Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5978, 312 aa
1>>>pF1KE5978 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2912+/-0.000537; mu= 16.2442+/- 0.033
mean_var=129.8915+/-36.449, 0's: 0 Z-trim(106.7): 314 B-trim: 850 in 1/51
Lambda= 0.112534
statistics sampled from 14306 (14771) to 14306 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 5.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 859 151.8 1.7e-36
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 831 147.3 3.8e-35
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 831 147.3 3.8e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 831 147.3 3.9e-35
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 826 146.5 6.8e-35
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 144.5 2.6e-34
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 808 143.5 5.1e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 797 141.8 1.8e-33
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 795 141.4 2.2e-33
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 141.4 2.2e-33
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 795 141.4 2.2e-33
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 777 138.5 1.7e-32
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 770 137.4 3.7e-32
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 769 137.2 4.1e-32
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 758 135.4 1.4e-31
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 752 134.4 2.7e-31
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 751 134.3 3.2e-31
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 750 134.1 3.5e-31
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 738 132.2 1.3e-30
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 708 127.3 3.9e-29
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 466 88.0 2.7e-17
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 447 84.9 2.3e-16
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 231 50.0 9.1e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 231 50.0 9.5e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 228 49.4 1.2e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 219 48.0 3.3e-05
NP_001269833 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 291) 207 45.9 0.00012
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 206 45.8 0.00014
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 205 45.7 0.00017
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 198 44.7 0.00038
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 195 44.1 0.00051
NP_005277 (OMIM: 600731) neuropeptides B/W recepto ( 333) 192 43.6 0.00068
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 190 43.3 0.00093
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 191 43.6 0.00094
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 191 43.7 0.001
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446) 189 43.3 0.0011
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 190 43.6 0.0012
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 186 42.6 0.0013
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 188 43.1 0.0013
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 188 43.2 0.0014
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 185 42.6 0.0017
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 185 42.6 0.0017
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 185 42.6 0.0017
NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 184 42.3 0.0017
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 181 41.8 0.0025
NP_113597 (OMIM: 601835) C-C chemokine receptor ty ( 374) 180 41.7 0.0028
NP_004358 (OMIM: 601835) C-C chemokine receptor ty ( 374) 180 41.7 0.0028
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 891 init1: 837 opt: 859 Z-score: 776.4 bits: 151.8 E(85289): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 859; 41.3% identity (73.6% similar) in 303 aa overlap (2-304:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SYDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFG
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 QAFHDSLKKIAFRLKK
.: . :.
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(85289): 3.8e-35
Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD
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pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK
.. . ...:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(85289): 3.8e-35
Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST
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pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK
.. . ...:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 812 init1: 812 opt: 831 Z-score: 751.7 bits: 147.3 E(85289): 3.9e-35
Smith-Waterman score: 831; 40.0% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (4-308:16-320)
10 20 30 40
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTM
..... :.::::...:: : :::.:.. :. .: :.: :: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 LDPHLKTPMYFFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EFFLLATMSYDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCD
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 SNVINHFGCDALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPS
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pF1KE5 VQQKKKAFSTCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIY
.. . ::::::.::..:: . :.. : .:..: ... .. . ..:: . ..:::: :::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300 310
pF1KE5 TLRNEQVKQAFHDSLKKIAFRLKK
.:::. .: :.. . ...:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 859 init1: 789 opt: 826 Z-score: 747.4 bits: 146.5 E(85289): 6.8e-35
Smith-Waterman score: 826; 41.0% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (5-309:7-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDP-QLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPM
: :. :::.... : ..: :::. .. :.... :. :: .:. :: :..::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQ
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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pF1KE5 AFHDSLKKI-AFRLKK
:. ...:. :.:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 836 init1: 809 opt: 814 Z-score: 736.9 bits: 144.5 E(85289): 2.6e-34
Smith-Waterman score: 814; 42.7% identity (75.6% similar) in 295 aa overlap (8-299:10-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
: :::::... :.:. .::. ..:.:.:...:. ::: .. :::::.::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLF-FADLFGVTEFFLLATMS
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGV-ECLLLAVMA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALM--IILPPLSLGFHLEFCDSNVINHF
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NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTL--RLPRCGHHEVDHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GCDALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKA
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NP_001 LREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQV
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NP_001 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KQAFHDSLKKIAFRLKK
: :.
NP_001 KGALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 874 init1: 779 opt: 808 Z-score: 731.7 bits: 143.5 E(85289): 5.1e-34
Smith-Waterman score: 808; 39.1% identity (74.7% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK
. . ...
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 756 init1: 556 opt: 797 Z-score: 722.1 bits: 141.8 E(85289): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 797; 38.6% identity (73.8% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTCV
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pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
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NP_001 SHITVVILFFVPCIFVYMRPAA--TLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR
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310
pF1KE5 DSLKKIAFRLKK
NP_001 KLCSRKDISGDK
300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 787 init1: 787 opt: 795 Z-score: 720.2 bits: 141.4 E(85289): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 795; 40.1% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-307:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD
:::::.: :.: ::: . .: ..: :..... .. :.: .: .. :.:..:.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST
: .... : ::: : ...:... .. . :.::: :: ::::. : . .:::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FHDSLKKIAFRLKK
.. : :..
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 787 init1: 787 opt: 795 Z-score: 720.2 bits: 141.4 E(85289): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 795; 40.1% identity (72.0% similar) in 304 aa overlap (4-307:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMY
.: .. ::::::. : . .: ::..... :...: :. :. : :: .:.::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSY
::: :::....:.... ::..: . . .: : ...:. ::::. .: :: :::.:.:
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCD
:::::.: :.: ::: . .: ..: :..... .. :.: .: .. :.:..:.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ALPILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
312 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:27:33 2016 done: Tue Nov 8 08:27:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]