Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5957
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5957, 312 aa
1>>>pF1KE5957 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6368+/-0.00139; mu= 14.0876+/- 0.082
mean_var=138.4242+/-42.003, 0's: 0 Z-trim(100.7): 393 B-trim: 348 in 1/48
Lambda= 0.109010
statistics sampled from 5744 (6201) to 5744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 2000 327.0 1.1e-89
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1534 253.7 1.3e-67
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1521 251.7 5.4e-67
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1516 250.9 9.3e-67
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1499 248.2 5.9e-66
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1469 243.5 1.6e-64
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1465 242.9 2.4e-64
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1463 242.6 3e-64
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1444 239.6 2.4e-63
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1427 236.9 1.5e-62
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1392 231.4 6.9e-61
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1391 231.3 7.7e-61
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 994 168.8 4.9e-42
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 967 164.6 9.2e-41
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 947 161.4 8.1e-40
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 936 159.7 2.8e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 933 159.2 3.7e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 930 158.7 5.1e-39
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 927 158.3 7.2e-39
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 908 155.3 5.6e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 906 155.0 7.1e-38
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 900 154.0 1.4e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 900 154.0 1.4e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 893 152.9 2.9e-37
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 890 152.5 4e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 888 152.2 5.1e-37
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 886 151.8 6.2e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 886 151.8 6.2e-37
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 882 151.2 9.7e-37
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 882 151.3 1e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 877 150.4 1.7e-36
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 872 149.6 2.9e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 871 149.5 3.2e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 868 149.0 4.6e-36
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 867 148.8 4.9e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 867 148.8 5e-36
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 867 148.8 5e-36
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 867 148.8 5e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 866 148.7 5.5e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 865 148.5 6.2e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 864 148.4 6.9e-36
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 863 148.2 7.6e-36
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 863 148.2 7.7e-36
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 861 147.9 9.7e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 860 147.7 1.1e-35
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 859 147.6 1.2e-35
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 859 147.6 1.2e-35
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 857 147.3 1.5e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 856 147.1 1.6e-35
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 855 146.9 1.8e-35
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 2000 init1: 2000 opt: 2000 Z-score: 1723.3 bits: 327.0 E(32554): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 2000; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSLEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSLEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDCY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VLRKISHKKKKH
::::::::::::
CCDS31 VLRKISHKKKKH
310
>>CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1243 init1: 1243 opt: 1534 Z-score: 1327.3 bits: 253.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 1534; 74.4% identity (89.7% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
: : ::. .:::::.::::.:::::: :...::.:::.::. :: ::: . :::::::::
CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
::::: ::::::.: :::::.: ::: .::::: ::.::.:.:::::::::: ::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSYDR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
:::::::::::::::...: :.:::::::::.::::. ::::::::::..:::: :::.
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
:.: :.::::. ::::.:.::.:::. :: ::.:::: :..:::.:::::::::::::::
CCDS31 PMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::.::::.:::::::: ::::::::.::.::::.::::::::::::::::::::::::..
CCDS31 SHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQALR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DVLRKISHKKKKH
. .:: .:.
CCDS31 EFTKKILSLNKQ
310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1194 init1: 1194 opt: 1521 Z-score: 1316.2 bits: 251.7 E(32554): 5.4e-67
Smith-Waterman score: 1521; 73.5% identity (92.5% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
:.:.:.:..::::::::.:::::.:: .::.::.::.:::::::.::::: :::::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
::::: ::.:::.: :.::.:. ::::.:::: ::::::: :.::.:::::::.:::.
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
:::::::::::::::.:.: :...::.::::.::::: :::::::: .:..::: :: .
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
:.::.:::::. .::: .. :..::. ::.::::::: ::::::.:::.:::::::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::..::::::::::::::: :::: :.:.::.:.:.::::::::::::::::.:::..::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DVLRKISHKKKKH
...::
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1557 init1: 1212 opt: 1516 Z-score: 1312.0 bits: 250.9 E(32554): 9.3e-67
Smith-Waterman score: 1516; 74.2% identity (91.2% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
:.: :.::::::::::..:: :::.: ::..::.::::::: ::.::: : ::.::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
::::: ::::::::: ::::....::...::::.:.:::::::::: :::.:::.::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
.::::::::: ::: :.: :..::::::::.::::. . :::::: ::::::: :::.
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
:.::.:::.: ::::.:.::. ::. :: ::::::: ::::::.::: .::::::::::
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::.:::::::.::::::.::::.: :.:.::::.:::::::.::::::::::.:::::::
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DVLRKISHKKKKH
....:.
CCDS31 SMVQKMIFSLNK
310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1523 init1: 1184 opt: 1499 Z-score: 1297.5 bits: 248.2 E(32554): 5.9e-66
Smith-Waterman score: 1499; 73.4% identity (91.1% similar) in 304 aa overlap (3-305:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
:.: ::.:.::::.:.:.::.::: :::.::.::::::::::.::..::::.::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
::::: ::::::.:: :::: .:.: .:.:::: ::::::::::.: :::..:..::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
:::::::::::.::. ..: :.. .::.:::.::::: . ::::.: :::::::.::
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
::::.::.:: ::...: .:: ::. :: :::::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::.::.:::::::::::.. :::: ..::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 DVLRKISHKKKKH
.:..:.
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1159 init1: 1159 opt: 1469 Z-score: 1272.0 bits: 243.5 E(32554): 1.6e-64
Smith-Waterman score: 1469; 67.9% identity (90.7% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
:::.: . ::::::: .:.:::..: ::::::.::::::::::.:::.: :::::::::
CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
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300 310
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CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
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CCDS31 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
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:::.:
CCDS31 DVLQKNLCFSKRPF
310
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CCDS31 LRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSYDR
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CCDS31 YVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICDIS
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310
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CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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CCDS31 NMARKTVFFTST
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]