Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5980
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5980, 313 aa
1>>>pF1KE5980 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4634+/-0.00136; mu= 14.6393+/- 0.079
mean_var=194.3014+/-72.156, 0's: 0 Z-trim(101.4): 390 B-trim: 386 in 1/46
Lambda= 0.092010
statistics sampled from 6037 (6518) to 6037 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 2053 286.1 2.3e-77
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1924 269.0 3.3e-72
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1364 194.7 7.8e-50
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1315 188.2 7.1e-48
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1284 184.1 1.3e-46
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1194 172.1 5e-43
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1180 170.3 1.8e-42
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1173 169.3 3.4e-42
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1146 165.7 4e-41
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1145 165.6 4.5e-41
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1144 165.5 4.8e-41
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1131 163.8 1.6e-40
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1128 163.4 2.1e-40
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1126 163.1 2.6e-40
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1106 160.5 1.7e-39
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1096 159.1 4e-39
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1090 158.3 7e-39
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1087 157.9 9.2e-39
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1086 157.8 1e-38
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1082 157.2 1.4e-38
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1073 156.0 3.3e-38
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1069 155.5 4.8e-38
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1069 155.6 5.1e-38
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1067 155.3 5.8e-38
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1060 154.3 1.1e-37
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1060 154.3 1.1e-37
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1060 154.3 1.1e-37
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1060 154.3 1.1e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1060 154.3 1.1e-37
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1055 153.7 1.8e-37
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1047 152.6 3.7e-37
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1036 151.1 1e-36
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1033 150.9 1.4e-36
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1029 150.2 1.9e-36
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1027 150.0 2.4e-36
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1026 149.9 2.6e-36
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1003 146.8 2.1e-35
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1002 146.6 2.3e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 999 146.3 3.1e-35
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 996 145.8 4e-35
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 993 145.4 5.3e-35
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 993 145.4 5.3e-35
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 981 143.8 1.6e-34
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 976 143.2 2.5e-34
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 975 143.0 2.8e-34
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 969 142.2 4.8e-34
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 953 140.1 2.1e-33
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 935 137.7 1.1e-32
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 926 136.5 2.5e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 925 136.4 2.8e-32
>>CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 2053 init1: 2053 opt: 2053 Z-score: 1502.3 bits: 286.1 E(32554): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 2053; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
:::::::::::::
CCDS32 RKVVTKYILCEEK
310
>>CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 (313 aa)
initn: 1924 init1: 1924 opt: 1924 Z-score: 1409.8 bits: 269.0 E(32554): 3.3e-72
Smith-Waterman score: 1924; 93.9% identity (97.8% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
:::::::.:::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::.
CCDS32 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
: :.:::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:: ::::::::::::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: ::::::::::::::::
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
::.:::::::.::
CCDS32 RKLVTKYILCKEK
310
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 1354 init1: 1026 opt: 1364 Z-score: 1008.1 bits: 194.7 E(32554): 7.8e-50
Smith-Waterman score: 1364; 61.6% identity (87.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
::: : : ::::.: ::.:....::..::. : :::.:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
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CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
::: ::::::::.:::: : : : . :.:::::::.:::::..:::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
. ::...::.::: ::.:. .:::.:..::..:: ::: .: ...::. :.. .:.:
CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKS--KAIS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
:: .:: :. :::::.:.::. ::..: :::::.::::::::.::.::::::.::::.:
CCDS32 TCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
::.......:
CCDS32 RKLLSQHMFC
300
>>CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 (307 aa)
initn: 1305 init1: 970 opt: 1315 Z-score: 973.0 bits: 188.2 E(32554): 7.1e-48
Smith-Waterman score: 1315; 59.4% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
::. : : . ::.: ::.:....::..::. : ::..:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
:.:.:::.:: :: :.::.::.::. .::::. :::.:::::::.:..: .::.:::.
CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
::: :::::::: :.:: : : .. :.:::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
. ::...::..:: ::.:. .:::....::..:: ::: .: .. ..:.: :.:::
CCDS32 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIR--GSSSEAKNKAMS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
:: .:: .. .::::.:.::.::: .: :::::.:::::::::::.::::::.::::.:
CCDS32 TCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
.:: .:.:
CCDS32 KKVFNKHIA
300
>>CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 (316 aa)
initn: 1282 init1: 974 opt: 1284 Z-score: 950.6 bits: 184.1 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 1284; 56.3% identity (86.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
:. :: : ::::.: ::.:....::..::..: :::.:::::.::: ::: :: ::.:.:
CCDS32 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
..:.:::.:: :: :.::.::.::. :.:.::. :::.:::::::.:..: .::.:::.
CCDS32 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
::: ::::::: .:.:: : : .. :.:::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
. ::...::.. : ::.:. .:::....::..:: ::: .: ... .. :. :.:::
CCDS32 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGK--NKAMS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
:: ... :..:::::.:.:: :: .. ::.::.::::::::.::.::::::.:::..:
CCDS32 TCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
.........:.
CCDS32 KRLLSRHVVCQVDFIIRN
300 310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1206 init1: 912 opt: 1194 Z-score: 886.0 bits: 172.1 E(32554): 5e-43
Smith-Waterman score: 1194; 53.8% identity (84.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
:. ::...:. ::: ::::. :...:.:..: . :.. . ::.::. . :::: . ::
CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
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CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRS--KALS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
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CCDS31 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
.:.
CCDS31 KKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
300 310
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CCDS32 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
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CCDS32 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQ--NKVF
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CCDS32 STCASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTA
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300 310
pF1KE5 MRKVVTKYILCEEK
:.:. :
CCDS32 MKKLRIKPCGIPLPC
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGS---TSKA
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CCDS32 LSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
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pF1KE5 AMRKVVTKYILCEEK
::.:. .. .
CCDS32 AMKKLQNRRVTFQ
300 310
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CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARR--KAAS
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CCDS42 RRLGKCLVICRE
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CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRR--KAIS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]