FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5925, 311 aa
1>>>pF1KE5925 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3188+/-0.00151; mu= 9.7478+/- 0.087
mean_var=191.2894+/-66.174, 0's: 0 Z-trim(99.8): 399 B-trim: 367 in 1/46
Lambda= 0.092732
statistics sampled from 5400 (5872) to 5400 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.496), E-opt: 0.2 (0.18), width: 16
Scan time: 2.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 2010 282.6 2.6e-76
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1804 255.1 5.2e-68
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1758 248.9 3.7e-66
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1205 174.9 6.9e-44
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1130 164.9 7.3e-41
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1087 159.1 4e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1074 157.4 1.3e-38
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1067 156.5 2.5e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1061 155.7 4.4e-38
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1060 155.5 4.8e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1053 154.6 9.3e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1047 153.8 1.7e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1042 153.1 2.6e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1042 153.1 2.6e-37
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1036 152.3 4.5e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1035 152.2 4.9e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1023 150.6 1.5e-36
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1022 150.5 1.7e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1018 150.0 2.6e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1017 149.8 2.6e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1013 149.2 3.8e-36
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1012 149.1 4.1e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1011 149.0 4.5e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1011 149.0 4.6e-36
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1010 148.8 5e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1008 148.6 6e-36
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1008 148.6 6.1e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1007 148.4 6.6e-36
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1007 148.5 7e-36
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1006 148.3 7.2e-36
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1005 148.2 8.1e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1005 148.2 8.1e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 997 147.1 1.7e-35
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 992 146.4 2.6e-35
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 987 145.8 4.2e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 987 145.8 4.2e-35
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 986 145.6 4.6e-35
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 981 144.9 7.2e-35
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 976 144.3 1.2e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 975 144.2 1.3e-34
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 974 144.0 1.4e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 974 144.0 1.4e-34
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 972 143.7 1.7e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 968 143.2 2.4e-34
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 968 143.3 2.7e-34
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 967 143.1 2.7e-34
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 967 143.1 2.7e-34
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 966 142.9 2.9e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 966 142.9 2.9e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 965 142.8 3.2e-34
>>CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2010 init1: 2010 opt: 2010 Z-score: 1483.4 bits: 282.6 E(32554): 2.6e-76
Smith-Waterman score: 2010; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCDT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 IRVMQRRQDSR
:::::::::::
CCDS31 IRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1804 init1: 1804 opt: 1804 Z-score: 1334.4 bits: 255.1 E(32554): 5.2e-68
Smith-Waterman score: 1804; 89.1% identity (96.1% similar) in 311 aa overlap (1-311:2-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
:::::.::: ::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
:::::::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::: :::::.:::.:::::::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
:::.::::::.: ::: :::: ::.::::::.:..:::::: ::::::::::...:::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
::::::::: :: . :..: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
:.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
::::::::::::
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1758 init1: 1758 opt: 1758 Z-score: 1301.1 bits: 248.9 E(32554): 3.7e-66
Smith-Waterman score: 1758; 87.5% identity (95.8% similar) in 311 aa overlap (1-311:2-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
::::::::: :::: ::. :::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
:::::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::::::.:::.:::.::::::.
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
:::.::::::.: :::::::: ::.::::::.::.:::::: :::::: ::::..:::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFYDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
::::::::: :::. ::.: :..::::::::.::::::: :: ::::::::::::::.::
CCDS31 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
:.::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPVLNPLIYSLRNKEVKNA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
.:::::::::::
CCDS31 VIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1133 init1: 822 opt: 1205 Z-score: 901.3 bits: 174.9 E(32554): 6.9e-44
Smith-Waterman score: 1205; 58.1% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
:. : :.: :::.:... :.:..::..::.:::.:.:::.:.: .::.: :::::::
CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNY-ISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
:::..:.:::. ::...:::.:.:. .. :::.:::.::.::: : :::::.::::
CCDS31 FFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
.::.:::.:: : :.::... : . ::::.: .:...: .: : ::::.. :::::
CCDS31 NRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-NHFFCD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
:. .:::::.::. :.. .::: ::. ::. :...:. :.:.::.:.:..:.:::.::
CCDS31 TTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
:::::..::::::..:::::.: .. :: . ::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS31 CASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKNA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
:.::..:.
CCDS31 LLRVIHRKLFP
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1151 init1: 786 opt: 1130 Z-score: 847.1 bits: 164.9 E(32554): 7.3e-41
Smith-Waterman score: 1130; 53.7% identity (82.3% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
: :.: :.. .:.: ::.:. :.:. ::..::.:: .:.:::.::::.::.: :::::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLT-SNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
:::..:::.:. ::.:::: ::.::. .. ::: ::: ::.::. :...::.:.. :::
CCDS31 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
:::.::: :: : .:::. . ...: .. ...: .::. .: : ::::::..:::::
CCDS31 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
. :.. ::: :: : . :::: ... .:..: .:: .: .:....: :...:.::
CCDS31 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
::::: .. .::.: :.:::.: .::::..:.:::::::.:::::::::::::.::::.:
CCDS31 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
: :..:.. :
CCDS31 LANVISRKRTSSFL
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1101 init1: 736 opt: 1087 Z-score: 816.0 bits: 159.1 E(32554): 4e-39
Smith-Waterman score: 1087; 52.8% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (5-310:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPMY
:::.: .:::.::.:. :.:. :::.::.:::::..::.::: .: :: ::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSN-YISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
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CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
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300 310
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CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 KDALWKVLERKKVFS
310
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CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
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: ...
CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
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CCDS31 LMKLLRRKISLSPG
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CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]