Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5924
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5924, 311 aa
1>>>pF1KE5924 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8530+/-0.000461; mu= 18.0246+/- 0.028
mean_var=105.7013+/-27.361, 0's: 0 Z-trim(108.7): 250 B-trim: 943 in 1/52
Lambda= 0.124748
statistics sampled from 16466 (16858) to 16466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 4.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1217 230.5 3.4e-60
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1145 217.6 2.7e-56
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1097 208.9 1.1e-53
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1082 206.2 6.8e-53
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 963 184.8 2e-46
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 963 184.8 2e-46
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 963 184.8 2e-46
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 931 179.0 1e-44
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 866 167.3 3.5e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 855 165.4 1.4e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 854 165.2 1.6e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 841 162.8 7.9e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 841 162.8 7.9e-40
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 841 162.9 8.1e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 840 162.7 9e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 811 157.4 3.4e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 809 157.1 4.3e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 781 152.0 1.4e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 779 151.7 1.9e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 702 137.8 2.7e-32
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 497 100.9 3.5e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 494 100.4 5.1e-21
NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 190 45.8 0.00017
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 186 45.0 0.00025
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 171 42.4 0.0018
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 171 42.4 0.0018
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 170 42.1 0.0018
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 165 41.2 0.0033
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 165 41.2 0.0036
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 166 41.6 0.0036
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 166 41.6 0.0037
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 163 40.9 0.0046
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 162 40.7 0.0052
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 163 41.0 0.0053
NP_001707 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 372) 162 40.7 0.0054
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 162 40.8 0.0055
NP_116743 (OMIM: 601613) C-X-C chemokine receptor ( 327) 161 40.5 0.0057
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 161 40.5 0.0058
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 163 41.1 0.0058
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 162 40.8 0.0058
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 162 40.8 0.0058
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 162 40.8 0.0058
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 160 40.3 0.0064
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 160 40.3 0.0065
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 160 40.3 0.0065
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 161 40.6 0.0067
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 160 40.4 0.0069
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 160 40.4 0.0069
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 160 40.4 0.0069
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1231 init1: 769 opt: 1217 Z-score: 1201.7 bits: 230.5 E(85289): 3.4e-60
Smith-Waterman score: 1217; 56.9% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (2-305:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAFDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FGTCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KGALWKVL-WRGRDSG
.::. ... :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 1133 init1: 683 opt: 1145 Z-score: 1131.7 bits: 217.6 E(85289): 2.7e-56
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (80.4% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
: ..: :. :
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 1048 init1: 627 opt: 1097 Z-score: 1085.0 bits: 208.9 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1097; 54.5% identity (78.9% similar) in 308 aa overlap (5-311:3-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
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pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
. ..: :.. :
NP_009 FRRLL--GKEMGLTQS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 1038 init1: 627 opt: 1082 Z-score: 1070.6 bits: 206.2 E(85289): 6.8e-53
Smith-Waterman score: 1082; 55.8% identity (79.6% similar) in 294 aa overlap (5-297:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
::::.::.:::::::: :::.:.:: : .::. : .:.::.:.::.:::.::.::::
XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
XP_011 GS
300
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 943 init1: 538 opt: 963 Z-score: 954.6 bits: 184.8 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 963; 47.1% identity (78.2% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFS-DWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
::. : .. . :::.:.: :: . . :::.....: .:..:: .:. : :: ::::::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDW-DTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFC
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
::.::: :: : :: ::.::.: . : . :. ..::.:.::.:::.::.::::.:::
NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
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NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 943 init1: 538 opt: 963 Z-score: 954.6 bits: 184.8 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 963; 47.1% identity (78.2% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFS-DWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
::. : .. . :::.:.: :: . . :::.....: .:..:: .:. : :: ::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDW-DTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 943 init1: 538 opt: 963 Z-score: 954.6 bits: 184.8 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 963; 47.1% identity (78.2% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFS-DWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDW-DTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
: :.::.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 940 init1: 461 opt: 931 Z-score: 923.6 bits: 179.0 E(85289): 1e-44
Smith-Waterman score: 931; 47.2% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMAF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCG-HRLNHFFCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 MPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFGT
:..: :: .::...: .:: :... .:. ::: :: .: .:...:::.: :::.:
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LWKVLWRGRDSG
: :: :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 862 init1: 425 opt: 866 Z-score: 860.2 bits: 167.3 E(85289): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 866; 45.7% identity (74.9% similar) in 291 aa overlap (12-300:12-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWP-QLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCG-HRLNHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
::.:::::: ::: :. ::. : : . :...: ::..::.:::.::.:::..::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
::
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 854 init1: 501 opt: 855 Z-score: 849.6 bits: 165.4 E(85289): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 855; 42.2% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (2-306:3-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGSFNTSFEDGFILVGFSDWPQLEPILFVFIFIFYSLTLFGNTIIIALSWLDLRLHTPM
:. : . :::.::::.:.. .::......: .: : .:.: .: .:::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSHLSLLDLCFTTSTVPQLLINLCGVDRTITRGGCVAQLFIYLALGSTECVLLVVMA
:::::.::..:.:. .::::..: :: ..::: ::. : ::. ..: .: :...::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYAAVCRPLHYMAIMHPHLCQTLAIASWGAGFVNSLIQTGLAMAMPLCGHR-LNHFFC
.:::::.: :: : .:: : :: ...... .:.. ::.: : . . .:: . ::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EMPVFLKLACADTEGTEAKMFLARVIVVAVPAALILGSYVHIAHAVLRVKSTAGRRKAFG
.:: .: :.:.:: ... . .. . : .:. :: .:. ..... :. :: :::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLLVVFLFYGSAIYTYLQSIHNYSEREGKFVALFYTIITPILNPLIYTLRNKDVKG
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
250 260 270 280 290 300
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pF1KE5 ALWKVLWRGRDSG
:: .. :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]