Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5830, 1059 aa
1>>>pF1KE5830 1059 - 1059 aa - 1059 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8855+/-0.000441; mu= -10.3774+/- 0.028
mean_var=555.8296+/-115.875, 0's: 0 Z-trim(124.9): 1856 B-trim: 546 in 1/60
Lambda= 0.054401
statistics sampled from 45331 (47408) to 45331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.556), width: 16
Scan time: 14.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_149104 (OMIM: 610671) zinc finger protein 628 [ (1059) 7465 601.4 8.6e-171
XP_005259428 (OMIM: 610671) PREDICTED: zinc finger (1055) 7440 599.5 3.3e-170
XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 1313 118.4 1.5e-25
XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 1313 118.5 1.5e-25
XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1313 118.5 1.6e-25
XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 1313 118.5 1.6e-25
XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 1313 118.5 1.6e-25
XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25
NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 1313 118.5 1.7e-25
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 1034 96.5 5.4e-19
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 1034 96.5 5.5e-19
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 1034 96.5 5.6e-19
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 1034 96.5 5.6e-19
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 1034 96.5 5.6e-19
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 1034 96.5 5.6e-19
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1033 96.6 7.8e-19
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1033 96.6 7.8e-19
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19
XP_016882695 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 450) 933 88.4 9.9e-17
NP_003413 (OMIM: 194550) myeloid zinc finger 1 iso ( 734) 933 88.6 1.4e-16
NP_932172 (OMIM: 194550) myeloid zinc finger 1 iso ( 734) 933 88.6 1.4e-16
XP_011525566 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 764) 933 88.6 1.4e-16
XP_005259261 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 775) 933 88.6 1.5e-16
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 902 86.0 5.8e-16
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 902 86.0 5.8e-16
XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16
XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16
XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16
XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16
>>NP_149104 (OMIM: 610671) zinc finger protein 628 [Homo (1059 aa)
initn: 7465 init1: 7465 opt: 7465 Z-score: 3187.3 bits: 601.4 E(85289): 8.6e-171
Smith-Waterman score: 7465; 99.8% identity (100.0% similar) in 1059 aa overlap (1-1059:1-1059)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGVMVGSHADMAPASTAEGAGEKPGPAAPAPAAQYECGECGKSFRWSSRLLHHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MSGVMVGSHADMAPASTAEGAGEKPGPAAPAPAAQYECGECGKSFRWSSRLLHHQRTHTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ERPYKCPDCPKAFKGSSALLYHQRGHTGERPYQCPDCPKAFKRSSLLQIHRSVHTGLRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 ERPYKCPDCPKAFKGSSALLYHQRGHTGERPYQCPDCPKAFKRSSLLQIHRSVHTGLRAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ICGQCGLAFKWSSHYQYHLRQHTGERPYPCPDCPKAFKNSSSLRRHRHVHTGERPYTCGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 ICGQCGLAFKWSSHYQYHLRQHTGERPYPCPDCPKAFKNSSSLRRHRHVHTGERPYTCGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CGKSFTQSTNLRQHQRVHTGERPFRCPLCPKTFTHSSNLLLHQRTHGAAPAPGAASAAPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_149 CGKSFTQSTNLRQHQRVHTGERPFRCPLCPKTFTHSSNLLLHQRTHGAAPAPGTASAAPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PQSREPGKVFVCDAYLQRHLQPHSPPAPPAPPPPPPPVVPELFLAAAETTVELVYRCDGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 PQSREPGKVFVCDAYLQRHLQPHSPPAPPAPPPPPPPVVPELFLAAAETTVELVYRCDGC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 EQGFSSEELLLEHQPCPGPDAAPQPQEAPAEAPKADQPPSPLPQPPPPAAAPAPGFACLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 EQGFSSEELLLEHQPCPGPDAAPQPQEAPAEAPKADQPPSPLPQPPPPAAAPAPGFACLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CGKSFRTVAGLSRHQHSHGAAGGQAFRCGSCDGSFPQLASLLAHQQCHVEEAAAGRPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 CGKSFRTVAGLSRHQHSHGAAGGQAFRCGSCDGSFPQLASLLAHQQCHVEEAAAGRPPPQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 AEAAEVTCPQEPLAPAAPAPPPPPSAPASAERPYKCAECGKSFKGSSGLRYHLRDHTGER
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 AEAAEVTCPQEPLAPAAPVPPPPPSAPASAERPYKCAECGKSFKGSSGLRYHLRDHTGER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PYQCGECGKAFKRSSLLAIHQRVHTGLRAFTCGQCGLTFKWSSHYQYHLRLHSGERPYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 PYQCGECGKAFKRSSLLAIHQRVHTGLRAFTCGQCGLTFKWSSHYQYHLRLHSGERPYAC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GECGKAFRNTSCLRRHRHVHTGERPHACGVCGKSFAQTSNLRQHQRVHTGERPFRCPLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 GECGKAFRNTSCLRRHRHVHTGERPHACGVCGKSFAQTSNLRQHQRVHTGERPFRCPLCP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 KTFTHSSNLLLHQRTHSAERPFTCPICGRGFVMAAYLQRHLRTHAPANTPPSTTAPAAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 KTFTHSSNLLLHQRTHSAERPFTCPICGRGFVMAAYLQRHLRTHAPANTPPSTTAPAAGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 QPPAPLAAARAPPATQDVHVLPHLQATLSLEVAGGTAQAPSLGPAAPNSQTFLLVQTAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 QPPAPLAAARAPPATQDVHVLPHLQATLSLEVAGGTAQAPSLGPAAPNSQTFLLVQTAQG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 LQLIPSSVQPPTPPPPPAPPKLILLPSSSAGAGGGRARQGPRAVGKAGQGAGVVWLPGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LQLIPSSVQPPTPPPPPAPPKLILLPSSSAGAGGGRARQGPRAVGKAGQGAGVVWLPGPG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 GLGVQGAASAGASGTGQSLIVLQNVGGGEAGPQEMSGVQLQPLRPAPEVTTVQLQPAQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 GLGVQGAASAGASGTGQSLIVLQNVGGGEAGPQEMSGVQLQPLRPAPEVTTVQLQPAQEV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 TTVQLQPAQEVTTVQLQPAQEVTTVQLQPVAGQLSNSSGGAVATEAPNLLVVQSGAAEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 TTVQLQPAQEVTTVQLQPAQEVTTVQLQPVAGQLSNSSGGAVATEAPNLLVVQSGAAEEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 LTGPGPGEAGDGEASTGVVQDVLFETLQTDEGLQSVLVLSGADGEQTRLCVQEVETLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LTGPGPGEAGDGEASTGVVQDVLFETLQTDEGLQSVLVLSGADGEQTRLCVQEVETLPPG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 LTEPPATGPPGQKLLIIRSAPATELLDSSNTGGGTATLQLLAPPPSGPASGPAGLPGAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LTEPPATGPPGQKLLIIRSAPATELLDSSNTGGGTATLQLLAPPPSGPASGPAGLPGAPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KE5 SQMVQVVPAGAGPGVMTPQGLPSIQIVQTLPAVQLVHTF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 SQMVQVVPAGAGPGVMTPQGLPSIQIVQTLPAVQLVHTF
1030 1040 1050
>>XP_005259428 (OMIM: 610671) PREDICTED: zinc finger pro (1055 aa)
initn: 7440 init1: 7440 opt: 7440 Z-score: 3176.7 bits: 599.5 E(85289): 3.3e-170
Smith-Waterman score: 7440; 99.8% identity (100.0% similar) in 1055 aa overlap (5-1059:1-1055)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSGVMVGSHADMAPASTAEGAGEKPGPAAPAPAAQYECGECGKSFRWSSRLLHHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVGSHADMAPASTAEGAGEKPGPAAPAPAAQYECGECGKSFRWSSRLLHHQRTHTG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ERPYKCPDCPKAFKGSSALLYHQRGHTGERPYQCPDCPKAFKRSSLLQIHRSVHTGLRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ERPYKCPDCPKAFKGSSALLYHQRGHTGERPYQCPDCPKAFKRSSLLQIHRSVHTGLRAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ICGQCGLAFKWSSHYQYHLRQHTGERPYPCPDCPKAFKNSSSLRRHRHVHTGERPYTCGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ICGQCGLAFKWSSHYQYHLRQHTGERPYPCPDCPKAFKNSSSLRRHRHVHTGERPYTCGV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CGKSFTQSTNLRQHQRVHTGERPFRCPLCPKTFTHSSNLLLHQRTHGAAPAPGAASAAPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_005 CGKSFTQSTNLRQHQRVHTGERPFRCPLCPKTFTHSSNLLLHQRTHGAAPAPGTASAAPP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PQSREPGKVFVCDAYLQRHLQPHSPPAPPAPPPPPPPVVPELFLAAAETTVELVYRCDGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PQSREPGKVFVCDAYLQRHLQPHSPPAPPAPPPPPPPVVPELFLAAAETTVELVYRCDGC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 EQGFSSEELLLEHQPCPGPDAAPQPQEAPAEAPKADQPPSPLPQPPPPAAAPAPGFACLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EQGFSSEELLLEHQPCPGPDAAPQPQEAPAEAPKADQPPSPLPQPPPPAAAPAPGFACLP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CGKSFRTVAGLSRHQHSHGAAGGQAFRCGSCDGSFPQLASLLAHQQCHVEEAAAGRPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CGKSFRTVAGLSRHQHSHGAAGGQAFRCGSCDGSFPQLASLLAHQQCHVEEAAAGRPPPQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 AEAAEVTCPQEPLAPAAPAPPPPPSAPASAERPYKCAECGKSFKGSSGLRYHLRDHTGER
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AEAAEVTCPQEPLAPAAPVPPPPPSAPASAERPYKCAECGKSFKGSSGLRYHLRDHTGER
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PYQCGECGKAFKRSSLLAIHQRVHTGLRAFTCGQCGLTFKWSSHYQYHLRLHSGERPYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PYQCGECGKAFKRSSLLAIHQRVHTGLRAFTCGQCGLTFKWSSHYQYHLRLHSGERPYAC
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GECGKAFRNTSCLRRHRHVHTGERPHACGVCGKSFAQTSNLRQHQRVHTGERPFRCPLCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GECGKAFRNTSCLRRHRHVHTGERPHACGVCGKSFAQTSNLRQHQRVHTGERPFRCPLCP
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 KTFTHSSNLLLHQRTHSAERPFTCPICGRGFVMAAYLQRHLRTHAPANTPPSTTAPAAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KTFTHSSNLLLHQRTHSAERPFTCPICGRGFVMAAYLQRHLRTHAPANTPPSTTAPAAGP
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 QPPAPLAAARAPPATQDVHVLPHLQATLSLEVAGGTAQAPSLGPAAPNSQTFLLVQTAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QPPAPLAAARAPPATQDVHVLPHLQATLSLEVAGGTAQAPSLGPAAPNSQTFLLVQTAQG
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 LQLIPSSVQPPTPPPPPAPPKLILLPSSSAGAGGGRARQGPRAVGKAGQGAGVVWLPGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQLIPSSVQPPTPPPPPAPPKLILLPSSSAGAGGGRARQGPRAVGKAGQGAGVVWLPGPG
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 GLGVQGAASAGASGTGQSLIVLQNVGGGEAGPQEMSGVQLQPLRPAPEVTTVQLQPAQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLGVQGAASAGASGTGQSLIVLQNVGGGEAGPQEMSGVQLQPLRPAPEVTTVQLQPAQEV
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 TTVQLQPAQEVTTVQLQPAQEVTTVQLQPVAGQLSNSSGGAVATEAPNLLVVQSGAAEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTVQLQPAQEVTTVQLQPAQEVTTVQLQPVAGQLSNSSGGAVATEAPNLLVVQSGAAEEL
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 LTGPGPGEAGDGEASTGVVQDVLFETLQTDEGLQSVLVLSGADGEQTRLCVQEVETLPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTGPGPGEAGDGEASTGVVQDVLFETLQTDEGLQSVLVLSGADGEQTRLCVQEVETLPPG
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 LTEPPATGPPGQKLLIIRSAPATELLDSSNTGGGTATLQLLAPPPSGPASGPAGLPGAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTEPPATGPPGQKLLIIRSAPATELLDSSNTGGGTATLQLLAPPPSGPASGPAGLPGAPA
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050
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..:..:: :.:.::::.:..: : :.: .:: :. : . : . :
XP_016 SNSSGLRVHKRIHTGEKPYECDECGKAFITCRTLLNHKSIH---------FGDKPYKCDE
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: : .. : .: :. : : . . : : :.:: : ..
XP_016 CEKSFNYSSLLIQHKVIHTGEKPYECDECGKAFRNSSGLIVHKRIHTGEKPYKCDVCGKA
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310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FSSEELLLEHQPC-PGPDAAPQPQEAPAEAPKADQPPSPLPQPPPPAAAPAPGFACLPCG
:: : :. :: : .: : :. . : : : .. : ..: ::
XP_016 FSYSSGLAVHKSIHPGKKA----HECK-ECGKSFSYNSLLLQHRTIHTGERP-YVCDVCG
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:.::. :::. :.. : .: . ..: : .. . .:: :. :.
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: ::: . : :..:: ::.:. : :: ::: :: : ::.:::: :.:..: : :.
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: :::::: .. : :..:: ::.: : :::::. .: : ::.:.::::.:. : :
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:.: .::.: .:.: :..:.:. : ::.... . : : .:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]