Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5908
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5908, 310 aa
1>>>pF1KE5908 310 - 310 aa - 310 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0345+/-0.000522; mu= 17.8407+/- 0.032
mean_var=111.1249+/-28.538, 0's: 0 Z-trim(107.8): 336 B-trim: 918 in 1/53
Lambda= 0.121666
statistics sampled from 15486 (15901) to 15486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.513), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 6.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1102 205.0 1.5e-52
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 736 140.8 3.4e-33
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 736 140.8 3.5e-33
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 735 140.6 3.9e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 702 134.8 2.1e-31
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 698 134.1 3.4e-31
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 691 132.9 8.1e-31
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 688 132.4 1.2e-30
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 677 130.4 4.5e-30
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 674 129.9 6.4e-30
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 668 128.9 1.3e-29
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 663 128.0 2.4e-29
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 662 127.8 2.8e-29
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 659 127.3 4e-29
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 659 127.3 4e-29
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 659 127.3 4e-29
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 642 124.3 3.2e-28
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 632 122.6 1.1e-27
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 630 122.2 1.4e-27
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 540 106.4 7.8e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 443 89.4 1e-17
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 231 52.2 1.7e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 214 49.2 1.4e-05
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 212 48.9 1.8e-05
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 212 48.9 1.8e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 210 48.5 2.2e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 207 48.0 3.3e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 202 47.1 6e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 200 46.8 7.7e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 197 46.2 0.0001
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 197 46.3 0.00011
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 197 46.3 0.00011
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 197 46.4 0.00013
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 197 46.5 0.00014
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855649 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 197 46.5 0.00015
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1098 init1: 1098 opt: 1102 Z-score: 1064.2 bits: 205.0 E(85289): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 1102; 51.5% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAVDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCDLQ
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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pF1KE5 PLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYVIFLHSLRNHSAEVIKKALSTCVS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
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pF1KE5 HIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSAMRKLW
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SKKLITDDKR
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NP_001 SRKDISGDK
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 771 init1: 576 opt: 736 Z-score: 716.9 bits: 140.8 E(85289): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 736; 38.6% identity (72.5% similar) in 298 aa overlap (5-299:7-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMF
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYV-IFLHSLRNHSAEVIKKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDK--MIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLWSKKLITDDKR
..:.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 771 init1: 576 opt: 736 Z-score: 716.9 bits: 140.8 E(85289): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 736; 38.6% identity (72.5% similar) in 298 aa overlap (5-299:7-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMF
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAV
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYV-IFLHSLRNHSAEVIKKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDK--MIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVKSA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLWSKKLITDDKR
..:.
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 771 init1: 576 opt: 736 Z-score: 716.8 bits: 140.8 E(85289): 3.5e-33
Smith-Waterman score: 736; 38.6% identity (72.5% similar) in 298 aa overlap (5-299:17-314)
10 20 30 40
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVK
..:.::.::::...: ...:::.:: .::.:.:::::::.::.
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 TSQALKNPMFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCL
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EIFILILTAVDRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PNVINHCFCDLQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYV-IFLHSLRNHS
:.:.: :::. :::: .::.:.. .....:... . . .. .. ::. : :. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 AEVIKKALSTCVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVFPMDK--MIAVFYTVGTSFLNPVIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300 310
pF1KE5 TLKNTEVKSAMRKLWSKKLITDDKR
.:.: .:.:..:.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 740 init1: 560 opt: 735 Z-score: 716.0 bits: 140.6 E(85289): 3.9e-33
Smith-Waterman score: 735; 38.9% identity (69.4% similar) in 301 aa overlap (7-304:11-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNP
::::::::. : . .::..:: :: :.::. ... .. . :..:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MFFFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILT
:.::: ::. : : ..:.:.:.:. : .. .::. : .: . .:. : :::
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AVDRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLQPLLKQACSETYVVNLLLVSNSGAICAVSYVMLIFSYV-IFLHSLRNHSAEVIKKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCVSHIIVVILFFGPCIFMYTCLATVF-P-MDKMIAVFYTVGTSFLNPVIYTLKNTEVK
:::.::. : .. : .:.:. . .. : ::.:.::::. :::.::.:.: .::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 SAMRKLWSKKLITDDKR
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 703 init1: 502 opt: 702 Z-score: 684.7 bits: 134.8 E(85289): 2.1e-31
Smith-Waterman score: 702; 37.7% identity (70.2% similar) in 305 aa overlap (2-304:3-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQLNNN-VTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMF
:.:.. ::::.::::.. : ...::...: .:: :.:::::.: :.... :..::.
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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300 310
pF1KE5 KLWSKKLITDDKR
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NP_003 KVATRNFP
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initn: 692 init1: 500 opt: 698 Z-score: 681.0 bits: 134.1 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 698; 37.8% identity (71.2% similar) in 299 aa overlap (7-301:6-303)
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NP_001 RYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEI
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NP_001 PPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
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NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
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pF1KE5 RKLWSKKLITDDKR
::...
NP_001 RKVFAFLKH
300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 692 init1: 503 opt: 691 Z-score: 674.2 bits: 132.9 E(85289): 8.1e-31
Smith-Waterman score: 691; 39.6% identity (65.4% similar) in 298 aa overlap (10-304:10-307)
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pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMFFF
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NP_009 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
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NP_009 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
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NP_009 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
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pF1KE5 KLWSKKLITDDKR
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NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMF
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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:.:. .. :.:
NP_003 KKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 672 init1: 516 opt: 677 Z-score: 661.0 bits: 130.4 E(85289): 4.5e-30
Smith-Waterman score: 677; 37.8% identity (68.2% similar) in 299 aa overlap (7-302:9-307)
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pF1KE5 MQLNNNVTEFILLGLTQDPFWKKILFVIFLRLYLGTLLGNLLIIISVKTSQALKNPMF
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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pF1KE5 FFLFYLSLSDTCLSTSIAPRMIVDALLKKTTISFSECMIQVFSSHVFGCLEIFILILTAV
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVDICKPLHYMTIISQWVCGVLMAVAWVGSCVHSLVQIFLALSLPFCGPNVINHCFCD
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