FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5963, 312 aa
1>>>pF1KE5963 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9124+/-0.000633; mu= 18.4472+/- 0.039
mean_var=115.0177+/-30.685, 0's: 0 Z-trim(105.7): 332 B-trim: 894 in 1/48
Lambda= 0.119589
statistics sampled from 13426 (13874) to 13426 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16
Scan time: 5.860
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 891 165.7 1.1e-40
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 877 163.3 5.8e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 877 163.3 5.9e-40
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 856 159.7 7.4e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 855 159.5 8.1e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 839 156.7 5.5e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 837 156.4 7e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 832 155.5 1.3e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 829 155.0 1.8e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 826 154.5 2.6e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 826 154.5 2.6e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 814 152.4 1.1e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 814 152.4 1.1e-36
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 814 152.4 1.1e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 812 152.1 1.4e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 807 151.2 2.5e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 783 147.0 4.3e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 762 143.4 5.5e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 744 140.3 4.7e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 506 99.3 1.1e-20
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 489 96.4 8.4e-20
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 228 51.4 3.3e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 224 50.8 5.8e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 223 50.5 5.9e-06
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 217 49.7 1.4e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 211 48.6 2.8e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 211 48.6 2.9e-05
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 204 47.2 5.5e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 204 47.3 6.1e-05
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 204 47.3 6.1e-05
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 203 47.1 6.6e-05
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 203 47.1 6.6e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 202 46.9 6.9e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 198 46.1 0.00011
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 196 45.9 0.00015
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 196 45.9 0.00016
NP_001048 (OMIM: 162321) substance-K receptor [Hom ( 398) 194 45.6 0.0002
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 192 45.2 0.00025
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 191 45.0 0.00026
XP_016867841 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 191 45.0 0.00027
NP_001139738 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 191 45.0 0.00027
NP_001139739 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 191 45.0 0.00027
NP_001139737 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 191 45.0 0.00027
XP_005250508 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 191 45.0 0.00027
NP_061843 (OMIM: 605188) probable G-protein couple ( 370) 191 45.0 0.00027
NP_009163 (OMIM: 604525) histamine H3 receptor [Ho ( 445) 191 45.1 0.00031
XP_005260323 (OMIM: 604525) PREDICTED: histamine H ( 453) 191 45.1 0.00031
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 187 44.3 0.00044
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 187 44.4 0.00045
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 888 init1: 848 opt: 891 Z-score: 851.4 bits: 165.7 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 891; 43.1% identity (77.8% similar) in 306 aa overlap (3-307:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDP-QWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPM
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQ
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 AFKSMVQKMIFSLNK
:.. .:..
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 877; 41.7% identity (77.0% similar) in 309 aa overlap (3-310:5-312)
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pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 YDRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFIC
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XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE5 DSSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFS
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XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE5 TCSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQ
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XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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300 310
pF1KE5 AFKSMVQKMIFSLNK
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XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 877; 41.7% identity (77.0% similar) in 309 aa overlap (3-310:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFF-FIFLGVTEFYLLAAMS
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVMA
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pF1KE5 YDRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFIC
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NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE5 TCSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQ
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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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pF1KE5 AFKSMVQKMIFSLNK
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 877; 41.7% identity (77.0% similar) in 309 aa overlap (3-310:15-322)
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pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTL
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XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 45.2% identity (72.6% similar) in 303 aa overlap (2-299:4-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTA-VTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPM
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
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pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 FKSMVQKMIFSLNK
. ..
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 886 init1: 839 opt: 839 Z-score: 802.9 bits: 156.7 E(85289): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 839; 41.5% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (2-307:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SYDRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFI
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDSSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 QAFKSMVQKMIFSLNK
.: ...... .
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 884 init1: 834 opt: 837 Z-score: 801.1 bits: 156.4 E(85289): 7e-38
Smith-Waterman score: 837; 40.2% identity (71.8% similar) in 301 aa overlap (3-303:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MSYDRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 ICDSSPMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE5 FSTCSSHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE5 KQAFKSMVQKMIFSLNK
. : : ..
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 772 init1: 584 opt: 832 Z-score: 796.5 bits: 155.5 E(85289): 1.3e-37
Smith-Waterman score: 832; 39.1% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYV-VILCSLRTHSLEARHKALSTCV
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pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
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NP_001 SHITVVILFFVPCIFVYMRPAAT--LPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR
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310
pF1KE5 SMVQKMIFSLNK
.. .. .: .:
NP_001 KLCSRKDISGDK
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 839 init1: 815 opt: 829 Z-score: 793.7 bits: 155.0 E(85289): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 829; 41.3% identity (74.3% similar) in 303 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRCMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFIC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]