Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5946
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5946, 312 aa
1>>>pF1KE5946 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5078+/-0.000679; mu= 21.0762+/- 0.042
mean_var=94.7608+/-23.897, 0's: 0 Z-trim(103.9): 282 B-trim: 784 in 1/47
Lambda= 0.131753
statistics sampled from 12028 (12385) to 12028 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.45), E-opt: 0.2 (0.145), width: 16
Scan time: 5.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1164 232.5 8.5e-61
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1025 206.1 7.6e-53
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 985 198.5 1.5e-50
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 943 190.5 3.7e-48
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 943 190.5 3.7e-48
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 943 190.5 3.8e-48
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 923 186.7 5.2e-47
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 900 182.4 1.1e-45
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 897 181.8 1.6e-45
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 881 178.7 1.3e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 881 178.7 1.3e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 881 178.7 1.3e-44
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 853 173.4 5.3e-43
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 843 171.5 2e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 840 170.9 2.9e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 836 170.2 5e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 831 169.2 9.3e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 830 169.0 1.1e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 807 164.6 2.2e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 589 123.2 6.8e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 566 118.9 1.4e-26
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 217 52.6 1.5e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 217 52.6 1.5e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 199 49.1 1.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 195 48.3 2.4e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 194 48.2 2.9e-05
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 191 47.7 4.7e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 187 46.8 6.7e-05
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 184 46.5 0.00013
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 183 46.2 0.00014
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 174 44.6 0.00047
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 171 43.9 0.00064
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 171 43.9 0.00064
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 168 43.2 0.00085
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 168 43.2 0.00085
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 168 43.2 0.00085
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 167 43.1 0.001
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 167 43.1 0.001
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 167 43.1 0.001
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 167 43.1 0.0011
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 167 43.1 0.0011
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 167 43.1 0.0011
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 167 43.1 0.0011
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 167 43.2 0.0011
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 166 42.8 0.0011
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 166 42.9 0.0011
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 167 43.2 0.0011
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 167 43.2 0.0011
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 167 43.2 0.0011
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1185 init1: 827 opt: 1164 Z-score: 1212.5 bits: 232.5 E(85289): 8.5e-61
Smith-Waterman score: 1164; 54.0% identity (83.6% similar) in 311 aa overlap (2-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
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pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AVIRVMQRRQDSR
:. :..:.. :
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1025; 49.7% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (5-311:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTP
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pF1KE5 AYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFF
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pF1KE5 CDTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAF
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pF1KE5 STCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVK
:::.::: .:::. .::.: : .: :: . :.. :::::: ::.:::::::::::.::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 NAVIRVMQRRQDSR
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 985; 47.6% identity (78.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
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pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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300 310
pF1KE5 AVIRVMQRRQDSR
:. :...:.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLAN-LLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
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XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFT-ISASYVFILFTILKINSTSGKQKAF
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pF1KE5 STCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVK
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300 310
pF1KE5 NAVIRVMQRRQDSR
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XP_011 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 951 init1: 674 opt: 943 Z-score: 985.5 bits: 190.5 E(85289): 3.7e-48
Smith-Waterman score: 943; 46.1% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (2-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
:. :...:..:.:.::. . . : ::..:: .:: :.:::. .:: . .: :::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLAN-LLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFT-ISASYVFILFTILKINSTSGKQKAF
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NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
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NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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300 310
pF1KE5 NAVIRVMQRRQDSR
.:. .:. :
NP_036 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 951 init1: 674 opt: 943 Z-score: 985.4 bits: 190.5 E(85289): 3.8e-48
Smith-Waterman score: 943; 46.1% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (2-307:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIR
:. :...:..:.:.::. . . : ::..:: .:: :.:::. .:: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 LDLQLHTPMYFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLAN-LLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTA
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ECYLLSSMAYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCD
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE5 SNVIHHFFCDTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFT-ISASYVFILFTILKIN
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 STSGKQKAFSTCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLI
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE5 YSLRNKEVKNAVIRVMQRRQDSR
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 935 init1: 673 opt: 923 Z-score: 964.9 bits: 186.7 E(85289): 5.2e-47
Smith-Waterman score: 923; 48.4% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (6-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLT-LSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFF
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTL--MVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQK
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEI--YAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFSTCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKE
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NP_835 AFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKNAVIRVMQRRQDSR
::::. :....
NP_835 VKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 860 init1: 698 opt: 900 Z-score: 941.1 bits: 182.4 E(85289): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 900; 44.3% identity (71.7% similar) in 314 aa overlap (1-309:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-----ISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SSMAYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIH
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFFCDTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQ
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNK
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 EVKNAVIRVMQRRQDSR
::: :. ... :
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 907 init1: 664 opt: 897 Z-score: 938.3 bits: 181.8 E(85289): 1.6e-45
Smith-Waterman score: 897; 43.2% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (6-304:2-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTS-NYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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NP_001 YVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
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NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISA-SYVFILFTILKINSTSGKQKAF
. :.:::::. . .:..... . :: .. : .. :: ::. .::.: .. ::.:::
NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYV-ADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 STCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVK
::: ::: ::..:: .:.::..: .::.. ::.:....::.: : :::..::..:.:..
NP_001 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 NAVIRVMQRRQDSR
.. .:
NP_001 AGIRKVFAFLKH
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 917 init1: 498 opt: 893 Z-score: 934.2 bits: 181.0 E(85289): 2.7e-45
Smith-Waterman score: 893; 45.3% identity (77.2% similar) in 307 aa overlap (2-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
: . :.:.:..:.:.::. . . .. ::...: .::.:.:::. .: ....: ::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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NP_003 YFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
::::.:::.::.: ::. ..:. : :: .. :.. : :... . :: . :: : ::::
NP_003 YDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
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pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
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:. .: :
NP_003 ALRKVATRNFP
300
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]