Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5946
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5946, 312 aa
1>>>pF1KE5946 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0782+/-0.00168; mu= 11.8706+/- 0.098
mean_var=196.2419+/-68.181, 0's: 0 Z-trim(98.4): 389 B-trim: 308 in 1/44
Lambda= 0.091554
statistics sampled from 4928 (5377) to 4928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.472), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1970 274.0 1e-73
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1875 261.5 6.1e-70
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1786 249.7 2.1e-66
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1188 170.7 1.3e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1164 167.6 1.1e-41
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1134 163.6 1.8e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1110 160.4 1.6e-39
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1092 158.1 8.4e-39
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1088 157.5 1.2e-38
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1085 157.1 1.6e-38
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1082 156.8 2.1e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1079 156.3 2.8e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1063 154.2 1.2e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1061 154.0 1.5e-37
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1059 153.7 1.7e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1059 153.7 1.7e-37
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1053 152.9 2.9e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1046 152.0 5.7e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1045 151.9 6.5e-37
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1042 151.6 8.8e-37
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1040 151.2 1e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1039 151.1 1.1e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1034 150.4 1.7e-36
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1034 150.4 1.7e-36
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1032 150.2 2.1e-36
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1032 150.2 2.1e-36
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1027 149.5 3.2e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1025 149.2 3.9e-36
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1024 149.1 4.2e-36
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1022 148.8 5.2e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1021 148.7 5.5e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1017 148.2 8e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1015 147.9 9.7e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1012 147.5 1.3e-35
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1012 147.5 1.3e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1004 146.4 2.6e-35
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1002 146.2 3.1e-35
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 999 145.8 4.2e-35
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 999 145.8 4.2e-35
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 997 145.5 5e-35
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 992 144.8 7.8e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 992 144.9 7.9e-35
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 987 144.3 1.3e-34
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 986 144.1 1.4e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 985 143.9 1.5e-34
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 985 143.9 1.5e-34
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 981 143.4 2.2e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 978 143.0 2.8e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 971 142.1 5.4e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 970 141.9 5.9e-34
>>CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1970 init1: 1970 opt: 1970 Z-score: 1436.9 bits: 274.0 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 1970; 99.0% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFYDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPVLNPLIYSLRNKEVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VIRVMQRRQDSR
::::::::::::
CCDS31 VIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1875 init1: 1875 opt: 1875 Z-score: 1369.1 bits: 261.5 E(32554): 6.1e-70
Smith-Waterman score: 1875; 92.9% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
::::::.:::::::: ::. :::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFCD
:::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
:::::::::::: :::.:::::.::::::::.::::::: :: :::::::::::::::::
CCDS31 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
::::::::::::.:.::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 VIRVMQRRQDSR
.:::::::::::
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1786 init1: 1786 opt: 1786 Z-score: 1305.6 bits: 249.7 E(32554): 2.1e-66
Smith-Waterman score: 1786; 88.4% identity (96.1% similar) in 311 aa overlap (2-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
::::::::: :::: ::. :::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAY
:::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::.:::.:::.:::::::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFCD
:::.::::::.: :::::::: ::.::::::.::.:::::: :::::::::::..:::::
CCDS31 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
::::::::: :::. ::.: :..::::::::.::::::: :: ::::::::::::::.::
CCDS31 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
:.::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 VIRVMQRRQDSR
.:::::::::::
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1117 init1: 783 opt: 1188 Z-score: 878.7 bits: 170.7 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1188; 57.8% identity (86.4% similar) in 308 aa overlap (2-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
:. : :.:. ::: :.. :.:..::..::.:::.:.:::.:.: .::.: ::::::
CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
::::..:.:::. ::..::::.:.:. .. :::.:::.::.::. : ::.::.:::
CCDS31 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
:.:: :::.:: :.:.::... : . :::::: .:...: .: : ::::. :.::::
CCDS31 YNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSS-INHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
::. .:::::.::..::.. :...: ::. ::. :...:..:. .::.:.:..:.:::::
CCDS31 DTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
::.:::..:::::..::::::.: .. :: . ::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS31 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AVIRVMQRRQDSR
:..::..:.
CCDS31 ALLRVIHRKLFP
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1185 init1: 827 opt: 1164 Z-score: 861.5 bits: 167.6 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1164; 54.0% identity (83.6% similar) in 311 aa overlap (2-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
: :.: :....:.:.::. . :.:. ::..::.:: .:.:::.::::.::.: ::::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
::::..:::.:. ::..::: ::.::. .. :::.::: ::.:: :.:.:: :.. ::
CCDS31 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFCDSNVIHHFFC
:::::::: :: :..:::. . : . .: .. :... .::. .: : ::::::::::::
CCDS31 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DTSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFS
:. :.. :::.:: : . :..: ... .:..: .:: ..::.:....: :...:::
CCDS31 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
::.::: .. .::.: :.:::.: .::::..:.:::::::.:::::::::::::.::::.
CCDS31 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AVIRVMQRRQDSR
:. :..:.. :
CCDS31 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1124 init1: 789 opt: 1134 Z-score: 840.1 bits: 163.6 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1134; 53.7% identity (84.0% similar) in 307 aa overlap (6-311:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
:::.:..:::.::: . :.:. ::..::.:::::..::.::: .: :: :::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSN-YISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMA
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