FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5968, 312 aa
1>>>pF1KE5968 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8405+/-0.00137; mu= 12.5809+/- 0.079
mean_var=153.0686+/-50.042, 0's: 0 Z-trim(101.2): 411 B-trim: 735 in 2/46
Lambda= 0.103665
statistics sampled from 5914 (6436) to 5914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 2012 313.8 1.1e-85
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1769 277.4 9.8e-75
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1755 275.3 4.2e-74
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1476 233.6 1.5e-61
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1222 195.6 4.3e-50
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1087 175.5 5.5e-44
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1081 174.6 9.9e-44
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1077 173.9 1.4e-43
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1077 173.9 1.4e-43
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1077 173.9 1.4e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1076 173.8 1.6e-43
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1066 172.3 4.4e-43
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1064 172.0 5.5e-43
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1056 170.8 1.3e-42
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1053 170.3 1.7e-42
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1049 169.7 2.6e-42
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1043 168.9 5.1e-42
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1042 168.7 5.3e-42
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1042 168.7 5.3e-42
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1040 168.4 6.5e-42
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1039 168.3 7.4e-42
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1032 167.2 1.5e-41
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1030 166.9 1.8e-41
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1025 166.2 3.1e-41
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1018 165.1 6.4e-41
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 991 161.1 1e-39
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 953 155.4 5.4e-38
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 952 155.2 6e-38
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 945 154.2 1.2e-37
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 941 153.6 1.9e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 938 153.1 2.5e-37
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 933 152.4 4.3e-37
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 928 151.6 7.2e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 918 150.1 2e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 917 150.0 2.2e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 914 149.5 3.1e-36
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 912 149.2 3.7e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 905 148.2 7.8e-36
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 903 147.9 9.7e-36
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 902 147.7 1.1e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 899 147.3 1.4e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 896 146.8 2e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 895 146.7 2.2e-35
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 892 146.2 3e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 892 146.2 3e-35
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 890 146.0 3.7e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 889 145.8 4.1e-35
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 882 144.8 8.5e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 881 144.6 9.6e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 881 144.6 9.7e-35
>>CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2012 init1: 2012 opt: 2012 Z-score: 1651.6 bits: 313.8 E(32554): 1.1e-85
Smith-Waterman score: 2012; 97.8% identity (99.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALTGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS31 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALIGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFLALGGAEALLLASMAYD
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS31 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFSALGGAEALLLASMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYIAICFPLHYPIRMSKRVCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCRSRAINHFFCDV
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 RYIAICFPLHYPIRMSKRMCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCQSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAMVTLACMDTWVYEGTVFLSTTIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TRVSQRICSGKM
::::::::::::
CCDS31 TRVSQRICSGKM
310
>>CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1769 init1: 1769 opt: 1769 Z-score: 1455.2 bits: 277.4 E(32554): 9.8e-75
Smith-Waterman score: 1769; 86.5% identity (94.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALTGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
:::::::::::::::.::::.::::::::.:.:::::: :::::::::::::::::::::
CCDS58 MENYNQTSTDFILLGLFPPSKIGLFLFILFVLIFLMALIGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFLALGGAEALLLASMAYD
::::::::::::::::: ::::::: ::::::: :::::::::....:::::::.:::::
CCDS58 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMASDFLYGNKSISFIGCGIQSFFFMTFAGAEALLLTSMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYIAICFPLHYPIRMSKRVCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCRSRAINHFFCDV
::.:::::::::::::::. ::::::::.:::::.::::::...::::.:::::::::::
CCDS58 RYVAICFPLHYPIRMSKRMYVLMITGSWMIGSINSCAHTVYAFRIPYCKSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
:::.:::: :::::: ::.::.:::::::: .:.:::: ::::::.:.::::::::: ::
CCDS58 PAMLTLACTDTWVYEYTVFLSSTIFLVFPFTGIACSYGWVLLAVYRMHSAEGRKKAYSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
::::::::::::::.:::: :::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS58 STHLTVVTFYYAPFAYTYLCPRSLRSLTEDKVLAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TRVSQRICSGKM
::: : : : ::
CCDS58 TRVIQNIFSVKM
310
>>CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1755 init1: 1755 opt: 1755 Z-score: 1443.9 bits: 275.3 E(32554): 4.2e-74
Smith-Waterman score: 1755; 84.6% identity (94.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALTGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
:::::::::::::::.:: ::::::.: :: .:::::: :::::::::::: ::::::::
CCDS31 MENYNQTSTDFILLGLFPQSRIGLFVFTLIFLIFLMALIGNLSMILLIFLDIHLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFLALGGAEALLLASMAYD
::::::::::::::::: ::. ::: ::::::::::::::::::.:. ::.:::.:::::
CCDS31 LLSQLSLIDLNYISTIVPKMVYDFLYGNKSISFTGCGIQSFFFLTLAVAEGLLLTSMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYIAICFPLHYPIRMSKRVCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCRSRAINHFFCDV
::.:::::::::::.::::::.::::::.:.:::.::::::.: ::::.:::::::::::
CCDS31 RYVAICFPLHYPIRISKRVCVMMITGSWMISSINSCAHTVYALCIPYCKSRAINHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
:::.:::: ::::::.::.::.:::::.:: .:.:::::::::::.:.::::::::: ::
CCDS31 PAMLTLACTDTWVYESTVFLSSTIFLVLPFTGIACSYGRVLLAVYRMHSAEGRKKAYSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
:::::::.::::::.:::.::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::
CCDS31 STHLTVVSFYYAPFAYTYVRPRSLRSPTEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TRVSQRICSGKM
:.: :.: : ::
CCDS31 TQVIQKIFSVKM
310
>>CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1476 init1: 1476 opt: 1476 Z-score: 1218.4 bits: 233.6 E(32554): 1.5e-61
Smith-Waterman score: 1476; 71.6% identity (89.4% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALTGNLSMILLIFLDTHLHTPMYF
::..:.::.::::::..::.. :.::. ::..::..: .:: .:: :: .: .:::::::
CCDS16 MEKWNHTSNDFILLGLLPPNQTGIFLLCLIILIFFLASVGNSAMIHLIHVDPRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFLALGGAEALLLASMAYD
:::::::.:: :::: : ::: .::::.:.::: :::.::::::... .:.:::.:::::
CCDS16 LLSQLSLMDLMYISTTVPKMAYNFLSGQKGISFLGCGVQSFFFLTMACSEGLLLTSMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYIAICFPLHYPIRMSKRVCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLHIPYCRSRAINHFFCDV
::.::: :.::::::: .:: :: ::: .::::. ::::..:::::::::::.::::::
CCDS16 RYLAICHSLYYPIRMSKMMCVKMIGGSWTLGSINSLAHTVFALHIPYCRSRAIDHFFCDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTC
:::. ::: :::::: :..:...::.::::.:. : ::::.:::::.: ::::::. :
CCDS16 PAMLLLACTDTWVYEYMVFVSTSLFLLFPFIGITSSCGRVLFAVYHMHSKEGRKKAFTTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 STHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPMLNPIIYSLRNKEVMGAL
::::::: ::::::::::::::.::::.:::.:::::: :::::::::::::::::.::.
CCDS16 STHLTVVIFYYAPFVYTYLRPRNLRSPAEDKILAVFYTILTPMLNPIIYSLRNKEVLGAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TRVSQRICSGKM
::
CCDS16 RRVFGIFSFLKE
310
>>CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1254 init1: 1209 opt: 1222 Z-score: 1012.7 bits: 195.6 E(32554): 4.3e-50
Smith-Waterman score: 1222; 58.5% identity (83.7% similar) in 313 aa overlap (1-311:16-328)
10 20 30 40
pF1KE5 MENYNQT-STDFILLGFFPPSRIGLFLFILIVFIFLMALTGNLSM
:.. ::. .:::.:.:.: . :. .::..:. .: .:::::. .
CCDS31 MNISDVISFDILVSAMKTGNQSFGTDFLLVGLFQYGWINSLLFVVIATLFTVALTGNIML
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 ILLIFLDTHLHTPMYFLLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKSISFTGCGIQSFFFL
: :: :.:.:::::::::::::..:: :::: : ::: .::: .:.: : :: ::.. ::
CCDS31 IHLIRLNTRLHTPMYFLLSQLSIVDLMYISTTVPKMAVSFLSQSKTIRFLGCEIQTYVFL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ALGGAEALLLASMAYDRYIAICFPLHYPIRMSKRVCVLMITGSWIIGSINACAHTVYVLH
::::.:::::. :.::::.::: :::::. :::..: ::.. .: ::::: ::.::..
CCDS31 ALGGTEALLLGFMSYDRYVAICHPLHYPMLMSKKICCLMVACAWASGSINAFIHTLYVFQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IPYCRSRAINHFFCDVPAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAV
.:.:::: ::::::.:::...:.:.:: :: :::::. :.:..::.:: ::.:::..:
CCDS31 LPFCRSRLINHFFCEVPALLSLVCQDTSQYEYTVLLSGLIILLLPFLAILASYARVLIVV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 YHMKSAEGRKKAYLTCSTHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTEDKVLAVFYTTLTPML
..:.:..:. :: :::.:: :....:: ..:: ::.:::::..::..::::: .::.:
CCDS31 FQMSSGKGQAKAVSTCSSHLIVASLFYATTLFTYTRPHSLRSPSRDKAVAVFYTIVTPLL
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 NPIIYSLRNKEVMGALTRV-SQRICSGKM
::.::::::::: ::. :. . :: :
CCDS31 NPFIYSLRNKEVTGAVRRLLGYWICCRKYDFRSLY
310 320 330
>>CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 (369 aa)
initn: 1085 init1: 1085 opt: 1087 Z-score: 903.2 bits: 175.5 E(32554): 5.5e-44
Smith-Waterman score: 1087; 52.9% identity (79.7% similar) in 306 aa overlap (1-306:52-357)
10 20 30
pF1KE5 MENYNQTSTDFILLGFFPPSRIGLFLFILI
::.:: .:::: ..:.: .. . ..: .:
CCDS31 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAII
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VFIFLMALTGNLSMILLIFLDTHLHTPMYFLLSQLSLIDLNYISTIVLKMASDFLSGNKS
.::. :: .: ::.:: : .::::::::::.:::::. :::::: :: ..: ...
CCDS31 SIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
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160 170 180 190 200 210
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CCDS31 GSLDGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPF
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 IAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLTCSTHLTVVTFYYAPFVYTYLRPRSLRSPTED
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280 290 300 310
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CCDS31 KVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
330 340 350 360
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300 310
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. ..
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
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CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
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CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
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300 310
pF1KE5 LTRVSQRICSGKM
: .:
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
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CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
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pF1KE5 VPAMVTLACMDTWVYEGTVLLSATIFLVFPFIAISCSYGRVLLAVYHMKSAEGRKKAYLT
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CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
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CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
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pF1KE5 LTRVSQRICSGKM
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CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
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CCDS31 FLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAGAEFFLLGLMSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]