FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5962, 312 aa
1>>>pF1KE5962 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4850+/-0.00117; mu= 14.3701+/- 0.069
mean_var=138.5482+/-46.212, 0's: 0 Z-trim(102.8): 385 B-trim: 824 in 2/45
Lambda= 0.108962
statistics sampled from 6589 (7093) to 6589 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 2052 335.0 4.6e-92
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1331 221.6 6.1e-58
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1209 202.4 3.6e-52
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1140 191.6 6.7e-49
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1138 191.3 8.8e-49
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1128 189.7 2.5e-48
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1111 187.1 1.6e-47
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1111 187.1 1.6e-47
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1103 185.8 3.8e-47
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1079 182.0 5.2e-46
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1068 180.3 1.7e-45
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1056 178.4 6.5e-45
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1049 177.3 1.4e-44
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1049 177.3 1.4e-44
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1040 175.9 3.6e-44
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1036 175.3 5.6e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1028 174.0 1.3e-43
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1021 172.9 2.9e-43
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1020 172.8 3.2e-43
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1018 172.4 4e-43
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1013 171.6 6.8e-43
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1012 171.5 7.7e-43
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1009 171.0 1.1e-42
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1003 170.1 2.1e-42
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 989 167.9 9.4e-42
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 982 166.8 2e-41
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CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 976 165.8 3.9e-41
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 966 164.3 1.2e-40
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CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 964 164.0 1.5e-40
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 963 163.8 1.7e-40
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 949 161.6 7.5e-40
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 946 161.1 1e-39
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 946 161.1 1e-39
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 889 152.1 5e-37
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 885 151.6 8.3e-37
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 881 150.9 1.2e-36
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 859 147.4 1.4e-35
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 796 137.5 1.3e-32
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 768 133.1 2.7e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 749 130.1 2.1e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 739 128.7 6.9e-30
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 734 127.8 1.1e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 711 124.2 1.3e-28
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 682 119.6 3.2e-27
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 636 112.4 4.8e-25
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 613 108.8 5.8e-24
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 606 107.7 1.2e-23
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 2052 init1: 2052 opt: 2052 Z-score: 1766.2 bits: 335.0 E(32554): 4.6e-92
Smith-Waterman score: 2052; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAMSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAMSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSYCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSYCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKALNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKALNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKEIR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RAIFRMFHHIKI
::::::::::::
CCDS31 RAIFRMFHHIKI
310
>>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1331 init1: 1331 opt: 1331 Z-score: 1153.7 bits: 221.6 E(32554): 6.1e-58
Smith-Waterman score: 1331; 61.5% identity (87.7% similar) in 301 aa overlap (8-308:10-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEP
.:: . ::::::.... .:.. .:..: ... :: :: : ::.::.:
CCDS31 MLGLNGTPFQPATLQLTGIPGIQTGLTWVALIFCILYMISIVGNLSILTLVFWEPALHQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAM
::::::::...:...:..:::::. :::.: ...:.:::.:::.:: ::.:::::::::
CCDS31 MYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACLVQMFFIHTFSFMESGILLAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSY
:.::.:::: ::::.:::: . : ::::: ..:: ::::.::..::::.:..::: :::
CCDS31 SLDRFVAICYPLRYVTVLTHNRILAMGLGILTKSFTTLFPFPFVVKRLPFCKGNVLHHSY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKAL
:::::.:..::.:: .:.::::.:.. :.::: ::.:::.::::.... :.:.:::::
CCDS31 CLHPDLMKVACGDIHVNNIYGLLVIIFTYGMDSTFILLSYALILRAMLVIISQEQRLKAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKE
:::.::: ::::::::.:.:: .::: : .: .::.::::::::::.:::.:::.::::
CCDS31 NTCMSHICAVLAFYVPIIAVSMIHRFWKSAPPVVHVMMSNVYLFVPPMLNPIIYSVKTKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IRRAIFRMFHHIKI
::..:...::
CCDS31 IRKGILKFFHKSQA
310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1227 init1: 1206 opt: 1209 Z-score: 1050.0 bits: 202.4 E(32554): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 1209; 58.1% identity (83.9% similar) in 298 aa overlap (10-307:15-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSL
: :::.:::::: : :.: ::: :: :.. :: .:: ...: ::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGIL
::::: :::::.. :...:. :::::: : ..::.:. :::. :.:.:: ::..::..:
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLS
:.:.:::.:::: ::.:...::. ::. .:: . .:: .:::::..::.: : : :::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERL
:::::: ..:.:::::.. :::::.::.::: :.: ..:..::.::::.:.. ::: ::.
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAK
:::::::::: ::: ::.::::.:..:::::..: ..:.:. .::. :::.::..::.:
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKEIRRAIFRMFHHIKI
::.:: . . :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1149 init1: 799 opt: 1140 Z-score: 991.3 bits: 191.6 E(32554): 6.7e-49
Smith-Waterman score: 1140; 53.9% identity (80.6% similar) in 304 aa overlap (5-308:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHE
: . ..:.: :.:::: .. ::. ::: .: .:. :: .:. ::.: ::::
CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLA
::: :: ::: :. :: ...: .: : .:. .: :::::.::: :: .: ::: .:::
CCDS31 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHS
:.:::::::: :::.::::: .. .:..:..:. . ::: .::.::.::::.::::
CCDS31 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKA
:::: :.:.::: :: .: .:::.:..:..:.: ..: .::.:::..:.. .:: . ::
CCDS31 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTK
..:::::. ::. ::::.::.: ::::.:. . :...:.::.:::::::..:..:::
CCDS31 FGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 EIRRAIFRMFHHIKI
:::. :.:.::
CCDS31 EIRQRILRLFHVATHASEP
300 310
>>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa)
initn: 1124 init1: 1124 opt: 1138 Z-score: 989.3 bits: 191.3 E(32554): 8.8e-49
Smith-Waterman score: 1138; 52.8% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-307:13-321)
10 20 30 40
pF1KE5 MGLFN--VTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVIL
:...: ...: .::: :::::.... :.: :.:..:.::..::..::
CCDS31 MTETSLSSQCFPMSVLNNTIAEPLIFLLMGIPGLKATQYWISIPFCLLYVVAVSGNSMIL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 QAVRVEPSLHEPMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHF
.: : :::.:::::::::: .:...:. :: :.: .: ..::.:...::. :::..:
CCDS31 FVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNACIAQMFFLHG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 FSMMESGILLAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRL
:..::::.::::.:::.:::: ::::.:.::. :: .:.. :. ...:. ...:::
CCDS31 FTFMESGVLLAMAFDRFVAICYPLRYTTILTNARIAKIGMSMLIRNVAVMLPVMLFVKRL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 PICRSNVLSHSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVM
.: : ::::::: : :...:.:.: :::: :::.:.:: :.: :.:::.::.:::.
CCDS31 SFCSSMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCILLSYILIIRSVL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ATASREERLKALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPV
. :: ::: ::.:::.::: :: ::.:.:..: :::.:. .: ..:..:.::.:..:::
CCDS31 SIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHIIMANVFLLIPPV
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 LNPLIYSAKTKEIRRAIFRMFHHIKI
:::.:::.: :.:..::....
CCDS31 LNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
310 320 330 340
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1129 init1: 1104 opt: 1128 Z-score: 981.2 bits: 189.7 E(32554): 2.5e-48
Smith-Waterman score: 1128; 52.8% identity (82.5% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLFNVTHPA--FFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEP
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSY
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CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKAL
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CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
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300 310
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CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
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310
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CCDS77 TRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
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CCDS31 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
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CCDS31 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
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CCDS31 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
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CCDS31 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
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CCDS31 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPTS-LLHVVMANTYLLLPPVV
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CCDS31 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
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CCDS31 YFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIMSL
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CCDS31 DRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSYCL
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CCDS31 EKILGKLLNVCGR
300 310
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CCDS31 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]