Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5925
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5925, 311 aa
1>>>pF1KE5925 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2712+/-0.000665; mu= 16.3557+/- 0.041
mean_var=111.8623+/-31.022, 0's: 0 Z-trim(105.0): 297 B-trim: 890 in 1/47
Lambda= 0.121264
statistics sampled from 12830 (13250) to 12830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.475), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16
Scan time: 5.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1130 209.6 6.6e-54
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 997 186.4 6.6e-47
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 967 181.1 2.5e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 937 175.9 9.7e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 936 175.7 1.1e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 936 175.7 1.1e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 936 175.7 1.1e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 911 171.3 2.3e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 911 171.3 2.3e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 911 171.3 2.3e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 910 171.1 2.5e-42
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 887 167.1 4.2e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 866 163.4 5.3e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 857 161.8 1.5e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 854 161.3 2.2e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 846 159.9 5.9e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 828 156.8 5.3e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 827 156.6 5.9e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 813 154.1 3.2e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 790 150.1 5.2e-36
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 561 110.1 6.1e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 540 106.4 7.9e-23
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 230 52.3 1.9e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 230 52.3 1.9e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 226 51.5 2.7e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 222 50.8 4.6e-06
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 212 49.1 1.6e-05
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 212 49.1 1.6e-05
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 212 49.1 1.7e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 212 49.2 1.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 200 46.9 6.4e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 200 47.0 6.7e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 46.8 7.1e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 193 45.7 0.00014
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 193 45.7 0.00015
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 193 45.7 0.00015
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 192 45.7 0.0002
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 188 44.9 0.00028
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 189 45.1 0.00028
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 184 44.2 0.00051
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 184 44.2 0.00051
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 183 44.0 0.00055
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 183 44.0 0.00055
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 183 44.1 0.00056
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 183 44.1 0.00056
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 175 42.0 0.00069
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1151 init1: 786 opt: 1130 Z-score: 1088.8 bits: 209.6 E(85289): 6.6e-54
Smith-Waterman score: 1130; 53.7% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLT-SNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
: :..:.. :
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 706 init1: 706 opt: 997 Z-score: 963.1 bits: 186.4 E(85289): 6.6e-47
Smith-Waterman score: 997; 48.7% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (4-310:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 NALIRVMQRRQDSR
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 973 init1: 697 opt: 967 Z-score: 934.7 bits: 181.1 E(85289): 2.5e-45
Smith-Waterman score: 967; 48.2% identity (75.2% similar) in 307 aa overlap (2-307:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS
: .: ::: ::. ...: ::. ..: ..: :: : .:.::.:..:..::..
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: :...:.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 956 init1: 707 opt: 937 Z-score: 906.3 bits: 175.9 E(85289): 9.7e-44
Smith-Waterman score: 937; 48.4% identity (75.8% similar) in 306 aa overlap (5-306:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSD-SEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
: :.. .::: ..:. :.: ::. :: :::.:. :: .::. : .::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMA
:::: .:::...... ::.:: :..::... :::.:: .::.:: :.:.::::::..::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTL--MVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEI--YAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEV
.:::.:::: :..:: . .::. :... : .. :. ::.: :::::.::::::.::
NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
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300 310
pF1KE5 KNALIRVMQRRQDSR
:::: :....
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 951 init1: 668 opt: 936 Z-score: 905.4 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 936; 46.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
:. :...: .:.: ::: . . : ::..:: .:: :.:::. .:: . .: ::::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLAN-LLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
:::..:::.:. .: . .:: ::: .: .. ::: ::..::.: .. . :::. :::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: .:. :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 951 init1: 668 opt: 936 Z-score: 905.4 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 936; 46.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
:. :...: .:.: ::: . . : ::..:: .:: :.:::. .:: . .: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLAN-LLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALS
..:.: ::: ::. :..: . :. .:.. .. : :::. : :.::. ::.:. ::.:
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKN
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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: .:. :
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 951 init1: 668 opt: 936 Z-score: 905.3 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 936; 46.1% identity (76.6% similar) in 308 aa overlap (1-306:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIR
:. :...: .:.: ::: . . : ::..:: .:: :.:::. .:: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE5 LDLQLHTPMYFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLAN-LLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAA
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 ECFLLSSMAYDRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCD
. :::. ::::..::.: ::.: . :...:: ::.: .:.. .: ..... :. : ::
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SNVVRHFFCDTSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVS-LITISASYVSILSTILKIN
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVII-LSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 STSGKQKALSTCASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLI
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE5 YSLRNKEVKNALIRVMQRRQDSR
:::::. .:.:: .:. :
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 891 init1: 583 opt: 911 Z-score: 881.7 bits: 171.3 E(85289): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 911; 46.3% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
.. :.:.:: . :. : . . ::. . . ::..:.::::::.: :..::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
... .
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 891 init1: 583 opt: 911 Z-score: 881.7 bits: 171.3 E(85289): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 911; 46.3% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
:: :.: : .::: :::.. .....::.:::..:..:.::: ..:.:::: .::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
:::::.:. ::: .:: :: :. .: .::.: :... .: .: .. . :. :.
NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
.. :.:.:: . :. : . . ::. . . ::..:.::::::.: :..::. :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
... .
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
::::: :.. ::. ::::..:..: :. .... ::::.:. :::::.::::::::::.:
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
... .
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
311 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 07:59:54 2016 done: Tue Nov 8 07:59:55 2016
Total Scan time: 5.850 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]