Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5910
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5910, 310 aa
1>>>pF1KE5910 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9608+/-0.000481; mu= 17.9646+/- 0.030
mean_var=79.0921+/-19.450, 0's: 0 Z-trim(107.7): 288 B-trim: 1710 in 2/50
Lambda= 0.144214
statistics sampled from 15351 (15732) to 15351 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 4.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1115 242.2 1.1e-63
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1032 224.9 1.7e-58
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 992 216.6 5.3e-56
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 931 203.9 3.5e-52
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 931 203.9 3.6e-52
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 890 195.3 1.3e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 869 191.0 2.7e-48
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 868 190.8 3.1e-48
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 868 190.8 3.1e-48
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 864 189.9 5.5e-48
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 847 186.4 6.4e-47
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 829 182.6 8.5e-46
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 826 182.0 1.3e-45
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 824 181.6 1.8e-45
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 818 180.4 4.2e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 808 178.3 1.8e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 788 174.1 3.2e-43
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 788 174.1 3.2e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 788 174.1 3.2e-43
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 475 109.0 1.3e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 422 98.0 2.7e-20
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 173 46.2 0.00011
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 173 46.2 0.00011
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 171 45.9 0.00019
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 171 46.0 0.0002
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 163 44.1 0.00046
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 158 43.1 0.0011
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 157 42.9 0.0011
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 157 42.9 0.0013
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 157 43.0 0.0015
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 156 42.7 0.0015
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 157 43.1 0.0016
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 155 42.5 0.0017
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 154 42.2 0.0017
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 154 42.3 0.0019
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 154 42.3 0.0019
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 152 41.9 0.0024
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 152 41.9 0.0024
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 152 41.9 0.0026
XP_011530312 (OMIM: 162641) PREDICTED: neuropeptid ( 384) 151 41.7 0.0029
NP_000900 (OMIM: 162641) neuropeptide Y receptor t ( 384) 151 41.7 0.0029
XP_005263088 (OMIM: 162641) PREDICTED: neuropeptid ( 384) 151 41.7 0.0029
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 149 41.3 0.0039
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 149 41.3 0.0039
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 149 41.3 0.0044
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 149 41.3 0.0045
XP_005245113 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 149 41.4 0.0049
XP_011507680 (OMIM: 612250) PREDICTED: G-protein c ( 529) 149 41.4 0.0049
NP_001254539 (OMIM: 612250) G-protein coupled rece ( 529) 149 41.4 0.0049
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1110 init1: 1090 opt: 1115 Z-score: 1264.7 bits: 242.2 E(85289): 1.1e-63
Smith-Waterman score: 1115; 54.8% identity (80.7% similar) in 305 aa overlap (5-308:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTP
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pF1KE5 MYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVM
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 EALKK-LKNKILF
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 1082 init1: 1022 opt: 1032 Z-score: 1171.3 bits: 224.9 E(85289): 1.7e-58
Smith-Waterman score: 1032; 49.2% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310
pF1KE5 LKKLKNKILF
: .. ..
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 992; 48.4% identity (78.4% similar) in 306 aa overlap (5-307:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPM
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pF1KE5 DIPPLLLLSCSDT---QVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFK
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFG---IASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSK
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pF1KE5 ALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKD
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NP_001 AFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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pF1KE5 VKEALKKLKNKILF
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NP_001 IKDALKRLQKRKCC
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
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pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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310
pF1KE5 LKKLKNKILF
:::. ....:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 969 init1: 924 opt: 931 Z-score: 1057.8 bits: 203.9 E(85289): 3.5e-52
Smith-Waterman score: 931; 43.2% identity (78.1% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
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pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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310
pF1KE5 LKKLKNKILF
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 969 init1: 924 opt: 931 Z-score: 1057.6 bits: 203.9 E(85289): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 931; 43.2% identity (78.1% similar) in 310 aa overlap (1-310:11-320)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIR
:. : ::...:.:::.. .:... ::. ::..:. . .:: .:. .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 MDYQLHTPMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADS
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ECLLLSVMAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNEINHFFCDIPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEGRFKALSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 SLRNKDVKEALKKLKNKILF
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 873 init1: 737 opt: 890 Z-score: 1011.8 bits: 195.3 E(85289): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 890; 45.9% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LKKLKNKILF
:.:. ..
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 812 init1: 788 opt: 869 Z-score: 988.1 bits: 191.0 E(85289): 2.7e-48
Smith-Waterman score: 869; 43.3% identity (74.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:8-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAFDRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCDIPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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pF1KE5 LSTCTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE5 KEALKKLKNKILF
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 901 init1: 862 opt: 868 Z-score: 987.0 bits: 190.8 E(85289): 3.1e-48
Smith-Waterman score: 868; 41.7% identity (76.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
::. :: .:: ::: :. .: ::. . ... . .:.:. : :: : ..:: ::::.
NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
.: ..::.: .:..::... ... . ..:...:: :. :.. . :..:..::.::
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KE5 CTSHLSAVAIFQGTLLFMYFRPSSSYSLDQDKMTSLFYTLVVPMLNPLIYSLRNKDVKEA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKLKNKILF
:..: ..
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 901 init1: 868 opt: 868 Z-score: 986.9 bits: 190.8 E(85289): 3.1e-48
Smith-Waterman score: 868; 42.8% identity (76.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDWENCSSLTDFFLLGITNNPEMKVTLFAVFLAVYIINFSANLGMIVLIRMDYQLHTPMY
:: : :. : :.:::... :... ::.:.: .:.... .: .:.. :.: .::::::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMAF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYKAIINPLLYTVNMSSRVCYLLLTGVYLVGIADALIHMTLAFRLCFCGSNEINHFFCD
:: :: .:: : : :. :.: :.. .. :.:..: ...:: :: .:..::. .
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IPPLLLLSCSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKALST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
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: .:
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
310 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]