Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5776, 624 aa
1>>>pF1KE5776 624 - 624 aa - 624 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7828+/-0.000995; mu= 16.3317+/- 0.060
mean_var=70.0794+/-13.915, 0's: 0 Z-trim(104.2): 25 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.153207
statistics sampled from 7779 (7784) to 7779 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3676.1 PAPSS1 gene_id:9061|Hs108|chr4 ( 624) 4285 956.7 0
CCDS7385.1 PAPSS2 gene_id:9060|Hs108|chr10 ( 614) 3381 756.9 1.7e-218
CCDS44453.1 PAPSS2 gene_id:9060|Hs108|chr10 ( 619) 3370 754.5 9.3e-218
>>CCDS3676.1 PAPSS1 gene_id:9061|Hs108|chr4 (624 aa)
initn: 4285 init1: 4285 opt: 4285 Z-score: 5115.8 bits: 956.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4285; 100.0% identity (100.0% similar) in 624 aa overlap (1-624:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIPGSLCKKVKLSNNAQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MEIPGSLCKKVKLSNNAQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ADAGLVCITSFISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ADAGLVCITSFISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 EIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VINLSVPIVLTATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VINLSVPIVLTATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 RNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 LNPETTVVAIFPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LNPETTVVAIFPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 HGAKVLTMAPGLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HGAKVLTMAPGLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQK
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE5 PPEGFMAPKAWTVLTEYYKSLEKA
::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PPEGFMAPKAWTVLTEYYKSLEKA
610 620
>>CCDS7385.1 PAPSS2 gene_id:9060|Hs108|chr10 (614 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3381 Z-score: 4036.1 bits: 756.9 E(32554): 1.7e-218
Smith-Waterman score: 3381; 78.4% identity (94.0% similar) in 601 aa overlap (23-623:13-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIPGSLCKKVKLSNNAQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
:..:::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLF
:::::::.:.::::::: :.::::.:::::.:.:::.:::::: :::::.::::::::::
CCDS73 SGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ADAGLVCITSFISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAG
::::::::::::::...::.:::.:::.:.:::::.::::::..::.::::::::.::::
CCDS73 ADAGLVCITSFISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVP
::::::::::.:::::.:: ::::. :.:::.::::::::..::: ...::.::
CCDS73 EIKGFTGIDSDYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDGG
:::: ....:::::.:.:.:.:.::::::.:::::::.:::::.:::: .::: ::: :
CCDS73 ENKLDHVRAEAETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDDG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VINLSVPIVLTATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQWGTTC
:::.:.:::: .. ::: ::.::. :.: . ::::::::. ::.::::::::.: :::::
CCDS73 VINMSIPIVLPVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRVWGTTC
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 KNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAVFAFQL
.::.::::::.::::.:::::::... :::::::::::: ::::: :.:::::::::::
CCDS73 TKHPHIKMVMESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAVFAFQL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 RNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAVLEEGV
:::::::::::::::...::::::..::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS73 RNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 LNPETTVVAIFPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKDLYEPS
:.:..:.::::::::.::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS73 LDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKDLYEPT
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 HGAKVLTMAPGLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLAREGQK
::.:::.::::: ..::.::::::::: :: ::.:: .:..:.::::::::::::::..
CCDS73 HGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLAREGEN
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KE5 PPEGFMAPKAWTVLTEYYKSLEKA
::.:::::::: :::.::.::::
CCDS73 PPDGFMAPKAWKVLTDYYRSLEKN
600 610
>>CCDS44453.1 PAPSS2 gene_id:9060|Hs108|chr10 (619 aa)
initn: 1885 init1: 1885 opt: 3370 Z-score: 4022.9 bits: 754.5 E(32554): 9.3e-218
Smith-Waterman score: 3370; 77.9% identity (93.4% similar) in 606 aa overlap (23-623:13-618)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEIPGSLCKKVKLSNNAQNWGMQRATNVTYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
:..:::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSGIKKQKTENQQKSTNVVYQAHHVSRNKRGQVVGTRGGFRGCTVWLTGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SGAGKTTVSMALEEYLVCHGIPCYTLDGDNIRQGLNKNLGFSPEDREENVRRIAEVAKLF
:::::::.:.::::::: :.::::.:::::.:.:::.:::::: :::::.::::::::::
CCDS44 SGAGKTTISFALEEYLVSHAIPCYSLDGDNVRHGLNRNLGFSPGDREENIRRIAEVAKLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ADAGLVCITSFISPYTQDRNNARQIHEGASLPFFEVFVDAPLHVCEQRDVKGLYKKARAG
::::::::::::::...::.:::.:::.:.:::::.::::::..::.::::::::.::::
CCDS44 ADAGLVCITSFISPFAKDRENARKIHESAGLPFFEIFVDAPLNICESRDVKGLYKRARAG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EIKGFTGIDSEYEKPEAPELVLKTDSCDVNDCVQQVVELLQERDIVPVDASYEVKELYVP
::::::::::.:::::.:: ::::. :.:::.::::::::..::: ...::.::
CCDS44 EIKGFTGIDSDYEKPETPERVLKTNLSTVSDCVHQVVELLQEQNIVPYTIIKDIHELFVP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 ENKLHLAKTDAETLPALKINKVDMQWVQVLAEGWATPLNGFMREREYLQCLHFDCLLDG-
:::: ....:::::.:.:.:.:.::::::.:::::::.:::::.:::: .::: ::::
CCDS44 ENKLDHVRAEAETLPSLSITKLDLQWVQVLSEGWATPLKGFMREKEYLQVMHFDTLLDGM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 ----GVINLSVPIVLTATHEDKERLDGCTAFALMYEGRRVAILRNPEFFEHRKEERCARQ
::::.:.:::: .. ::: ::.::. :.: . ::::::::. ::.::::::::.:
CCDS44 ALPDGVINMSIPIVLPVSAEDKTRLEGCSKFVLAHGGRRVAILRDAEFYEHRKEERCSRV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 WGTTCKNHPYIKMVMEQGDWLIGGDLQVLDRVYWNDGLDQYRLTPTELKQKFKDMNADAV
::::: .::.::::::.::::.:::::::... :::::::::::: ::::: :.::::::
CCDS44 WGTTCTKHPHIKMVMESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPLELKQKCKEMNADAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 FAFQLRNPVHNGHALLMQDTHKQLLERGYRRPVLLLHPLGGWTKDDDVPLMWRMKQHAAV
::::::::::::::::::::...::::::..::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS44 FAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 LEEGVLNPETTVVAIFPSPMMYAGPTEVQWHCRARMVAGANFYIVGRDPAGMPHPETGKD
::::::.:..:.::::::::.::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: ::
CCDS44 LEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRSRMIAGANFYIVGRDPAGMPHPETKKD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 LYEPSHGAKVLTMAPGLITLEIVPFRVAAYNKKKKRMDYYDSEHHEDFEFISGTRMRKLA
::::.::.:::.::::: ..::.::::::::: :: ::.:: .:..:.:::::::::::
CCDS44 LYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKAKKAMDFYDPARHNEFDFISGTRMRKLA
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KE5 REGQKPPEGFMAPKAWTVLTEYYKSLEKA
:::..::.:::::::: :::.::.::::
CCDS44 REGENPPDGFMAPKAWKVLTDYYRSLEKN
600 610
624 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:32:40 2016 done: Tue Nov 8 06:32:40 2016
Total Scan time: 2.070 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]