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKH
.:::::. ::::: :::.:::.:: ::...:.::::.:::::::::: :::::::::::.
CCDS31 STCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTKQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 IRETVLRIFFKTDH
: . : .:...
CCDS31 IYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1284 init1: 1262 opt: 1267 Z-score: 1057.2 bits: 203.8 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 1267; 57.5% identity (85.6% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPIANDTQFHTSSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHEP
: . :: .:.:.::::::: :.::. :: ::::.::::::.:..::..::.:.::
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYCLAMLDSIDLSLSTATIPKMLGIFWFNIKEISFGGYLSQMFFIHFFTVMESIVLVAM
:.: ::.:..:::.:::...:.:::::::. .::..:. ..:::.:: :: ::. ::.::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 AFDRYIAICKPLWYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVIPLVFLLLRLPFCGHRIIPHTY
:::::.:.: :: :. ::::... :. :.: . ...:.:.:. ::::: .:: :.:
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CEHMGIARLACASIKVNIMFGLGSISLLLLDVLLIILSHIRILYAVFCLPSWEARLKALN
:::::::.:.:..:..: ..:: .:...:...:: .:.. :: ::: ::: .:.::::.
CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFVLNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKALS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCGSHIGVILAFSTPAFFSFFTHCFGHDIPQYIHIFLANLYVVVPPTLNPVIYGVRTKHI
:::.:.::: .: :. :::.:: :::.:: ::::..::::...::.:::.:::::::.:
CCDS31 TCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RETVLRIFFKTDH
:: :: .: :
CCDS31 RERVLYVFTKK
310
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1161 init1: 776 opt: 1191 Z-score: 995.2 bits: 192.3 E(32554): 4.1e-49
Smith-Waterman score: 1191; 56.1% identity (83.3% similar) in 312 aa overlap (1-308:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPIANDTQFHT-SSFLLLGIPGLEDVHIWIGFPFFSVYLIALLGNAAIFFVIQTEQSLHE
: .: .. : ..:.: :::::: .:.::..:: ..::.::.::::...:: ...::
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
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CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
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CCDS31 YCEHMGIARLACANITVNIVYGL-TVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
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CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
240 250 260 270 280 290
300 310
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300 310
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CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCILLYLIVVE
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CCDS31 HSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLHYNFVLDS
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CCDS31 RIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAVFGLPSQ
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CCDS31 DACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPPALNPMV
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CCDS31 YGVKTKQIRDKVILLFSKGTG
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CCDS53 MYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVHMMFVGESAILLAM
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CCDS53 AFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKRLPFCLTNIVPHSY
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CCDS53 CEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAVFRLPSQDARHKAL
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CCDS53 STCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPPMLNPIVYGVKTKQ
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pF1KE5 IRETVLRIFFKTDH
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CCDS53 IREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
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CCDS31 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
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CCDS31 CEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKAF
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CCDS31 GTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTKQ
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CCDS31 IRESILGVFPRKDM
310
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CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGL-MVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]