Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5976
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5976, 312 aa
1>>>pF1KE5976 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5492+/-0.0012; mu= 14.5227+/- 0.070
mean_var=148.9639+/-46.482, 0's: 0 Z-trim(103.2): 393 B-trim: 853 in 2/46
Lambda= 0.105083
statistics sampled from 6805 (7290) to 6805 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 2060 324.8 5.2e-89
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 2053 323.8 1.1e-88
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1526 243.9 1.2e-64
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1441 231.0 9.3e-61
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1215 196.7 1.9e-50
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1206 195.3 4.8e-50
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1203 194.9 6.6e-50
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1184 192.0 5.1e-49
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1177 191.0 1.1e-48
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1128 183.5 1.8e-46
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1123 182.8 3e-46
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1121 182.5 4e-46
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1120 182.3 4.1e-46
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1115 181.6 6.9e-46
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1059 173.1 2.5e-43
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1057 172.8 3.1e-43
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1033 169.2 4.3e-42
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1021 167.3 1.4e-41
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1017 166.7 2.1e-41
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1016 166.6 2.3e-41
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1013 166.1 3.1e-41
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1013 166.1 3.2e-41
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1011 165.8 3.9e-41
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1011 165.8 3.9e-41
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 999 164.0 1.4e-40
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 990 162.6 3.5e-40
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 982 161.4 8.1e-40
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 974 160.2 1.9e-39
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 972 159.9 2.3e-39
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 970 159.6 2.9e-39
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 965 158.8 4.9e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 960 158.1 8.2e-39
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 959 157.9 9.5e-39
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 957 157.6 1.1e-38
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 952 156.9 1.9e-38
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 946 156.0 3.8e-38
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 943 155.5 4.9e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 940 155.0 6.7e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 939 154.9 7.5e-38
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 932 153.8 1.6e-37
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 931 153.7 1.7e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 923 152.5 4.1e-37
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 918 151.7 6.8e-37
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 899 148.8 5e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 843 140.3 1.8e-33
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 823 137.3 1.5e-32
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 821 137.0 1.9e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 818 136.5 2.5e-32
>>CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1711.5 bits: 324.8 E(32554): 5.2e-89
Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS72 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
::::::::::::
CCDS72 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1711.5 bits: 324.8 E(32554): 5.2e-89
Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS41 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
::::::::::::
CCDS41 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 (312 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1711.5 bits: 324.8 E(32554): 5.2e-89
Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
::::::::::::
CCDS43 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 (312 aa)
initn: 2053 init1: 2053 opt: 2053 Z-score: 1705.7 bits: 323.8 E(32554): 1.1e-88
Smith-Waterman score: 2053; 99.4% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS34 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNIFIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
:::::::::.::
CCDS34 VCKQLVIYKKIS
310
>>CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 (312 aa)
initn: 1558 init1: 1511 opt: 1526 Z-score: 1274.0 bits: 243.9 E(32554): 1.2e-64
Smith-Waterman score: 1526; 70.7% identity (90.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
:.: ::::::::.:.:::.: ::::::.::: ..: ::. ::..:::.:: : :::::::
CCDS32 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::.::.::.. ::.:.:::: :.:.:.:.::: :::.:::: :..::.::::::::::
CCDS32 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
:::.:.:::::::::::::::: :::.. .:. ::: ::.:.:.: :::::..::::::
CCDS32 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
::::::::::.: .:.::::::::.: ::.: .:.:::.::::::::::::: .::::::
CCDS32 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
::: :::.::::: :: :: : :.:..::.:::::: .:::::::.::::::.::.:..:
CCDS32 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
.:..:. . .:
CCDS32 LCSRLAHFTKIL
310
>>CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 (312 aa)
initn: 1511 init1: 1441 opt: 1441 Z-score: 1204.3 bits: 231.0 E(32554): 9.3e-61
Smith-Waterman score: 1441; 67.2% identity (88.4% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
:: ::::::::.::::. : .:::::..: ::.::.:. ::.:::..::.::.:.::::
CCDS32 MDEANHSVVSEFVFLGLSDSRKIQLLLFLFFSVFYVSSLMGNLLIVLTVTSDPRLQSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
::::.::.:.: :: :.::::::::::.:.::::::..::::::..::.::::::::::
CCDS32 FLLANLSIINLVFCSSTAPKMIYDLFRKHKTISFGGCVVQIFFIHAVGGTEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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