FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5976, 312 aa
1>>>pF1KE5976 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3612+/-0.000486; mu= 21.3411+/- 0.030
mean_var=91.2820+/-22.568, 0's: 0 Z-trim(108.9): 332 B-trim: 1971 in 2/52
Lambda= 0.134240
statistics sampled from 16513 (16974) to 16513 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 6.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 970 198.6 1.4e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 818 169.2 9.9e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 807 167.0 4.3e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 795 164.7 2.2e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 783 162.4 1.1e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 783 162.4 1.1e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 776 161.0 2.8e-39
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NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 771 160.1 5.4e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 768 159.5 8.1e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 768 159.5 8.1e-39
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 765 158.9 1.2e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 765 158.9 1.2e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 765 158.9 1.2e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 761 158.1 2.1e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 750 156.0 9.3e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 730 152.1 1.3e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 701 146.5 6.6e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 696 145.5 1.3e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 505 108.6 1.8e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 474 102.6 1.1e-21
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 201 49.8 1e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 198 49.1 1.4e-05
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 198 49.2 1.5e-05
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 198 49.2 1.5e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 188 47.2 5.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 185 46.6 8.1e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 186 47.0 8.3e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 185 46.6 8.4e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 182 46.1 0.00013
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 183 46.4 0.00013
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 182 46.2 0.00015
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 179 45.4 0.00018
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XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 179 45.5 0.0002
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 179 45.6 0.00021
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 179 45.6 0.00021
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 179 45.6 0.00021
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 179 45.6 0.00021
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 970; 47.2% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
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NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
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310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
.:..
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 818; 40.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (3-304:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPM
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pF1KE5 FDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYC
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pF1KE5 DLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSG-GSSKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TLSAHSTVVLLFFGPPMFVY--TRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKA
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 AIKRVCKQLVIYKRIS
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 807; 39.3% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (5-301:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
:..:
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
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pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
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pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDK--FLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
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300 310
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
. :.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 783; 42.7% identity (71.9% similar) in 302 aa overlap (5-301:3-302)
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pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTS--PKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
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NP_009 FFLSNLSFLDL--CFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
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pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
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NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
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NP_009 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVT
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300 310
pF1KE5 AAIKRVCKQLVIYKRIS
:..:.
NP_009 RAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 783; 36.5% identity (73.7% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
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pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQM--DKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
. :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 760 init1: 576 opt: 776 Z-score: 826.2 bits: 161.0 E(85289): 2.8e-39
Smith-Waterman score: 776; 37.8% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (5-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPH----PNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKE
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNT--DKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
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300 310
pF1KE5 MKAAIKRVCKQLVIYKRIS
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 756 init1: 583 opt: 775 Z-score: 825.4 bits: 160.8 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 775; 43.2% identity (72.0% similar) in 296 aa overlap (5-295:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTS--PKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
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XP_011 FFLSNLSFLDL--CFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
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pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
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XP_011 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
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pF1KE5 CDLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKAL
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XP_011 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
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pF1KE5 STLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRP-HPNSQM-DKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMK
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XP_011 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AAIKRVCKQLVIYKRIS
XP_011 RRGS
300
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 748 init1: 602 opt: 771 Z-score: 821.0 bits: 160.1 E(85289): 5.4e-39
Smith-Waterman score: 771; 37.5% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSG-FICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALS
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NP_002 MYVLLRMACSNI-QINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFS
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRP-HPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
: ..: .: ::.: .:: .: : : :. ... ::.::..:: .:..:::.:..:
NP_002 TCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
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300 310
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
. :. . .::..
NP_002 LGRLLDKH--FKRLT
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 759 init1: 576 opt: 768 Z-score: 817.9 bits: 159.5 E(85289): 8.1e-39
Smith-Waterman score: 768; 37.5% identity (72.8% similar) in 309 aa overlap (1-306:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALST
. ::.:.:.::. . .. ..... . :. .: ::. : :: : :. : ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRP--HPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
312 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]