Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5909
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5909, 310 aa
1>>>pF1KE5909 310 - 310 aa - 310 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8208+/-0.00126; mu= 12.6287+/- 0.073
mean_var=151.3668+/-50.672, 0's: 0 Z-trim(101.5): 389 B-trim: 733 in 2/45
Lambda= 0.104246
statistics sampled from 6078 (6561) to 6078 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 1970 309.1 2.9e-84
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 1491 237.0 1.4e-62
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1152 186.0 3.1e-47
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1034 168.3 6.9e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1004 163.8 1.6e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 990 161.7 6.8e-40
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 979 160.0 2.1e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 973 159.1 4.1e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 961 157.3 1.4e-38
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 960 157.2 1.6e-38
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 956 156.6 2.3e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 954 156.3 2.9e-38
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 946 155.1 6.8e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 942 154.5 1e-37
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 941 154.3 1.1e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 941 154.3 1.2e-37
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 940 154.2 1.2e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 937 153.7 1.7e-37
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 936 153.6 2.1e-37
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 934 153.3 2.5e-37
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 929 152.5 3.9e-37
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 928 152.3 4.4e-37
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 926 152.0 5.3e-37
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 926 152.1 5.7e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 924 151.7 6.6e-37
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 923 151.6 7.3e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 922 151.4 8.1e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 921 151.3 9e-37
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 920 151.1 1e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 919 151.0 1.1e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 918 150.8 1.2e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 918 150.8 1.2e-36
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 915 150.4 1.7e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 915 150.4 1.7e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 912 149.9 2.3e-36
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 912 149.9 2.3e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 907 149.2 3.9e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 907 149.2 4e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 904 148.7 5.3e-36
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 904 148.8 5.4e-36
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 903 148.6 5.9e-36
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 901 148.3 7.2e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 900 148.1 8e-36
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 899 148.0 9e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 890 146.6 2.3e-35
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 890 146.6 2.3e-35
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 890 146.7 2.4e-35
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 888 146.4 3e-35
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 882 145.4 5.4e-35
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 879 145.0 7.1e-35
>>CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1970 init1: 1970 opt: 1970 Z-score: 1626.3 bits: 309.1 E(32554): 2.9e-84
Smith-Waterman score: 1970; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPAGSQAKTFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPAGSQAKTFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEAL
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RKILNRAKLS
::::::::::
CCDS31 RKILNRAKLS
310
>>CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1514 init1: 1110 opt: 1491 Z-score: 1236.9 bits: 237.0 E(32554): 1.4e-62
Smith-Waterman score: 1491; 73.5% identity (90.9% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
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CCDS31 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
:.::::...:.:::: .::::::: :::...: .::::::::::::.::::::::.:::
CCDS31 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
::: :::::::::::.:..:: .::.::::::..::.::::.::::::::..::.:::::
CCDS31 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGI-PAGSQAKTFST
:::::::.::.::::::.::.::.::.:: ..:::::::::::::. : ::..::::::
CCDS31 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:.::::::.:::::::::::: :. :::: .:::::::: : ::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRKILNRAKLS
:: :...:
CCDS31 TRKALSKSKPARRP
310
>>CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1165 init1: 811 opt: 1152 Z-score: 961.4 bits: 186.0 E(32554): 3.1e-47
Smith-Waterman score: 1152; 55.9% identity (85.5% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
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CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
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CCDS31 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
::: :. .::::.. .. . :::.:::: :. .:..::. .:::::: ..:.:.:::
CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPA-GSQAKTFST
:::::::.:... . :..::.:. ::: :. :::.:::.:: .:. . . :..::::::
CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:.::.:::.::::.::::::...: .: :...::::.:: :::::::::::::::.::.:
CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRKILNRAKLS
.::. : ..:
CCDS31 FRKVARRLQVSLSM
310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1055 init1: 984 opt: 1034 Z-score: 865.5 bits: 168.3 E(32554): 6.9e-42
Smith-Waterman score: 1034; 51.8% identity (81.8% similar) in 303 aa overlap (5-306:3-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
: : ::::.:...:. :. .::.: :::.::::.::: :...: : .::.:::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
:.::.:...:. ::: ..:. .:.: :.:: ::::::.:. :....::::: :::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
::. :::.:: :.: .: . :..:.::.:...: ......: :::::..::. .:::
CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGI-PAGSQAKTFST
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CCDS31 IPPLLALSCSDTRISK-LVVFVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:.:::::.:.:.::.:::::. ::.:: . ....::.:: :::::::::::::::::: :
CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRKILNRAKLS
: ::::.
CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1041 init1: 711 opt: 1004 Z-score: 840.9 bits: 163.8 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 1004; 45.9% identity (83.2% similar) in 303 aa overlap (5-306:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPM
: :.::.:.:......:. . ::.::: .::.:. :: .: :: :: .:: ::
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMA
::.::.:.:.:.:: : :.:.::. .. . ..:.. ::.:.:.: .: .:.::: ::
CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFC
:::: :.:.::::...... :..:.::::.:..:....: :.. .::: :. .::
CCDS31 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPAGS-QAKTFS
::::.: :.:....:.::. .. .. : .:..:.:.:: .:..:.. : ... ..:.::
CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKE
::.::::::.::.:. .:::.: .:. : ....:::..:. :::..::.:::.::::.:.
CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALRKILNRAKLS
:.:: ..:
CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 973 init1: 686 opt: 990 Z-score: 829.7 bits: 161.7 E(32554): 6.8e-40
Smith-Waterman score: 990; 50.0% identity (78.9% similar) in 308 aa overlap (5-310:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
: : ::::.:...:. :: .:::..:::.::::..::: :: :::.: ::.:::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 DRYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCD
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGI--PAGSQAKTFS
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQ-KAFS
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CCDS31 TCASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKS
240 250 260 270 280 290
300 310
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CCDS31 AFKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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300 310
pF1KE5 KEVKEALRKILNRAKLS
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
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CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
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CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
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CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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290 300 310
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CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
310 320
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CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]