Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5817
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5817, 847 aa
1>>>pF1KE5817 847 - 847 aa - 847 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6728+/-0.00054; mu= 18.4641+/- 0.033
mean_var=67.5504+/-13.564, 0's: 0 Z-trim(106.2): 43 B-trim: 81 in 2/53
Lambda= 0.156049
statistics sampled from 14329 (14346) to 14329 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.168), width: 16
Scan time: 8.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002854 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosphory ( 847) 5610 1273.1 0
NP_001157412 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosph ( 813) 4844 1100.6 0
NP_002853 (OMIM: 138550) glycogen phosphorylase, b ( 843) 4741 1077.4 0
NP_005600 (OMIM: 232600,608455) glycogen phosphory ( 842) 4686 1065.1 0
NP_001158188 (OMIM: 232600,608455) glycogen phosph ( 754) 3652 832.2 0
>>NP_002854 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosphorylase (847 aa)
initn: 5610 init1: 5610 opt: 5610 Z-score: 6820.6 bits: 1273.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5610; 100.0% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 SNKVNGN
:::::::
NP_002 SNKVNGN
>>NP_001157412 (OMIM: 232700,613741) glycogen phosphoryl (813 aa)
initn: 4841 init1: 4841 opt: 4844 Z-score: 5888.9 bits: 1100.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5308; 96.0% identity (96.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-813)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
::::::::::::::::::::: :::::
NP_001 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPK----------------------------------LGLDI
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 SNKVNGN
:::::::
NP_001 SNKVNGN
810
>>NP_002853 (OMIM: 138550) glycogen phosphorylase, brain (843 aa)
initn: 4772 init1: 4740 opt: 4741 Z-score: 5763.3 bits: 1077.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4741; 81.9% identity (94.4% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
:::::::.:::.:::.::..:. .:::..::::::::::::::::::: :::.:::::::
NP_002 MAKPLTDSEKRKQISVRGLAGLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
::::::::::::::::.. :::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
NP_002 RDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: .:::::::
NP_002 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
::::::::::::.:::.::::::::.:::: :.::.:::::::.::::::::: :::::
NP_002 DDWLRYGNPWEKARPEYMLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
:::::::.:::::.:.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TMRLWSAKAPNDFKLQDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
:::::::::::::.:::: . : :..:::.::::::::::::.:::::::.::.::.
NP_002 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
:.::::.:.:: :::::::::::::::::.. :::::::::::: :::.:::...::::
NP_002 DWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLLPRHLEIIYAINQRHLDHVAALFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
:::::::::.::: :::::::::..:::::::::.:::.::: .::::: ::::.::
NP_002 GDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
:::::::::::::::::::::. :.:::::... ::::: :: ...:.::.:..:::::
NP_002 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
::::::: ::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::.:: : ::
NP_002 ENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAKAFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 PRTVIIGGKAAPGYHMAKMIIKLITSVADVVNNDPMVGSKLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
::::.:::::::::::::.::::.::..::::.::.::..::::::::::::::::::::
NP_002 PRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:..::
NP_002 ADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
:::.:::.:.:::. ::::: ..:::..::::::.:: ::::.:::..::::::::::::
NP_002 ALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 YVKCQDKVSQLYMNPKAWNTMVLKNIAASGKFSSDRTIKEYAQNIWNVEPSDLKISLSNE
:..:: .:.::: ::: :. :..::: :::::::::: :::..::.::::::.: :
NP_002 YMQCQAQVDQLYRNPKEWTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 SNKVNGN
NP_002 PRD
>>NP_005600 (OMIM: 232600,608455) glycogen phosphorylase (842 aa)
initn: 4675 init1: 4675 opt: 4686 Z-score: 5696.4 bits: 1065.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4686; 80.0% identity (94.1% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
:..::.:::::.:::.::..:::::.::::.::::::::::::::::: :::::::::::
NP_005 MSRPLSDQEKRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RDHLVGRWIRTQQHYYDKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDI
::::::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::.::.:.:::::: ::::::.
NP_005 RDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMVNLALENACDEATYQLGLDM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.:::
NP_005 EELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKISGGWQMEEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DDWLRYGNPWEKSRPEFMLPVHFYGKVEHTNTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVN
::::::::::::.:::: :::::::.::::. :.::.:::::::.::::::::: ::.::
NP_005 DDWLRYGNPWEKARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
:::::::.:::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VAATLQDIIRRFKASKFGSTRGAGTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKL
:::::::::::::.:::: . : ::::::.::::::::::.:::::::::.::.:..
NP_005 VAATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRILVDLERM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 PWSKAWELTQKTFAYTNHTVLPEALERWPVDLVEKLLPRHLEIIYEINQKHLDRIVALFP
:.:::..: .: ::::::::::::::::: :.: ::::::.:::::::. :.:..: ::
NP_005 DWDKAWDVTVRTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHLQIIYEINQRFLNRVAAAFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KDVDRLRRMSLIEEEGSKRINMAHLCIVGSHAVNGVAKIHSDIVKTKVFKDFSELEPDKF
::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.: .:::: :::: ::
NP_005 GDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKF
430 440 450 460 470 480
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pF1KE5 QNKTNGITPRRWLLLCNPGLAELIAEKIGEDYVKDLSQLTKLHSFLGDDVFLRELAKVKQ
:::::::::::::.::::::::.:::.::::...::.:: :: ::. :..:.:..:::::
NP_005 QNKTNGITPRRWLVLCNPGLAEVIAERIGEDFISDLDQLRKLLSFVDDEAFIRDVAKVKQ
490 500 510 520 530 540
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pF1KE5 ENKLKFSQFLETEYKVKINPSSMFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITMYNRIKKDPKKLFV
::::::. .:: ::::.:::.:.::.::::::::::::::::::::.:::::..:.:.::
NP_005 ENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDIQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKREPNKFFV
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::::.::::::::::::::::.:.:...::::.:: ::..:.::::::::::::::::::
NP_005 PRTVMIGGKAAPGYHMAKMIIRLVTAIGDVVNHDPAVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPA
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pF1KE5 TDLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMAEEAGEENLFIFGMRIDDVA
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..::
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pF1KE5 ALDKKGYEAKEYYEALPELKLVIDQIDNGFFSPKQPDLFKDIINMLFYHDRFKVFADYEA
::..::.:.:::. .:::. ::.:...::::::::::::::.:::..:::::::::::
NP_005 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
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:.:::.::: :: ::. :. ::..:::.:::::::::: .::..::.:::: .. .:
NP_005 YIKCQEKVSALYKNPREWTRMVIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDE
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pF1KE5 SNKVNGN
.
NP_005 AI
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pF1KE5 MAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKSFNRHLHFTLVKDRNVATTRDYYFALAHTV
:..::.:::::.:::.::..:::::.::::.::::::::::::::::: :::::::::::
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::::::::::::::::.: ::
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:: :::.:::
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::::::::::::.:::: :::::::.::::. :.::.:::::::.::::::::: ::.::
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:::::::.:::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::.:::: . : ::::::.::::::::::.:::::::::.::.:..
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:.:::..: .: ::::::::::::::::: :.: ::::::.:::::::. :.:..: ::
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::::::::::.:: . ::::::::::.:::::::::.:::.:.: .:::: :::: ::
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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::..::
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NP_001 KLDQRGYNAQEYYDRIPELRQVIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYED
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.
NP_001 AI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]