Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5961
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5961, 312 aa
1>>>pF1KE5961 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7047+/-0.00123; mu= 13.5475+/- 0.071
mean_var=171.4389+/-58.335, 0's: 0 Z-trim(103.9): 389 B-trim: 931 in 2/46
Lambda= 0.097953
statistics sampled from 7134 (7636) to 7134 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 2049 302.5 2.7e-82
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 1381 208.1 7.2e-54
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 1103 168.8 4.8e-42
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 1090 167.0 1.7e-41
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 1067 163.8 1.7e-40
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 1040 159.9 2.3e-39
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 1019 157.0 1.8e-38
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 1014 156.2 2.9e-38
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 996 153.7 1.7e-37
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 987 152.4 4.1e-37
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 985 152.2 5.1e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 984 152.0 5.6e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 983 151.9 6.2e-37
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 982 151.7 6.7e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 980 151.5 8.5e-37
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 977 151.0 1.1e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 972 150.3 1.8e-36
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 972 150.3 1.8e-36
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 970 150.1 2.2e-36
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 967 149.7 3.1e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 964 149.2 3.9e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 964 149.2 4e-36
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 963 149.0 4.4e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 960 148.6 5.8e-36
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 960 148.6 6e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 959 148.5 6.4e-36
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 958 148.3 7e-36
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 958 148.3 7.2e-36
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 957 148.2 8e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 956 148.0 8.5e-36
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 952 147.5 1.3e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 948 146.9 1.9e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 948 146.9 1.9e-35
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 944 146.4 2.8e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 943 146.2 3.1e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 942 146.1 3.4e-35
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 942 146.1 3.4e-35
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 938 145.5 5.1e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 938 145.6 5.3e-35
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 937 145.4 5.7e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 935 145.1 6.7e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 935 145.1 6.8e-35
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 935 145.1 6.9e-35
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 931 144.5 1e-34
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 931 144.6 1.1e-34
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 930 144.4 1.1e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 930 144.4 1.1e-34
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 930 144.4 1.1e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 929 144.2 1.2e-34
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 929 144.2 1.2e-34
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2049 init1: 2049 opt: 2049 Z-score: 1590.8 bits: 302.5 E(32554): 2.7e-82
Smith-Waterman score: 2049; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VRRQLKRIGILA
::::::::::::
CCDS30 VRRQLKRIGILA
310
>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1409 init1: 1379 opt: 1381 Z-score: 1080.6 bits: 208.1 E(32554): 7.2e-54
Smith-Waterman score: 1381; 66.3% identity (86.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
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CCDS30 MDQYNHSSLAEFVFLGFASVGYVRGWLFVLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
::::.::: :: :::.::::::.:.:::::::::.::::: ::::::::.::::::::::
CCDS30 HFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSEKKTISFAGCLLQTYFFHSLGASECYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
::::::::::::: .:: ::::..: .:: :. :. :. : :.::::. :.:::.:::
CCDS30 DRYLAICRPLHYPIIMTTTLCAKMAAACWTCGFLCPISEVILASQLPFCAYNEIQHIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
:::.::::: ::: :.::::.::. :: ::..:. ::..:: .::.: .:.:..::.::
CCDS30 FPPLLSLACKDTSANILVDFAINAFIILITFFFIMISYARIIGAVLKIKTASGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
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CCDS30 CASHLAVVLIFFGSIIFMYVRLKKSYSLTLDRTLAIVYSVLTPMVNPIIYSLRNKEIIKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VRRQLKRIGILA
..: . . :
CCDS30 IKRTIFQKGDKASLAHL
310
>>CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1088 init1: 761 opt: 1103 Z-score: 868.3 bits: 168.8 E(32554): 4.8e-42
Smith-Waterman score: 1103; 54.1% identity (81.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
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CCDS30 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
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pF1KE5 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
.:.::.:: :. ::.:::::::.::.::::.::..::.::.:::::: .: :::.::
CCDS30 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
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pF1KE5 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
:::.::: ::.: .::: :::... : : :. . :: .:: :::::::.:...:::
CCDS30 DRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCD
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pF1KE5 FPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAIST
. :::::::::::. .:.. ::.. :. :::.: :::.:. ..:::::. :..::.::
CCDS30 LVPVLSLACTDTSM-ILIEDVIHAVTIIITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFST
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pF1KE5 CASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEA
::.:. : ::.::. ::.... .: : :.:....::.::.::.:::::::....:
CCDS30 CAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 VRRQLKRIGILA
...
CCDS30 IKKLFCLQKVLNKPGG
300 310
>>CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 824 init1: 478 opt: 1090 Z-score: 858.2 bits: 167.0 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 1090; 51.8% identity (79.9% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
:.. : . . :::. .::. .. :. ::.:: . :.:::.:. :: :...::::::
CCDS30 MESPNRTTIQEFIFSAFPYSWVKSVVCFVPLLFIYAFIVVGNLVIITVVQLNTHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 HFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTISFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAY
:.: ::: :. ::.:::::::..::::. .:::.:::::.::::: : : :::.::.
CCDS30 TFISALSFLEIWYTTATIPKMLSSLLSER-SISFNGCLLQMYFFHSTGICEVCLLTVMAF
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGGLAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCD
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CCDS30 DHYLAICSPLHYPSIMTPKLCTQLTLSCCVCGFITPLPEIAWISTLPFCGSNHLEHIFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 FPPVLSLACTDTSINVLVDFV--INSCKILATFLLILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAI
: ::: :::::: :... : :.. .:... .::. :: :. ..::: ::.:.: :.
CCDS30 FLPVLRLACTDTRAIVMIQVVDVIHAVEIITAVMLIFMSYDGIVAVILRIHSAGGRRTAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIK
:::.::: : .:.::. ::.... .::: .: :.:....::.::.::.::::::::::
CCDS30 STCVSHFIVFSLFFGSVTLMYLRFSATYSLFWDIAIALAFAVLSPFFNPIIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 EAVRRQLKRIGILA
::..... . :.
CCDS30 EAIKKHIGQAKIFFSVRPGTSSKIF
300 310 320
>>CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 (343 aa)
initn: 1043 init1: 737 opt: 1067 Z-score: 840.4 bits: 163.8 E(32554): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 1067; 51.6% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (3-309:31-339)
10 20 30
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLL
.:: ..:.::.. ::: . . .:. ::
CCDS30 MKQYSVGNQHSNYRSLLFPFLCSQMTQLTASGNQTMVTEFLFSMFPHAHRGGLLFFIPLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMYHFVSILSFSELGYTAATIPKMLANLLSEKKTI
::: . . :::..:.:. . ::::.: :.:.::: :. ::..::::::. :.::.:.:
CCDS30 LIYGFILTGNLIMFIVIQVGMALHTPLYFFISVLSFLEICYTTTTIPKMLSCLISEQKSI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 SFSGCLLQIYFFHSLGATECYLLTAMAYDRYLAICRPLHYPTLMTPTLCAEIAIGCWLGG
: .:::::.::::::: :: .::::: :::.::: ::.:::.: : :: ....: . :
CCDS30 SVAGCLLQMYFFHSLGITESCVLTAMAIDRYIAICNPLRYPTIMIPKLCIQLTVGSCFCG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 LAGPVVEISLISRLPFCGPNRIQHVFCDFPPVLSLACTDTSINVLVDFVINSCKILATFL
. . ::. :: ::::: :.:...:::: :::::::::: . :.:: .:.. .:.:.::
CCDS30 FLLVLPEIAWISTLPFCGSNQIHQIFCDFTPVLSLACTDTFLVVIVD-AIHAAEIVASFL
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 LILCSYVQIICTVLRIPSAAGKRKAISTCASHFTVVLIFYGSILSMYVQLKKSYSLDYDQ
.: ::..:: ..: . :: :..::.::::.:..: :.:.::. ::.... .::. .:
CCDS30 VIALSYIRIIIVILGMHSAEGHHKAFSTCAAHLAVFLLFFGSVAVMYLRFSATYSVFWDT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE5 ALAVVYSVLTPFLNPFIYSLRNKEIKEAVRRQL---KRIGILA
:.::.. .:.::.::.::::.::..:::. : . :: :
CCDS30 AIAVTFVILAPFFNPIIYSLKNKDMKEAIGRLFHYQKRAGWAGK
300 310 320 330 340
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 1110 init1: 1040 opt: 1040 Z-score: 820.3 bits: 159.9 E(32554): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 1040; 52.0% identity (78.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
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CCDS31 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
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CCDS31 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
250 260 270 280 290 300
310
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CCDS31 LLKKWKGK
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CCDS32 GAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSEIKTISFSGCFLQFY
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.:: . ..
CCDS31 KAVLKLRDKVAHPQRK
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]