Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5936
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5936, 311 aa
1>>>pF1KE5936 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0293+/-0.00128; mu= 11.5510+/- 0.074
mean_var=144.3812+/-46.974, 0's: 0 Z-trim(101.8): 408 B-trim: 799 in 2/45
Lambda= 0.106738
statistics sampled from 6149 (6667) to 6149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 2060 329.8 1.7e-90
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 1243 204.0 1.3e-52
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 1198 197.1 1.5e-50
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 1182 194.6 8.6e-50
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 1169 192.6 3.5e-49
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 1166 192.1 4.6e-49
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 1024 170.3 1.7e-42
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 1004 167.2 1.5e-41
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 994 165.7 4.4e-41
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 964 161.0 1.1e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 958 160.1 2e-39
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 955 159.6 2.8e-39
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 943 157.8 1e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 941 157.5 1.3e-38
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 940 157.3 1.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 935 156.6 2.4e-38
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 933 156.3 2.9e-38
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 921 154.4 1.1e-37
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 920 154.2 1.2e-37
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 919 154.1 1.3e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 918 154.0 1.5e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 915 153.5 2e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 915 153.5 2e-37
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 913 153.2 2.6e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 912 153.0 2.7e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 910 152.7 3.4e-37
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 909 152.5 3.7e-37
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 905 151.9 5.8e-37
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 903 151.7 7.4e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 901 151.3 8.8e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 900 151.2 9.9e-37
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 900 151.2 1.1e-36
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 898 150.9 1.2e-36
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 897 150.7 1.4e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 897 150.7 1.4e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 896 150.5 1.5e-36
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 895 150.4 1.7e-36
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 895 150.4 1.7e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 894 150.2 1.9e-36
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 891 149.8 2.6e-36
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 890 149.6 2.8e-36
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 887 149.2 4.1e-36
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 885 148.9 4.9e-36
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 884 148.7 5.6e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 881 148.2 7.5e-36
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 881 148.2 7.5e-36
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 881 148.2 7.5e-36
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 881 148.3 7.6e-36
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 879 147.9 9.4e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 878 147.8 1e-35
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060 Z-score: 1738.3 bits: 329.8 E(32554): 1.7e-90
Smith-Waterman score: 2060; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPTGKQKAFSTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPTGKQKAFSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEALK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KLAYCQASRSD
:::::::::::
CCDS43 KLAYCQASRSD
310
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1226 init1: 628 opt: 1243 Z-score: 1058.2 bits: 204.0 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 1243; 57.8% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (1-299:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MELENQT-RVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPM
:: .:.. ::..:.:.:::. ... .: ..:.::.:...::..::. . .. :::::
CCDS77 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNS----ISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLL
::::::.:::: ::..::.::.: .: . ... ::: :: :::::..: :::::::
CCDS77 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AAMAYDRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVIN
:.::::::.::: :::::.:.: :: ..: :::: :::::..:...:: ::.::::.::
CCDS77 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFFCDISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQ
:::::.::.::::::::: .::.:::::. :.: :: .: :: : .... .:. :.
CCDS77 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNR
::::::::::.:: :::.: ::.::::... ::. ::..:..::...: :::.::::::.
CCDS77 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 EVKEALKKLAYCQASRSD
:::.::
CCDS77 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1215 init1: 864 opt: 1198 Z-score: 1020.9 bits: 197.1 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 1198; 56.4% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (9-309:9-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
: .:.::::: . .. .:..:.. :.::. ::..:.. . ::.:::
CCDS53 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
:::..::::: :::.::.:.:: .: . .. .:.. :: :::::::: ::::::::.:::
CCDS53 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
:::.::: :: ::..: .: ::: .::. :: :. :. ::: ::.::::.:::::::
CCDS53 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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pF1KE5 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQKAFST
:::.:::.:.: .:::::.::::..:.::. .: :: :.:.:: .:: :..:::::
CCDS53 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
::.::.::.:.::. .: :::::....:: :::::..:.:..: .:: ::::::.:::::
CCDS53 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKK--LAYCQASRSD
..: .. :. :
CCDS53 FRKTVMGRCHYPRDVQD
310
>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 1165 init1: 818 opt: 1182 Z-score: 1007.4 bits: 194.6 E(32554): 8.6e-50
Smith-Waterman score: 1182; 54.5% identity (81.3% similar) in 310 aa overlap (1-308:6-315)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPL
.:..:.: .:.:::.::: ... .: :::..:.::. ::..::: . .. :
CCDS30 MTTIILEVDNHTVTTRFILLGFPTRPAFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HKPMYFFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLL
::::::::..::::: ::..: ::.: .: : ..::::. :: :::::....::: .::
CCDS30 HKPMYFFLSHLSFLEMWYVTVISPKMLVDFLSHDKSISFNGCMTQLYFFVTFVCTEYILL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AAMAYDRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVIN
: ::.::::::: ::.::.::.. :: :: : : :. .. :. ::. : .:: ::
CCDS30 AIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCGMPQIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFFCDISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQ
:.::::::.::.:: : : .:.:::.:::... .:: ..: ::. :::::: .:. :.:
CCDS30 HYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPSAQGRQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNR
::::::::::.:: .::: .: ::::....:.: ::..:..:....: :::.::::::.
CCDS30 KAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIYCLRNH
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 EVKEALKKLAYCQASRSD
::: ::.: .:..:
CCDS30 EVKAALRKTIHCRGSGPQGNGAFSS
310 320
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
initn: 1193 init1: 868 opt: 1169 Z-score: 996.5 bits: 192.6 E(32554): 3.5e-49
Smith-Waterman score: 1169; 56.1% identity (83.2% similar) in 303 aa overlap (1-301:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
: :: ::: ::::::: . ... .::.::..:.....::. ::: : .. ::.:::
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
.::...:::: ::.: .::.: .: .. :::. :: ::::: .:.::::::::.:::
CCDS42 YFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
:::::::.::.: .... :::..:. :.. :: ::. :. ::: ..::: ::.::::::
CCDS42 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMP--TGKQKAFST
:::.:.:.:::.: .::::::::..:..:::. :.:::. : ..: .: :: .:: :
CCDS42 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRAFFT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
:::::.:::.::.:..:::.::..: . . ::.::..:...:: :::.::::::.: :.:
CCDS42 CASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEFKNA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LKKLAYCQASRSD
:::
CCDS42 LKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
310 320 330
>>CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 (312 aa)
initn: 1150 init1: 849 opt: 1166 Z-score: 994.3 bits: 192.1 E(32554): 4.6e-49
Smith-Waterman score: 1166; 55.3% identity (82.6% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
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CCDS46 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
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CCDS46 DRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHFFCD
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CCDS46 ISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATILSYWHITLAVLRIPSATGCWRAFST
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300 310
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CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
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CCDS31 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
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: :
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CCDS31 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYADCLSQLFIFTFLGATECFLLA
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CCDS31 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
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CCDS31 VKGALGRVFSLNFWKGQ
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