Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5922
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5922, 311 aa
1>>>pF1KE5922 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9063+/-0.00136; mu= 12.3712+/- 0.079
mean_var=187.4294+/-66.748, 0's: 0 Z-trim(101.6): 404 B-trim: 375 in 1/47
Lambda= 0.093682
statistics sampled from 6069 (6580) to 6069 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 2036 288.6 4.1e-78
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1348 195.7 4.3e-50
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1328 193.0 2.7e-49
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1302 189.4 3e-48
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1276 185.9 3.4e-47
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1276 185.9 3.4e-47
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1275 185.8 4e-47
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1269 184.9 6.5e-47
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1248 182.1 4.7e-46
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1245 181.7 6.2e-46
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1223 178.7 4.9e-45
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1170 171.6 7.1e-43
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1155 169.6 2.9e-42
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1146 168.3 6.7e-42
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1134 166.7 2.1e-41
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1125 165.5 4.8e-41
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1118 164.6 9.2e-41
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1118 164.6 9.2e-41
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1118 164.6 9.2e-41
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1116 164.3 1.1e-40
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1115 164.1 1.2e-40
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1110 163.5 1.9e-40
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1078 159.1 3.9e-39
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1060 156.7 2.1e-38
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1056 156.3 3.4e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1044 154.5 9.4e-38
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1044 154.6 9.5e-38
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1026 152.1 5.1e-37
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1025 152.0 5.6e-37
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1022 151.6 7.5e-37
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1012 150.2 1.9e-36
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1008 149.7 2.8e-36
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1006 149.4 3.3e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1003 149.0 4.4e-36
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 992 147.5 1.2e-35
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 987 146.8 2e-35
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 985 146.6 2.4e-35
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 983 146.4 3e-35
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 982 146.2 3.1e-35
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 977 145.5 5e-35
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 973 144.9 7.3e-35
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 972 144.8 8e-35
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 967 144.1 1.3e-34
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 958 142.9 3e-34
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 936 140.0 2.4e-33
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 930 139.1 4.1e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 914 137.0 1.9e-32
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 899 135.0 7.5e-32
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 896 134.5 9.9e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 895 134.4 1.1e-31
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 2036 init1: 2036 opt: 2036 Z-score: 1515.8 bits: 288.6 E(32554): 4.1e-78
Smith-Waterman score: 2036; 99.0% identity (99.4% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRNCHVNSWKN
::: :::::::
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1368 init1: 1342 opt: 1348 Z-score: 1012.8 bits: 195.7 E(32554): 4.3e-50
Smith-Waterman score: 1348; 63.4% identity (87.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:25-327)
10 20 30
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYV
: .::.: :.::::::::.: :: :.: ::..:.
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 TSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMYFLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEG
. .::: :::. .. ::.:..::::::.::::::.: ..::::::..::..:.:::::..
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 CMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAYDRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHS
:.:::: .: :.::::.:::.:::::..:::::::: :.:.::.::..: ::: :: .:.
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 VSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCDLPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALII
.:.:::::.:::::::.::::::::::: .:::.::: . .. ...::..::: :: :..
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTLTAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDKFLSVFYT
:::.::. :: :::.. .:: :::::::::: :::::::..:.::: ::: :.::::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 VCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWKLRNCHVNSWKN
. : .:::.::.:::..::::: ::..
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1337 init1: 1309 opt: 1328 Z-score: 998.5 bits: 193.0 E(32554): 2.7e-49
Smith-Waterman score: 1328; 62.0% identity (87.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
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CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
:::.::::.::::..::::::..::. :.:::: ::.:::: .: :.:.::.:::.:::
CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
::..::::::.: .::.:: :...: :::::...:..:.:.:::.::::::: :::::::
CCDS32 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
:: : .:::.:.: .::. ..:::..::: : :. :: :::. : .::.. .::.:::
CCDS32 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVWLKSSAAMAKAFSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
..::.::::::::::..:.::: :.::::..:::: ::.::::::.:::.:.:::. :
CCDS32 ASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAAVRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRNCHVNSWKN
. :
CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
310 320
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 1311 init1: 1286 opt: 1302 Z-score: 979.7 bits: 189.4 E(32554): 3e-48
Smith-Waterman score: 1302; 59.1% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
:.: .:::::::::::: ::.::: .::..::....:: ::.. . : ::.::::
CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
:::.:::.::. ..::::::..:.. ::::::.::..::: :: :.:.:..::.::..
CCDS32 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
::.:::::::::..... ..:: .: :: .::.::.:.. :.. :::::: ::::::::
CCDS32 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
::.:..:::.::: . .. ...::.:.::::..:. ::.:.:. :. .:: ::::::::
CCDS32 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
:::. ::.:::::::..:.::. . .::.::::::. :: ::::::.:::..:: :: :
CCDS32 TAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRNCHVNSWKN
:.: .:
CCDS32 LKNRFLNFNKAMPS
310
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1278 init1: 1253 opt: 1276 Z-score: 960.8 bits: 185.9 E(32554): 3.4e-47
Smith-Waterman score: 1276; 61.8% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
: ..:.:.::::.:::::.: .::..:: ::.:.: ::::.::.: ..::: :..:::
CCDS32 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
::::::: ::. ..::::::.:::. :.::::. ::..:.: .: . :::::::::::
CCDS32 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
::..:::::::: :::. :. . .. :.::: .:: :..:: . ::::::: .::::::
CCDS32 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
:::::.::: ::: ........:::.:: ::: :..:: .:...:: :..: ::::.:::
CCDS32 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFRRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
.:::::: :::.::...:.::: : :::.::::::. :::::::::.:::..::::. :
CCDS32 SAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNQEVKAAI-K
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LRNCHVNSWKN
: :
CCDS32 KRLCI
300
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1307 init1: 1161 opt: 1276 Z-score: 960.7 bits: 185.9 E(32554): 3.4e-47
Smith-Waterman score: 1276; 62.5% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNS-PM
: : :.:::::: :: .: :: ::: .: :::. .:::.::.: . : :.: ::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
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180 190 200 210 220 230
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CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
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240 250 260 270 280 290
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CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
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300 310
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CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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CCDS32 FSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQK
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CCDS32 VISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWL
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CCDS32 FIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKF
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CCDS32 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
310 320 330 340
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CCDS32 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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CCDS32 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQ
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310
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::
CCDS32 LRKWDAHSSVKF
300
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CCDS32 LRKWDAHSSVKF
300
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pF1KE5 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIEHKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
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CCDS30 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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pF1KE5 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
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pF1KE5 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
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CCDS30 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL
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CCDS30 LRKWDAHSSVKF
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]