Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5792
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5792, 656 aa
1>>>pF1KE5792 656 - 656 aa - 656 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0124+/-0.00038; mu= 16.7884+/- 0.024
mean_var=88.8198+/-17.504, 0's: 0 Z-trim(115.0): 17 B-trim: 201 in 1/50
Lambda= 0.136088
statistics sampled from 25096 (25109) to 25096 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 8.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001812 (OMIM: 118825) rab proteins geranylgeran ( 656) 4366 867.6 0
NP_000381 (OMIM: 300390,303100) rab proteins geran ( 653) 3143 627.4 4.9e-179
XP_016884731 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab ( 602) 2901 579.9 9.1e-165
NP_001307888 (OMIM: 300390,303100) rab proteins ge ( 505) 2471 495.4 2e-139
XP_016884734 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab ( 505) 2471 495.4 2e-139
XP_016884732 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab ( 505) 2471 495.4 2e-139
XP_016884733 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab ( 505) 2471 495.4 2e-139
XP_016884735 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab ( 505) 2471 495.4 2e-139
NP_001138886 (OMIM: 300390,303100) rab proteins ge ( 110) 566 121.0 2.3e-27
XP_016871560 (OMIM: 600767) PREDICTED: rab GDP dis ( 423) 438 96.2 2.5e-19
NP_001485 (OMIM: 600767) rab GDP dissociation inhi ( 445) 438 96.3 2.6e-19
NP_001484 (OMIM: 300104,300849) rab GDP dissociati ( 447) 435 95.7 4e-19
>>NP_001812 (OMIM: 118825) rab proteins geranylgeranyltr (656 aa)
initn: 4366 init1: 4366 opt: 4366 Z-score: 4633.0 bits: 867.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4366; 100.0% identity (100.0% similar) in 656 aa overlap (1-656:1-656)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 YCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLYS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 LTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCKA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 IIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEINE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQEI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE5 FPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
610 620 630 640 650
>>NP_000381 (OMIM: 300390,303100) rab proteins geranylge (653 aa)
initn: 2894 init1: 2359 opt: 3143 Z-score: 3335.3 bits: 627.4 E(85289): 4.9e-179
Smith-Waterman score: 3143; 72.0% identity (88.8% similar) in 653 aa overlap (1-652:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
:::.::.::::..:::::::::.::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::
NP_000 MADTLPSEFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGRRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
:::.:.:: .: : ::: : :.::::.: .::.::::.:.:::::::....::: ::::
NP_000 EYQENSDIVSDSPV-WQDQILENEEAIALSRKDKTIQHVEVFCYASQDLHEDVEEAGALQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSA-LPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKE
:: .: .: . ::. ::: :: :.. : :: ...: .:: : .:::. .: . :::
NP_000 KNHALVTSANSTEAADSAFLPTEDESLSTMSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KYCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLY
..: ::::. ..: .: .:. .:: ...: .::::::::.::::::::::::::::
NP_000 NHCDDKTCVPSTSAED--MSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
:.::::::::::.::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
NP_000 SRGLLIDLLIKSNVSRYAEFKNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
:::::.:::..::::..... .: :::::.:::::::..:.::::::::.. .:::::.:
NP_000 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TKNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCK
:::::.::::.::::::::::::::.:: ::::::::::::::::.:::.:::::: .::
NP_000 TKNFLHCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCFCRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 AIIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIV
::::.::::: ...:.:::::. :. :: :::.::::::::::.:.:::: ::: ::: :
NP_000 AIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQISRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 PPAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEIN
: :::. :::: ::::::::::: ::::::::.:::::::::::::.:::.:::: ::.
NP_000 PAEEPGTFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCTSSKTAREDLESVVQKLFVPYTEMEIE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EEELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQE
.:.. :::.:::::::::::: :::: :: :::::::::::::::::..:::::::::::
NP_000 NEQVEKPRILWALYFNMRDSSDISRSCYNDLPSNVYVCSGPDCGLGNDNAVKQAETLFQE
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 IFPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
: :.:.::::::::::::.:::. :::: .. . :. :. .:: :: . :.
NP_000 ICPNEDFCPPPPNPEDIILDGDSLQPEASESSAIPEANSETFKESTNLGNLEESSE
600 610 620 630 640 650
>>XP_016884731 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab prot (602 aa)
initn: 2652 init1: 2117 opt: 2901 Z-score: 3079.1 bits: 579.9 E(85289): 9.1e-165
Smith-Waterman score: 2901; 72.7% identity (89.3% similar) in 598 aa overlap (1-597:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MADNLPTEFDVVIIGTGLPESILAAACSRSGQRVLHIDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
:::.::.::::..:::::::::.::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::
XP_016 MADTLPSEFDVIVIGTGLPESIIAAACSRSGRRVLHVDSRSYYGGNWASFSFSGLLSWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EYQQNNDIGEESTVVWQDLIHETEEAITLRKKDETIQHTEAFCYASQDMEDNVEEIGALQ
:::.:.:: .: : ::: : :.::::.: .::.::::.:.:::::::....::: ::::
XP_016 EYQENSDIVSDSPV-WQDQILENEEAIALSRKDKTIQHVEVFCYASQDLHEDVEEAGALQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 KNPSLGVSNTFTEVLDSA-LPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKE
:: .: .: . ::. ::: :: :.. : :: ...: .:: : .:::. .: . :::
XP_016 KNHALVTSANSTEAADSAFLPTEDESLSTMSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KYCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLY
..: ::::. ..: .: .:. .:: ...: .::::::::.::::::::::::::::
XP_016 NHCDDKTCVPSTSAED--MSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
:.::::::::::.::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
XP_016 SRGLLIDLLIKSNVSRYAEFKNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
:::::.:::..::::..... .: :::::.:::::::..:.::::::::.. .:::::.:
XP_016 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TKNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCK
:::::.::::.::::::::::::::.:: ::::::::::::::::.:::.:::::: .::
XP_016 TKNFLHCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCFCRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 AIIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIV
::::.::::: ...:.:::::. :. :: :::.::::::::::.:.:::: ::: ::: :
XP_016 AIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQISRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 PPAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEIN
: :::. :::: ::::::::::: ::::::::.:::::::::::::.:::.:::: ::.
XP_016 PAEEPGTFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCTSSKTAREDLESVVQKLFVPYTEMEIE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EEELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQE
.:.. :::.:::::::::::: :::: :: :::::::::::::::::..:::: :.
XP_016 NEQVEKPRILWALYFNMRDSSDISRSCYNDLPSNVYVCSGPDCGLGNDNAVKQELPLLLL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 IFPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
XP_016 RSIVK
600
>>NP_001307888 (OMIM: 300390,303100) rab proteins gerany (505 aa)
initn: 2469 init1: 2359 opt: 2471 Z-score: 2623.9 bits: 495.4 E(85289): 2e-139
Smith-Waterman score: 2471; 72.8% identity (89.5% similar) in 503 aa overlap (150-652:2-502)
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 QKNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKE
: :: ...: .:: : .:::. .: . :::
NP_001 MSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKE
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KYCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLY
..: ::::. ..: .: .:. .:: ...: .::::::::.::::::::::::::::
NP_001 NHCDDKTCVPSTSAED--MSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLY
40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
:.::::::::::.::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
NP_001 SRGLLIDLLIKSNVSRYAEFKNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMK
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
:::::.:::..::::..... .: :::::.:::::::..:.::::::::.. .:::::.:
NP_001 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
150 160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 TKNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCK
:::::.::::.::::::::::::::.:: ::::::::::::::::.:::.:::::: .::
NP_001 TKNFLHCLGRYGNTPFLFPLYGQGELPQCFCRMCAVFGGIYCLRHSVQCLVVDKESRKCK
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 AIIDHFGQRINAKYFIVEDSYLSEETCSNVQYKQISRAVLITDQSILKTDLDQQTSILIV
::::.::::: ...:.:::::. :. :: :::.::::::::::.:.:::: ::: ::: :
NP_001 AIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQISRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTV
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 PPAEPGACAVRVTELCSSTMTCMKDTYLVHLTCSSSKTAREDLESVVKKLFTPYTETEIN
: :::. :::: ::::::::::: ::::::::.:::::::::::::.:::.:::: ::.
NP_001 PAEEPGTFAVRVIELCSSTMTCMKGTYLVHLTCTSSKTAREDLESVVQKLFVPYTEMEIE
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EEELTKPRLLWALYFNMRDSSGISRSSYNGLPSNVYVCSGPDCGLGNEHAVKQAETLFQE
.:.. :::.:::::::::::: :::: :: :::::::::::::::::..:::::::::::
NP_001 NEQVEKPRILWALYFNMRDSSDISRSCYNDLPSNVYVCSGPDCGLGNDNAVKQAETLFQE
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 IFPTEEFCPPPPNPEDIIFDGDDKQPEAPGTNNVVMAKLESSEESKNLESPEKHLQN
: :.:.::::::::::::.:::. :::: .. . :. :. .:: :: . :.
NP_001 ICPNEDFCPPPPNPEDIILDGDSLQPEASESSAIPEANSETFKESTNLGNLEESSE
450 460 470 480 490 500
>>XP_016884734 (OMIM: 300390,303100) PREDICTED: rab prot (505 aa)
initn: 2469 init1: 2359 opt: 2471 Z-score: 2623.9 bits: 495.4 E(85289): 2e-139
Smith-Waterman score: 2471; 72.8% identity (89.5% similar) in 503 aa overlap (150-652:2-502)
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 QKNPSLGVSNTFTEVLDSALPEESQLSYFNSDEMPAKHTQKSDTEISLEVTDVEESVEKE
: :: ...: .:: : .:::. .: . :::
XP_016 MSCEMLTEQTPSSDPENALEVNGAEVTGEKE
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KYCGDKTCMHTVSDKDGDKDESKSTVEDKADEPIRNRITYSQIVKEGRRFNIDLVSKLLY
..: ::::. ..: .: .:. .:: ...: .::::::::.::::::::::::::::
XP_016 NHCDDKTCVPSTSAED--MSENVPIAEDTTEQPKKNRITYSQIIKEGRRFNIDLVSKLLY
40 50 60 70 80
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
:.::::::::::.::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
XP_016 SRGLLIDLLIKSNVSRYAEFKNITRILAFREGRVEQVPCSRADVFNSKQLTMVEKRMLMK
90 100 110 120 130 140
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
:::::.:::..::::..... .: :::::.:::::::..:.::::::::.. .:::::.:
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pF1KE5 SQGLLIDLLIKSDVSRYVEFKNVTRILAFREGKVEQVPCSRADVFNSKELTMVEKRMLMK
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pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
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XP_016 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
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pF1KE5 TKNFLQCLGRFGNTPFLFPLYGQGEIPQGFCRMCAVFGGIYCLRHKVQCFVVDKESGRCK
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pF1KE5 FLTFCLEYEQHPDEYQAFRQCSFSEYLKTKKLTPNLQHFVLHSIAMTSESSCTTIDGLNA
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XP_016 FLTFCMEYEKYPDEYKGYEEITFYEYLKTQKLTPNLQYIVMHSIAMTSETASSTIDGLKA
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XP_016 AIIDQFGQRIISEHFLVEDSYFPENMCSRVQYRQISRAVLITDRSVLKTDSDQQISILTV
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XP_016 ICPNEDFCPPPPNPEDIILDGDSLQPEASESSAIPEANSETFKESTNLGNLEESSE
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>>XP_016871560 (OMIM: 600767) PREDICTED: rab GDP dissoci (423 aa)
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:: .:.::. :.:...: :. .:. ..:.:
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:..:: . .... ::. .:: ..:... :. . . ::: . :::.. .. :. : .
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... .. .. . : : .. :. :..:. .. : . .: : . . :
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. . : . . . . :.. .. . .: ..... ... :. : . .. .:
XP_016 SDIYVCMISFAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALE-LLEPIEQKFVSISDLLV
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:. :
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370 380 390 400 410 420
656 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:41:40 2016 done: Tue Nov 8 06:41:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]