Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5901
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5901, 309 aa
1>>>pF1KE5901 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7538+/-0.00122; mu= 13.0275+/- 0.071
mean_var=166.0341+/-54.998, 0's: 0 Z-trim(102.7): 398 B-trim: 438 in 1/49
Lambda= 0.099535
statistics sampled from 6608 (7082) to 6608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1994 299.3 2.5e-81
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1357 207.8 8.6e-54
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1303 200.1 1.9e-51
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1262 194.3 1.2e-49
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1261 194.1 1.2e-49
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1249 192.3 4e-49
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1242 191.3 8e-49
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1240 191.0 9.8e-49
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1232 189.9 2.2e-48
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1229 189.5 2.9e-48
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1226 189.0 4e-48
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1209 186.6 2.1e-47
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1205 186.0 3.2e-47
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1203 185.7 3.9e-47
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1201 185.4 4.7e-47
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1183 182.9 2.8e-46
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1110 172.4 4.1e-43
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1069 166.5 2.4e-41
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 1053 164.2 1.2e-40
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1051 163.9 1.5e-40
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1050 163.8 1.6e-40
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 1048 163.5 2e-40
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 1037 161.9 5.9e-40
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1029 160.8 1.4e-39
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1021 159.7 3e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1009 157.9 9.6e-39
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 1008 157.7 1.1e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1005 157.3 1.4e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1004 157.2 1.6e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 993 155.6 4.6e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 993 155.6 4.6e-38
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 982 154.0 1.4e-37
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 974 152.8 3e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 973 152.7 3.5e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 970 152.3 4.6e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 967 151.8 6.1e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 964 151.4 8.4e-37
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 957 150.4 1.7e-36
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 948 149.1 4.1e-36
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 946 148.8 5e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 946 148.8 5e-36
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 940 147.9 9e-36
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 938 147.7 1.1e-35
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 937 147.5 1.2e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 937 147.5 1.2e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 934 147.1 1.7e-35
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 931 146.7 2.2e-35
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 931 146.7 2.3e-35
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 930 146.5 2.5e-35
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 928 146.2 3e-35
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1994 init1: 1994 opt: 1994 Z-score: 1573.7 bits: 299.3 E(32554): 2.5e-81
Smith-Waterman score: 1994; 99.4% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIVYTLRNKDMKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKLLSGKL
:::::::::
CCDS31 LRKLLSGKL
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1373 init1: 1350 opt: 1357 Z-score: 1079.2 bits: 207.8 E(32554): 8.6e-54
Smith-Waterman score: 1357; 64.7% identity (88.4% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPVY
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CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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CCDS31 FFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
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CCDS31 DRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
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CCDS31 VPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIVYTLRNKDMKEA
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CCDS31 CSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKLLSGKL
:: :. :
CCDS31 LRTLILGSAAGQSHKD
310
>>CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1328 init1: 1303 opt: 1303 Z-score: 1037.3 bits: 200.1 E(32554): 1.9e-51
Smith-Waterman score: 1303; 62.3% identity (87.2% similar) in 305 aa overlap (5-309:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHT
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CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PVYFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLAD
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CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MALDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHF
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CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 ICEVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKA
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CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIVYTLRNKDM
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CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KEALRKLLSGKL
: ::.:.:. :
CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1274 init1: 1252 opt: 1262 Z-score: 1004.9 bits: 194.3 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1262; 59.5% identity (86.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPVY
:. :.: ..:::: :::.: :: ::. :: :.::. ::.:::..:..: ::::.:
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
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CCDS46 FFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
::..:.:.:::: .::. ::: :::. ::.::...:....:.::..::::....:::.::
CCDS46 DRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
:::::::.:::::.:: :: .::::..:: .:: :::.::.::::::.:.:...:::.:
CCDS46 VPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRKAFGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIVYTLRNKDMKEA
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CCDS46 CGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKLLSGKL
...:.. .:
CCDS46 FKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKFP
310 320 330 340 350
>>CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 (320 aa)
initn: 1292 init1: 1252 opt: 1261 Z-score: 1004.7 bits: 194.1 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1261; 59.3% identity (83.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPVY
: .: ::: :::::::.::..: .: : .:::.::::: .::. : :: ::::.:
CCDS46 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMAL
::: :::.::.:::::. :: :::: : :::.: ::. :::. . :::.::.::: :.
CCDS46 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFICE
::. :.:::::: :.:::.:: .. . : .::.:.. :.::.:: :::. ::::.::
CCDS46 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFST
.:::.:.::::::. :. .:......:. : :: ::::.:..:::: :: ...::..:
CCDS46 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIVYTLRNKDMKEA
:.:::::: .:::::::.::::.. ..:::::..::::..::.:::..:::::::::.:
CCDS46 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKDMKDA
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LRKLLSGKL
:.::.
CCDS46 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS
310 320
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1258 init1: 1239 opt: 1249 Z-score: 995.3 bits: 192.3 E(32554): 4e-49
Smith-Waterman score: 1249; 57.7% identity (86.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:2-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPV
: ..: :: :.::::: .: ::.:::. :: ::.....:: ::..:. : ::::.
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMA
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CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
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120 130 140 150 160 170
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFS
:.: ...::::::..::. ....: .:::.: .:: .::: :..:::.:.:.:.:.:::.
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
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240 250 260 270 280 290
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CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
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300
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CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
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CCDS34 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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CCDS34 FRRLL-GKEMGLTQS
300 310
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CCDS46 FFLSDLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLGCSVQLFIFLSLGTTECILLTVMAF
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CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE
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CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQAVLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFNT
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CCDS10 CLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKGA
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CCDS10 LRRLL-GKGREVG
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]