Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5945
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5945, 312 aa
1>>>pF1KE5945 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9853+/-0.000623; mu= 24.0514+/- 0.039
mean_var=102.6250+/-27.548, 0's: 0 Z-trim(105.3): 254 B-trim: 856 in 1/46
Lambda= 0.126604
statistics sampled from 13170 (13509) to 13170 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.469), E-opt: 0.2 (0.158), width: 16
Scan time: 6.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1148 221.2 2.2e-57
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1010 196.0 8.5e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 961 187.0 4.2e-47
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 936 182.4 9.9e-46
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 936 182.5 1e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 907 177.2 3.9e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 903 176.5 6.6e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 902 176.2 7.3e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 891 174.2 3e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 891 174.2 3e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 891 174.2 3e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 866 169.7 6.9e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 864 169.3 9e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 860 168.6 1.5e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 842 165.3 1.5e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 840 164.9 1.9e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 838 164.6 2.4e-40
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 824 162.0 1.4e-39
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 801 157.8 2.6e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 590 119.3 1.1e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 530 108.3 2.1e-23
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 222 52.2 2e-06
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 222 52.2 2e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 204 48.8 1.8e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 203 48.6 2.1e-05
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 184 45.2 0.00024
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 184 45.2 0.00024
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 184 45.3 0.00025
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 184 45.3 0.00026
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 184 45.3 0.00026
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 184 45.3 0.00026
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 184 45.3 0.00026
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 184 45.3 0.00026
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 183 45.0 0.00027
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 180 44.6 0.00042
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 179 44.4 0.00049
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 178 44.3 0.00058
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 175 43.4 0.00068
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 175 43.5 0.0007
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 175 43.6 0.00074
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 175 43.6 0.00076
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 175 43.6 0.00077
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 175 43.6 0.00077
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 175 43.6 0.00079
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 175 43.7 0.00081
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 173 43.4 0.0011
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 171 42.8 0.0012
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 170 42.6 0.0013
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 170 42.6 0.0013
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1169 init1: 803 opt: 1148 Z-score: 1151.2 bits: 221.2 E(85289): 2.2e-57
Smith-Waterman score: 1148; 53.1% identity (83.0% similar) in 311 aa overlap (2-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: :..:.. :
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1010; 48.7% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (5-311:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTP
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pF1KE5 CDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAF
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pF1KE5 STCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 NALIRVMQRRQDSR
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 961; 46.9% identity (76.4% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
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pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
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::.::: .:..:: . ::.::. .. : . :. : ::::.::::::::::::::.:.:.
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300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: :...:.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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:::: ::: : .::.:.: .:..: .:.: .: .: :.::.: :::::.::::::: .
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300 310
pF1KE5 KNALIRVMQRRQDSR
:.:: .:. :
XP_011 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 936; 46.6% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (2-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLAN-LLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGT-AECYLLSSM
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pF1KE5 AYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFF
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NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
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pF1KE5 CDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKINSTSGKQKA
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NP_036 CDVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKA
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pF1KE5 FSTCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREV
:::: ::: : .::.:.: .:..: .:.: .: .: :.::.: :::::.::::::: .
NP_036 FSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYL
240 250 260 270 280 290
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pF1KE5 KNALIRVMQRRQDSR
:.:: .:. :
NP_036 KGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 944 init1: 666 opt: 936 Z-score: 941.9 bits: 182.5 E(85289): 1e-45
Smith-Waterman score: 936; 46.6% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (2-307:11-317)
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pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIR
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 LDLQLHTPMYFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLAN-LLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGT-
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY-FVFMFVD
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AECYLLSSMAYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFC
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XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DSNIIHHFFCDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKI
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XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 NSTSGKQKAFSTCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPL
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XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPF
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE5 IYSLRNREVKNALIRVMQRRQDSR
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XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 891 init1: 666 opt: 907 Z-score: 913.3 bits: 177.2 E(85289): 3.9e-44
Smith-Waterman score: 907; 47.1% identity (74.2% similar) in 306 aa overlap (6-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSD-SEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTP
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSP
10 20 30 40 50
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pF1KE5 MYFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSM
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NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM
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pF1KE5 AYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFF
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NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF
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pF1KE5 CDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTL--MVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQK
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NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFE--IYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHK
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pF1KE5 AFSTCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNRE
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NP_835 AFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKNALIRVMQRRQDSR
::::: :....
NP_835 VKNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 865 init1: 706 opt: 903 Z-score: 909.2 bits: 176.5 E(85289): 6.6e-44
Smith-Waterman score: 903; 44.3% identity (72.3% similar) in 314 aa overlap (1-309:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-----ISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE5 SSMAYDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIH
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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pF1KE5 HFFCDTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQ
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNR
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 EVKNALIRVMQRRQDSR
::: :: ... :
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 926 init1: 499 opt: 902 Z-score: 908.5 bits: 176.2 E(85289): 7.3e-44
Smith-Waterman score: 902; 45.3% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (2-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
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NP_003 YFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
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NP_003 YDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
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NP_003 EAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
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pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKN
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
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300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: .: :
NP_003 ALRKVATRNFP
300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 887 init1: 584 opt: 891 Z-score: 897.5 bits: 174.2 E(85289): 3e-43
Smith-Waterman score: 891; 45.3% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (2-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
:: :.: :..:::.:::.. .....::.:::..:..:.::: ..:.:::: .:::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
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NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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: ... .
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]