Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5918, 310 aa
1>>>pF1KE5918 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8151+/-0.000578; mu= 18.9018+/- 0.036
mean_var=132.7884+/-42.096, 0's: 0 Z-trim(106.0): 304 B-trim: 864 in 1/50
Lambda= 0.111300
statistics sampled from 13653 (14097) to 13653 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.495), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16
Scan time: 4.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 999 172.9 7.3e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 868 151.9 1.6e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 822 144.5 2.6e-34
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 803 141.4 2.1e-33
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 788 139.0 1.1e-32
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 786 138.7 1.4e-32
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 786 138.7 1.5e-32
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 778 137.4 3.5e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 775 137.0 4.9e-32
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 764 135.2 1.7e-31
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 135.2 1.7e-31
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 764 135.2 1.7e-31
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 753 133.4 5.7e-31
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 738 131.0 3e-30
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 737 130.9 3.4e-30
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 734 130.4 4.7e-30
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 726 129.1 1.1e-29
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 716 127.5 3.4e-29
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 672 120.5 4.8e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 486 90.6 4.6e-18
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 482 89.9 7.2e-18
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 227 49.2 1.9e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 208 46.1 0.00014
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 208 46.1 0.00015
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 208 46.1 0.00015
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 208 46.1 0.00015
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 206 45.6 0.00015
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 206 45.7 0.00017
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 203 45.2 0.00023
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 203 45.3 0.00026
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 203 45.4 0.00027
NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 198 44.4 0.0004
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 198 44.5 0.00045
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 196 44.2 0.00055
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 196 44.2 0.00056
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 195 44.0 0.00059
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 195 44.0 0.00059
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 196 44.3 0.00062
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 191 43.3 0.00088
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 187 42.6 0.0013
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 186 42.5 0.0016
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 184 42.1 0.0019
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 180 41.6 0.0031
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 180 41.6 0.0032
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 177 41.1 0.0043
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 176 40.8 0.0045
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 175 40.7 0.0053
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 175 40.7 0.0053
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 170 39.8 0.0083
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 999; 46.4% identity (77.6% similar) in 304 aa overlap (3-306:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVI
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ASFTKMFKRNDV
. :...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 868; 42.7% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
......:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 822; 42.6% identity (72.3% similar) in 303 aa overlap (5-307:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPM
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pF1KE5 YDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYC
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pF1KE5 DIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIA
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 SFTKMFKRNDV
.. .. ::
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 831 init1: 666 opt: 803 Z-score: 720.5 bits: 141.4 E(85289): 2.1e-33
Smith-Waterman score: 803; 39.9% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
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pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
:.. : : .:::.: :. :. . ::...: .::.:..::: ::... : .:: :::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
..: ::...: .:.... . :...:...:.:... : .:. : : :.: :::.:.:
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSV--SVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
. :. ::
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 779 init1: 779 opt: 788 Z-score: 707.5 bits: 139.0 E(85289): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 788; 39.2% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (5-305:2-302)
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pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
: ...:::.. :. .:. . .:: ::..::....::. .: . . :: :::
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
..: .:: :: . ..:. ::: ..:.. . :: . : ::: :. :. .: :..::::
NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
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pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
: ::: .: . :: .::.. .. . . . ::: :.. .::. ..:.: ::::::
NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
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310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
. :.:
NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 776 init1: 776 opt: 786 Z-score: 705.7 bits: 138.7 E(85289): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 786; 39.7% identity (69.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
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pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
: : . ..::.: :. ::: . ::. :: .:: :..::: .: . : :: :::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
..:.::.::: .: ... ::: : . ... ::. : :.. . : . ::::.:::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
. :. :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
..:.::.::: .: ... ::: : . ... ::. : :.. . : . ::::.:::
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pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
. :. :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 776 init1: 776 opt: 786 Z-score: 705.6 bits: 138.7 E(85289): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 786; 39.7% identity (69.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIW
: : . ..::.: :. ::: . ::. :: .:: :..::: .: .
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pF1KE5 KDPHLHIPMYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 ECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCN
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pF1KE5 SNIIQHFYCDIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKS
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300 310
pF1KE5 SLRNKQVIASFTKMFKRNDV
::::. . ... :. :
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 841 init1: 775 opt: 778 Z-score: 698.8 bits: 137.4 E(85289): 3.5e-32
Smith-Waterman score: 778; 38.2% identity (72.1% similar) in 301 aa overlap (5-304:8-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHI
::. :.:.:: :. .. .:.. :..::.:..::: .: . . : :::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISV-TTECFLLA
:::..:.::.:.: ..: ..:.:. . : :: . : :::. :.... :::: ::.
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLY-FVLALGTTECVLLV
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pF1KE5 TMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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:.:.. ::..: .:. .: : ..: .. . .. . .: :: .. .::. .:. :..:
NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
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pF1KE5 VIASFTKMFKRNDV
: .. ..
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 821 init1: 775 opt: 775 Z-score: 696.2 bits: 137.0 E(85289): 4.9e-32
Smith-Waterman score: 775; 39.2% identity (72.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
:: :: : :..:.: :. .:. . :: :: .::.:..::: .: .. .: ::: :::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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NP_001 LERLLSRADSCP
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]