Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5944
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5944, 312 aa
1>>>pF1KE5944 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7619+/-0.00143; mu= 13.3055+/- 0.084
mean_var=202.1463+/-73.453, 0's: 0 Z-trim(99.7): 422 B-trim: 327 in 1/49
Lambda= 0.090207
statistics sampled from 5329 (5841) to 5329 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1432 200.2 1.7e-51
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1400 196.1 3.1e-50
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1249 176.4 2.5e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1226 173.4 2e-43
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1190 168.7 5.1e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1077 154.0 1.4e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1057 151.4 8.3e-37
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1057 151.4 8.4e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1054 151.0 1.1e-36
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1051 150.7 1.5e-36
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1043 149.7 3.1e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1037 148.8 5.1e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1031 148.0 8.7e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1031 148.0 8.7e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1024 147.1 1.6e-35
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1022 146.9 2e-35
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1019 146.5 2.6e-35
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1015 145.9 3.7e-35
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1015 145.9 3.7e-35
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1009 145.2 6.4e-35
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1007 144.9 7.7e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1006 144.8 8.4e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1006 144.8 8.4e-35
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1003 144.4 1.1e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 998 143.7 1.7e-34
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 998 143.8 1.9e-34
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 997 143.6 1.9e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 997 143.6 1.9e-34
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 997 143.6 1.9e-34
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 996 143.5 2.1e-34
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 996 143.5 2.1e-34
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 994 143.2 2.5e-34
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 993 143.1 2.7e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 992 142.9 2.9e-34
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 992 143.0 3e-34
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 988 142.4 4.2e-34
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 988 142.5 4.3e-34
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 987 142.3 4.8e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 981 141.5 8e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 975 140.7 1.4e-33
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 969 140.0 2.5e-33
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 966 139.6 3.1e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 961 138.9 5e-33
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 959 138.6 5.8e-33
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 951 137.7 1.3e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 947 137.1 1.7e-32
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 946 137.0 1.9e-32
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 940 136.2 3.2e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 940 136.2 3.3e-32
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 928 134.6 9.5e-32
>>CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1430 init1: 1052 opt: 1432 Z-score: 1038.0 bits: 200.2 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1432; 70.4% identity (91.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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CCDS31 MGQHNLTVLTEFILMELTRRPELQIPLFGVFLVIYLITVVGNLTMIILTKLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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CCDS31 FSIRHLAFVDLGNSTVICPKVLANFVVDRNTISYYACAAQLAFFLMFIISEFFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYYVIMSQRLCHVLVGIQYLYSTFQALMFTIKIFTLTFCGSNVISHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFST
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CCDS31 DVPLLPMLCSNAQEIELLSILFSVFNLISSFLIVLVSYMLILLAICQMHSAEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
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CCDS31 CGSHLTVVVVFYGSLLFMYMQPNSTHFFDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNEEVKNA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
. . ..:
CCDS31 FYKLFEN
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1396 init1: 1028 opt: 1400 Z-score: 1015.4 bits: 196.1 E(32554): 3.1e-50
Smith-Waterman score: 1400; 69.2% identity (89.0% similar) in 308 aa overlap (3-306:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEQHN---LTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSR
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CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LQTPMYFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFI
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CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LSAMSYDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVI
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CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SHFYCDSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNS-AGR
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CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 QKAFSTCGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRN
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CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KDVKYALRRTWNNLCNIFV
:.:: ::.:: .:
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1052 init1: 836 opt: 1249 Z-score: 909.2 bits: 176.4 E(32554): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 1249; 58.8% identity (85.3% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
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pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRM-NSAGRQKAFST
..::: : ::.:. : ...: :: ....::.:::.::. :...::.. .: ::.:::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTD-KVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKY
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CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALRRTWNNLCNIFV
::.: .::: :
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1239 init1: 834 opt: 1226 Z-score: 893.0 bits: 173.4 E(32554): 2e-43
Smith-Waterman score: 1226; 58.0% identity (84.3% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
: .:.: :.::::::... ::: ::: .::..::... ::::.:.::..:::::.:::
CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
:::::::...:: ::...::::.::.: :. :.: :::::. :: :: ::...:..:.:
CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFST
::: : ::.:. : :..: :: .:. :.. ::.::. :...:::. : ::.:::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
:..:. .: :::::.::::.::...::.::::.::.::::::::::::::::::.::. :
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:.. .: : :
CCDS31 LKKFMENPCYSFKSM
310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1188 init1: 829 opt: 1190 Z-score: 867.8 bits: 168.7 E(32554): 5.1e-42
Smith-Waterman score: 1190; 58.4% identity (83.8% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
: . : : ..::::.:.:: ::. :::.::: ::...:.::::.:.: . :. :.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
::: .:::.:. ::... :::: ::. .:.::. :::::. ::.:. :: ..:..:.:
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFST
..::: : ::.:. .: :. :.: .:::::::..::..:. :::::.:: ::::::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
::.:. .: .:::::.:::.::.:::..::::.::.:::..:::::::::::.::.:: :
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:..
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1071 init1: 759 opt: 1077 Z-score: 788.2 bits: 154.0 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 1077; 53.1% identity (80.3% similar) in 305 aa overlap (5-307:11-315)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]