FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5978, 312 aa
1>>>pF1KE5978 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7149+/-0.0014; mu= 13.9660+/- 0.082
mean_var=184.2845+/-62.410, 0's: 0 Z-trim(100.7): 435 B-trim: 363 in 1/48
Lambda= 0.094478
statistics sampled from 5710 (6220) to 5710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 1.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 2021 288.9 3.5e-78
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1599 231.4 7.1e-61
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1398 204.0 1.3e-52
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1391 203.0 2.4e-52
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1364 199.3 3.1e-51
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1341 196.2 2.8e-50
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1316 192.8 2.9e-49
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1297 190.2 1.8e-48
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1294 189.8 2.3e-48
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1288 189.0 4.1e-48
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1277 187.5 1.2e-47
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1271 186.7 2.1e-47
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 903 136.5 2.6e-32
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 897 135.7 4.5e-32
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 887 134.3 1.2e-31
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 885 134.0 1.4e-31
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 871 132.2 5.4e-31
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 870 132.0 5.8e-31
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 869 131.9 6.5e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 859 130.5 1.7e-30
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 858 130.4 1.8e-30
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 858 130.4 1.8e-30
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 850 129.3 3.8e-30
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 841 128.1 9.3e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 840 127.9 9.9e-30
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CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 831 126.7 2.3e-29
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CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 829 126.4 2.8e-29
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 826 126.0 3.7e-29
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 826 126.0 3.7e-29
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 826 126.0 3.8e-29
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 824 125.7 4.5e-29
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 824 125.7 4.5e-29
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 824 125.7 4.5e-29
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 822 125.5 5.5e-29
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 821 125.3 6e-29
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 820 125.2 6.6e-29
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 819 125.0 7.2e-29
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 819 125.1 7.3e-29
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 818 124.9 8.1e-29
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 817 124.8 8.7e-29
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 814 124.4 1.2e-28
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 813 124.2 1.3e-28
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 813 124.2 1.3e-28
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 812 124.1 1.4e-28
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 812 124.1 1.4e-28
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 811 124.0 1.5e-28
>>CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 1517.2 bits: 288.9 E(32554): 3.5e-78
Smith-Waterman score: 2021; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 DSLKKIAFRLKK
::::::::::::
CCDS31 DSLKKIAFRLKK
310
>>CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1599 init1: 1599 opt: 1599 Z-score: 1206.3 bits: 231.4 E(32554): 7.1e-61
Smith-Waterman score: 1599; 74.7% identity (92.9% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
:..::.: :::::::: ::.::::::.:::.::::::::.::::.::..: :::::::::
CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
:.:.::::.:::..:.:::::.:: :.. ::::::. :.::. :::.:::::::.:::::
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
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CCDS31 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
:.::: :::: .:::::. ::...:::::::.::: ::.:::::::::::.::::::::
CCDS31 PLLKISCSDTWVIEQMVILMAVFALIITLVCVILSYLYIVRTILKFPSVQQRKKAFSTCS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
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CCDS31 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 DSLKKIAFRLKK
::.:.::: ::
CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1395 init1: 1395 opt: 1398 Z-score: 1058.3 bits: 204.0 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1398; 63.8% identity (91.3% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
::.::....:::::::.::::::..:..::.:::::.::.::::.::.:: :::::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
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pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
:.:.::::.:::.. .:.:: :..::.: :.:: :. ::::. :.:.:::::::.:::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
:::::::::: .:::..::. .:. :::...::.::: .:..:.:: .:...:: ::.
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
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pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
:::.. :.::..:: :.. ::.::...::: :.:::: :::::::.:: ::.::::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
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pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
::..::::.::::::.:.::::::.:..:::...: .:..:::: :::::::.:::..:.
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 DSLKKIA-FRLKK
..::: : .:
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1094 init1: 1094 opt: 1391 Z-score: 1053.1 bits: 203.0 E(32554): 2.4e-52
Smith-Waterman score: 1391; 64.7% identity (87.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
:...:..: :::::::..:::::..: :::.::.:::::.::::.::.:: :::::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
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pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
:.:.: ::::::..: :::: :: ::.: :.::::. :::: ..: :::::::.::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
:::::::::: .:::...: ..: :.:....:.:::..:..:.:::::::.:: ::.
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
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pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
:.:.: :.::: .: : :..:.: ::. :.:::::::::::..::.::.::::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
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pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
::. ::::.::::::.:.: :::: : ..:::..: .:..:::: :::::::.::::::.
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 DSLKKIAFRLKK
: :.::. . ::
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1364 init1: 1364 opt: 1364 Z-score: 1033.3 bits: 199.3 E(32554): 3.1e-51
Smith-Waterman score: 1364; 62.4% identity (89.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
:...: . :::::::..:.:::..:.:::.:::::. :.::::.::.:::::.::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LQNLSFLEISFTATCVPRFLYSISTGNKIITYNACVIQLFFADLFGVTEFFLLATMSYDR
:.:.::::::::. .:::: :..::::.:.. .:. : ::: ..:.:::.:::.:::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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pF1KE5 YVAICKPLHYMAIMSNKVCKTMVICCWMAALMIILPPLSLGFHLEFCDSNVINHFGCDAL
::::::::::..:::..:: .:.: :..... ::::. : ...:: ::..::. ::
CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PILKIPCSDTSLIEQMVVASAVLTFIITLVCVVLSYTYIIRTILKFPSVQQKKKAFSTCS
:.... ::::::.: ::. ::.:...::: :.:::::::::::..::.::. :::::::
CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
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pF1KE5 SHITVVSITYGSCIFIYIKPSAKEEVNINKGVSVLISSISPMLNSFIYTLRNEQVKQAFH
::. :.:..::::.:.::.::::: .:::..:::.:..:.:: :::::::.::::::.
CCDS31 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
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310
pF1KE5 DSLKKIAFRLKK
::.:::
CCDS31 DSVKKIVKL
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1384 init1: 1341 opt: 1341 Z-score: 1016.3 bits: 196.2 E(32554): 2.8e-50
Smith-Waterman score: 1341; 62.2% identity (87.5% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRKHTAITTFILLGLTEDPQLQVLLFMFLFITYMLSVTGKLTIIALTMLDPHLKTPMYFF
::. ::.: ::::::: ::: ::.::.::..::::::::.: ::.::. ::::.::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
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70 80 90 100 110 120
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130 140 150 160 170 180
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CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
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310
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310
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CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
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CCDS31 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
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310
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CCDS31 NMARKTVFFTST
310
312 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]