Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5918, 310 aa
1>>>pF1KE5918 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9901+/-0.00147; mu= 12.0788+/- 0.086
mean_var=204.4296+/-72.684, 0's: 0 Z-trim(100.3): 394 B-trim: 368 in 1/45
Lambda= 0.089702
statistics sampled from 5584 (6046) to 5584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 2001 272.8 2.4e-73
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1786 244.9 5.8e-65
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1751 240.4 1.3e-63
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1749 240.2 1.6e-63
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1623 223.8 1.3e-58
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1235 173.6 1.7e-43
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1100 156.2 3.1e-38
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1054 150.2 1.9e-36
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1049 149.6 3e-36
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1035 147.8 1.1e-35
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 999 143.1 2.7e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 998 143.0 2.9e-34
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 997 142.9 3.4e-34
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 996 142.7 3.5e-34
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 994 142.4 4.1e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 979 140.5 1.6e-33
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 977 140.3 2e-33
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 972 139.6 3e-33
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 969 139.2 4e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 965 138.7 5.6e-33
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 963 138.4 6.7e-33
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 953 137.2 1.7e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 942 135.7 4.5e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 938 135.2 6.4e-32
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 935 134.8 8.3e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 934 134.7 9e-32
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 930 134.2 1.3e-31
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 929 134.0 1.4e-31
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 928 133.9 1.6e-31
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 914 132.1 5.4e-31
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 912 131.8 6.5e-31
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 908 131.3 9.3e-31
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 906 131.1 1.1e-30
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 905 130.9 1.2e-30
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 904 130.8 1.3e-30
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 904 130.8 1.4e-30
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 901 130.4 1.7e-30
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 900 130.3 1.9e-30
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 887 128.6 6.1e-30
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 886 128.5 6.7e-30
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 886 128.6 7.2e-30
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 884 128.2 8.1e-30
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 883 128.1 8.8e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 880 127.7 1.2e-29
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 875 127.0 1.8e-29
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 875 127.0 1.8e-29
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 875 127.0 1.8e-29
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 873 126.8 2.2e-29
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 872 126.7 2.4e-29
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 868 126.1 3.4e-29
>>CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 2001 init1: 2001 opt: 2001 Z-score: 1430.2 bits: 272.8 E(32554): 2.4e-73
Smith-Waterman score: 2001; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
::::::::::
CCDS33 FTKMFKRNDV
310
>>CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1835 init1: 1786 opt: 1786 Z-score: 1279.7 bits: 244.9 E(32554): 5.8e-65
Smith-Waterman score: 1786; 88.0% identity (95.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
::::::::::: .::.:: ::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:.:::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
::: ::: :::::::::::::.::::::.: :.:.:: :::..:::::: ::.::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
:::::.::::::::: :.:.: ::::::::::.: ::::::.:::::.::::::::: .:
CCDS33 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
::::.:..
CCDS33 FTKMLKKHVKVSY
310
>>CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1751 Z-score: 1255.3 bits: 240.4 E(32554): 1.3e-63
Smith-Waterman score: 1751; 86.4% identity (95.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
::::::::::: .::.:: ::: :::::::::::::::::.::.::.:::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
:::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::::::::::::::::..:.:::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
::: ::: :::::::::::::.::::::.: :.:::: :::.:.:.::: ::.::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
:::::.:: :::::: .::.: :::::: :.:.: ::::::.:::::.::::::::::.:
CCDS33 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FTKMFKRNDV
: ::.:::
CCDS33 FIKMLKRNVKVSY
310
>>CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 (325 aa)
initn: 1799 init1: 1749 opt: 1749 Z-score: 1253.7 bits: 240.2 E(32554): 1.6e-63
Smith-Waterman score: 1749; 86.7% identity (95.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:17-324)
10 20 30 40
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSF
::..:::::::::::::.::.:::::: :::.:: :::::::::::::::::: .:.::.
CCDS33 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDASLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AISVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLF
. .::::::::::::::::::::: ::::.:::: :::.::.::..::::::::::.: :
CCDS33 VTTVTTECFLLATMAYDRYVAICKALLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYT
:::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::::.:::: ..:.:
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ILKKKSVKGMRKAFSTCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
::.:::.::.::: :::::::::::::::::.: :.::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLTFKYLGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKRNDV
:::::::::::::::::::::: :
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1623 init1: 1623 opt: 1623 Z-score: 1165.7 bits: 223.8 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1623; 78.9% identity (93.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHL
::..:.::::::::::. :::.::.::::.:::::::::. ::::::.::.::.:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HIPMYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLL
:::::..::.:::::: .::.:: :::.:::::..::::::: ::.::::.. :::::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQ
::::::::::::::::::.::.:.:::::: .:..::.::::::: ..:::::::::::.
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HFYCDIIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMR
:::::::::. :: :: :::::::::..:::::::: ::: :: :.:.::::::::.:.:
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNK
:::::::::::::::::::: :::. ::::::::::..:.:::.:.:::::.:::::::
CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 QVIASFTKMFKRNDV
::: ::::: :::
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1252 init1: 1225 opt: 1235 Z-score: 894.4 bits: 173.6 E(32554): 1.7e-43
Smith-Waterman score: 1235; 60.9% identity (83.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYLLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATM
:::.::.::: :: :.:.: .::.::: :. ::::.:: :.. :: :.:::::::. :
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
70 80 90 100 110 120
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CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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CCDS33 HALRRVIRK
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CCDS43 LRKILMKK
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CCDS33 CASHFLSVSIFYICL-LMYIGPS--EEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
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CCDS33 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
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CCDS33 LRKILLKIKSQGSVNK
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]