Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5973, 312 aa
1>>>pF1KE5973 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2118+/-0.000628; mu= 16.3186+/- 0.039
mean_var=102.0695+/-26.068, 0's: 0 Z-trim(104.6): 369 B-trim: 1534 in 2/48
Lambda= 0.126948
statistics sampled from 12448 (12963) to 12448 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.464), E-opt: 0.2 (0.152), width: 16
Scan time: 6.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 861 169.3 8.8e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 859 169.0 1.1e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 859 169.0 1.1e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 859 169.0 1.1e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 859 169.0 1.2e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 850 167.3 3.5e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 850 167.3 3.6e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 850 167.3 3.6e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 850 167.3 3.6e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 842 165.9 9.8e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 841 165.7 1.1e-40
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 830 163.7 4.5e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 825 162.8 8.5e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 820 161.8 1.6e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 814 160.7 3.4e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 808 159.6 7.3e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 807 159.5 8.3e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 782 154.9 2e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 780 154.5 2.5e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 765 151.7 1.7e-36
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 543 111.1 3e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 511 105.2 1.8e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 266 60.4 5.7e-09
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 222 52.4 1.6e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 207 49.6 1.1e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 206 49.4 1.2e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 203 49.0 2e-05
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 202 48.8 2.2e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 202 48.8 2.2e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 200 48.3 2.6e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 200 48.5 3.2e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 194 47.3 5.8e-05
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 190 46.5 9.7e-05
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 190 46.5 9.7e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 189 46.4 0.00012
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 189 46.4 0.00013
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 189 46.5 0.00013
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 187 45.9 0.00013
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 188 46.3 0.00015
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.6 0.00015
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 874 init1: 852 opt: 861 Z-score: 871.1 bits: 169.3 E(85289): 8.8e-42
Smith-Waterman score: 861; 44.7% identity (76.0% similar) in 300 aa overlap (3-299:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSW---LVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHF
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSP---VTLRLPRCGHHEVDHF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TCDYFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKA
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NP_001 LREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQV
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NP_001 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KQAFINMARKTVFFTST
: :.
NP_001 KGALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 859 init1: 859 opt: 859 Z-score: 869.2 bits: 169.0 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 859; 41.5% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FINMARKTVFFTST
. ... ..::
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 859 init1: 859 opt: 859 Z-score: 869.2 bits: 169.0 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 859; 41.5% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 YFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FINMARKTVFFTST
. ... ..::
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 855 init1: 779 opt: 859 Z-score: 869.1 bits: 169.0 E(85289): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 859; 43.6% identity (76.8% similar) in 298 aa overlap (3-299:5-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPN-FQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DYFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFS
: :.:.:.:.:: ..:.... . ...:. ::. :: : .::.:::.. . ::::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQ
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 AFINMARKTVFFTST
:.
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 859 init1: 859 opt: 859 Z-score: 869.0 bits: 169.0 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 859; 41.5% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-308:15-320)
10 20 30 40
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITL
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LDSHLQTPMYFFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 EFYLLAAMSYDRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCR
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 SNIIDHFTCDYFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TSQRTKAFSTCSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIY
:. : ::::::.::..:. . :.. : .:..: .. . . ...: : :.::.:::::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 SLRNQQVKQAFINMARKTVFFTST
::::. .: :. ... ..::
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 926 init1: 842 opt: 850 Z-score: 860.3 bits: 167.3 E(85289): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 850; 41.8% identity (76.5% similar) in 306 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPM
: :::: :::::..: : . :.:...:. :. :.. ::.::.. .::::.:::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DYFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLA---LIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTK
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVM---TAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSK
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NP_001 AFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKQAFINMARKTVFFTST
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NP_001 IKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 YFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 FINMARKTVFFTST
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 850; 41.7% identity (73.1% similar) in 309 aa overlap (3-311:5-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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300 310
pF1KE5 FINMARKTVFFTST
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 850 init1: 850 opt: 850 Z-score: 860.2 bits: 167.3 E(85289): 3.6e-41
Smith-Waterman score: 850; 41.7% identity (73.1% similar) in 309 aa overlap (3-311:5-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FINMARKTVFFTST
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 840 init1: 821 opt: 842 Z-score: 852.3 bits: 165.9 E(85289): 9.8e-41
Smith-Waterman score: 842; 41.6% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (2-305:4-308)
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 TCDYFPLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKA
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NP_003 FCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 FSTCSSHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQV
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NP_003 KKALANVISRKRTSSFL
300 310
312 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:23:42 2016 done: Tue Nov 8 08:23:43 2016
Total Scan time: 6.030 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]