Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5914
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5914, 310 aa
1>>>pF1KE5914 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7523+/-0.00118; mu= 13.3662+/- 0.068
mean_var=193.2548+/-69.253, 0's: 0 Z-trim(104.1): 411 B-trim: 439 in 1/49
Lambda= 0.092259
statistics sampled from 7230 (7755) to 7230 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 1.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 2055 286.8 1.4e-77
CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 1625 229.6 2.4e-60
CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 1610 227.6 9.7e-60
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1521 215.7 3.6e-56
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1521 215.7 3.6e-56
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1403 200.0 1.9e-51
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1358 194.0 1.2e-49
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1328 190.0 1.9e-48
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1313 188.1 7.8e-48
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 961 141.2 9.8e-34
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 954 140.3 1.9e-33
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 952 140.0 2.3e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 952 140.0 2.3e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 950 139.7 2.7e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 943 138.8 5.2e-33
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 940 138.4 6.9e-33
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 939 138.3 7.5e-33
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 938 138.2 8.4e-33
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 937 138.1 9.5e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 937 138.1 9.7e-33
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 936 137.9 9.9e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 936 137.9 1e-32
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 935 137.7 1.1e-32
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 934 137.6 1.2e-32
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 933 137.5 1.3e-32
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 927 136.7 2.3e-32
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 926 136.6 2.6e-32
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 917 135.3 5.7e-32
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 916 135.2 6.2e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 916 135.2 6.3e-32
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 916 135.3 6.6e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 911 134.5 9.9e-32
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 910 134.4 1.1e-31
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 907 134.0 1.4e-31
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 907 134.0 1.5e-31
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 906 133.9 1.6e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 905 133.7 1.7e-31
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 905 133.7 1.7e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 904 133.6 1.9e-31
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 903 133.5 2.1e-31
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 901 133.2 2.5e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 901 133.2 2.5e-31
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 901 133.2 2.5e-31
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 900 133.1 2.7e-31
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 900 133.1 2.8e-31
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 899 132.9 3e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 899 133.0 3e-31
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 899 133.0 3e-31
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 898 132.8 3.3e-31
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 896 132.5 4e-31
>>CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 2055 init1: 2055 opt: 2055 Z-score: 1506.1 bits: 286.8 E(32554): 1.4e-77
Smith-Waterman score: 2055; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
::::::::::
CCDS43 KRMLEKKRTS
310
>>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1737 init1: 1623 opt: 1625 Z-score: 1196.8 bits: 229.6 E(32554): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 1625; 80.2% identity (89.3% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
:: : ::::::::::::.::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::.::::
CCDS55 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
::::::::::: ::.:::.:::::::::::::::: : : ::: .:: ::::::::::::
CCDS55 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
:::::::::: .::::.::::::.::: ::::.:.:::::::: :: :::. ::::::
CCDS55 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
.:::::::::::::: ::::::.: ::: . . :.::. ::::::.::: : .::: :
CCDS55 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
:::::.:::::::::::: :.: .::::::::::::::::::::::: ::::.::..::
CCDS55 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
::.: .:
CCDS55 KRVLGVERAL
310
>>CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 (310 aa)
initn: 1722 init1: 1608 opt: 1610 Z-score: 1186.0 bits: 227.6 E(32554): 9.7e-60
Smith-Waterman score: 1610; 79.5% identity (88.6% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
:: : ::: ::::::::.::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::.::::
CCDS51 MGDNITSIREFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
::::::::::: ::.:::.:::::::::::::::: : : ::: .:: ::::::::::::
CCDS51 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
:::::::::: .::::.::::::.::: ::::.:.:::::::: :: :::. ::::::
CCDS51 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
.:::::::::::::: ::::::.: ::: . . :.::. ::::::.::: : .::: :
CCDS51 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFRTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
:::::.:: ::::::::: :.: .::::::::::::::::::::::: ::::.::..::
CCDS51 FSHLCVIGLVYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
::.: .:
CCDS51 KRVLGVERAL
310
>>CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1573 init1: 1521 opt: 1521 Z-score: 1122.0 bits: 215.7 E(32554): 3.6e-56
Smith-Waterman score: 1521; 73.2% identity (88.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
:: ::: .:::::::: .:::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::
CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
::::::::::: . .::::::.::::::::::::::::: :: :::.:.::::::.::::
CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
::::::::::::.::::.::::::.::: : ::::.:.::.: : : ::...:::::::
CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
..::.:::::: .:.:...:. : ::: ...:: ::: :::.:::::: .:::: :
CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
::::::::::.:.:::::. :. . :.::.: ..::.:.::: :::::::::: ::.:.:
CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
.: : :. :
CCDS56 RRALGKESHS
310
>>CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 (310 aa)
initn: 1573 init1: 1521 opt: 1521 Z-score: 1122.0 bits: 215.7 E(32554): 3.6e-56
Smith-Waterman score: 1521; 73.2% identity (88.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
:: ::: .:::::::: .:::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::
CCDS43 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNLLHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSYD
::::::::::: . .::::::.::::::::::::::::: :: :::.:.::::::.::::
CCDS43 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYVAICHPLRYSTIMTWKVCITLALTSWILGVLLALVHLVLLLPLSFCGPQKLNHFFCEI
::::::::::::.::::.::::::.::: : ::::.:.::.: : : ::...:::::::
CCDS43 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MAVLKLACADTHINEVMVLAGAVSVLVGAFFSTVISYVHILCAILKIQSGEGCQKAFSIC
..::.:::::: .:.:...:. : ::: ...:: ::: :::.:::::: .:::: :
CCDS43 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSHLCVVGLFYGTAIIMYVEPQYESPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLIYSLRNKEVQGTL
::::::::::.:.:::::. :. . :.::.: ..::.:.::: :::::::::: ::.:.:
CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
.: : :. :
CCDS43 RRALGKESHS
310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1483 init1: 1008 opt: 1403 Z-score: 1037.1 bits: 200.0 E(32554): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1403; 66.5% identity (86.8% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGNQTSITEFLLLGFPIGPRIQMLLFGLFSLFYIFILLGNGTILGLISLDSRLHTPMYF
: ::: .:::.:::::.. :::::: :::::.:.: :::::.::::: :::::::::::
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FLSHLAVVDIACACSTVPQMLVNL-LHPAKPISFAGCMTQMFLFLSFAHTECLLLVVMSY
::::::..::. : ..::.::.:: :. : :::. : : ::...:::::::.::.:::
CCDS43 FLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMSY
70 80 90 100 110 120
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CCDS43 ILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFILVGPLCLVLVSYSRILAAILRIQSGEGRRKAFST
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310
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CCDS43 MESNQTWITEVILLGFQVDPALELFLFGFFLLFYSLTLMGNGIILGLIYLDSRLHTPMYV
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310
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CCDS43 KRVLWKQRSM
310
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CCDS43 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF
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CCDS43 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD
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CCDS43 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC
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310
pF1KE5 KRMLEKKRTS
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CCDS43 RRALRKERLT
310
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CCDS43 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD
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CCDS43 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI
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CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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CCDS10 LKKVVGRVVFSV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]