Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5751
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5751, 708 aa
1>>>pF1KE5751 708 - 708 aa - 708 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5375+/-0.0012; mu= 18.0904+/- 0.072
mean_var=60.0199+/-12.221, 0's: 0 Z-trim(100.5): 33 B-trim: 3 in 1/47
Lambda= 0.165549
statistics sampled from 6110 (6120) to 6110 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9489.1 SLC15A1 gene_id:6564|Hs108|chr13 ( 708) 4657 1121.4 0
CCDS3007.1 SLC15A2 gene_id:6565|Hs108|chr3 ( 729) 1683 411.1 2.9e-114
CCDS54631.1 SLC15A2 gene_id:6565|Hs108|chr3 ( 698) 1668 407.6 3.3e-113
>>CCDS9489.1 SLC15A1 gene_id:6564|Hs108|chr13 (708 aa)
initn: 4657 init1: 4657 opt: 4657 Z-score: 6003.9 bits: 1121.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4657; 99.9% identity (100.0% similar) in 708 aa overlap (1-708:1-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGMSKSHSFFGYPLSIFFIVVNEFCERFSYYGMRAILILYFTNFISWDDNLSTAIYHTFV
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CCDS94 MGMSKSHSFFGYPLSIFFIVVNEFCERFSYYGMRAILILYFTNFISWDDNLSTAIYHTFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ALCYLTPILGALIADSWLGKFKTIVSLSIVYTIGQAVTSVSSINDLTDHNHDGTPDSLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ALCYLTPILGALIADSWLGKFKTIVSLSIVYTIGQAVTSVSSINDLTDHNHDGTPDSLPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 HVVLSLIGLALIALGTGGIKPCVSAFGGDQFEEGQEKQRNRFFSIFYLAINAGSLLSTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HVVLSLIGLALIALGTGGIKPCVSAFGGDQFEEGQEKQRNRFFSIFYLAINAGSLLSTII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TPMLRVQQCGIHSKQACYPLAFGVPAALMAVALIVFVLGSGMYKKFKPQGNIMGKVAKCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TPMLRVQQCGIHSKQACYPLAFGVPAALMAVALIVFVLGSGMYKKFKPQGNIMGKVAKCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GFAIKNRFRHRSKAFPKREHWLDWAKEKYDERLISQIKMVTRVMFLYIPLPMFWALFDQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GFAIKNRFRHRSKAFPKREHWLDWAKEKYDERLISQIKMVTRVMFLYIPLPMFWALFDQQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 GSRWTLQATTMSGKIGAVEIQPDQMQTVNAILIVIMVPIFDAVLYPLIAKCGFNFTSLKK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 GSRWTLQATTMSGKIGALEIQPDQMQTVNAILIVIMVPIFDAVLYPLIAKCGFNFTSLKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 MAVGMVLASMAFVVAAIVQVEIDKTLPVFPKGNEVQIKVLNIGNNTMNISLPGEMVTLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MAVGMVLASMAFVVAAIVQVEIDKTLPVFPKGNEVQIKVLNIGNNTMNISLPGEMVTLGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 MSQTNAFMTFDVNKLTRINISSPGSPVTAVTDDFKQGQRHTLLVWAPNHYQVVKDGLNQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MSQTNAFMTFDVNKLTRINISSPGSPVTAVTDDFKQGQRHTLLVWAPNHYQVVKDGLNQK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 PEKGENGIRFVNTFNELITITMSGKVYANISSYNASTYQFFPSGIKGFTISSTEIPPQCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PEKGENGIRFVNTFNELITITMSGKVYANISSYNASTYQFFPSGIKGFTISSTEIPPQCQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 PNFNTFYLEFGSAYTYIVQRKNDSCPEVKVFEDISANTVNMALQIPQYFLLTCGEVVFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PNFNTFYLEFGSAYTYIVQRKNDSCPEVKVFEDISANTVNMALQIPQYFLLTCGEVVFSV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 TGLEFSYSQAPSNMKSVLQAGWLLTVAVGNIIVLIVAGAGQFSKQWAEYILFAALLLVVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TGLEFSYSQAPSNMKSVLQAGWLLTVAVGNIIVLIVAGAGQFSKQWAEYILFAALLLVVC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE5 VIFAIMARFYTYINPAEIEAQFDEDEKKNRLEKSNPYFMSGANSQKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 VIFAIMARFYTYINPAEIEAQFDEDEKKNRLEKSNPYFMSGANSQKQM
670 680 690 700
>>CCDS3007.1 SLC15A2 gene_id:6565|Hs108|chr3 (729 aa)
initn: 2171 init1: 891 opt: 1683 Z-score: 2164.9 bits: 411.1 E(32554): 2.9e-114
Smith-Waterman score: 2136; 49.9% identity (75.9% similar) in 696 aa overlap (12-684:42-710)
10 20 30 40
pF1KE5 MGMSKSHSFFGYPLSIFFIVVNEFCERFSYYGMRAILILYF
::::: ::::::::::::::::.:.:::::
CCDS30 TLFSPVSIEEVPPRPPSPPKKPSPTICGSNYPLSIAFIVVNEFCERFSYYGMKAVLILYF
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 TNFISWDDNLSTAIYHTFVALCYLTPILGALIADSWLGKFKTIVSLSIVYTIGQAVTSVS
:. :... ::.:::.: .:::.:::::: ::::::::::::. ::.::..:... :..
CCDS30 LYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFKTIIYLSLVYVLGHVIKSLG
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SINDLTDHNHDGTPDSLPVHVVLSLIGLALIALGTGGIKPCVSAFGGDQFEEGQEKQRNR
.. : . ::.:::::::.:::::::::::::.::::::::: . ..:.:
CCDS30 ALPILGGQV---------VHTVLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTR
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FFSIFYLAINAGSLLSTIITPMLRVQ-QCGIHSKQACYPLAFGVPAALMAVALIVFVLGS
.::.:::.::::::.::.:::::: . :: . :: ::::::. ::..::.::..::
CCDS30 YFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQC---FGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGS
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GMYKKFKPQGNIMGKVAKCIGFAIKNRFRHRSKAFPKREHWLDWAKEKYDERLISQIKMV
.:.: :.:::...: ::: :::.:::..:: .:::.:::::: ::: ..:: ..: .
CCDS30 KIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 TRVMFLYIPLPMFWALFDQQGSRWTLQATTMSGKIGAVEIQPDQMQTVNAILIVIMVPIF
:::.::::::::::::.::::::::::: :. ..: .::::::..: .:..:..:.:
CCDS30 TRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DAVLYPLIAKCGFNFTSLKKMAVGMVLASMAFVVAAIVQVEIDKTLPVFPKGNEVQIKVL
: :.: :..:::.::.::.::::::.:: .::.::: :...:.. :. : .:: ..::
CCDS30 DFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE5 NIGNNTMNISLPGEMVTLGPMSQTNAFM-TFDVNKLTRINISSPGSPVTAVTDDFKQGQR
:.... ..... :. . . . ..:. : .:: ... .: ... .
CCDS30 NLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKL-HLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTE
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE5 HTLLVWAPNHYQVV--KDG----------LNQKPEKGENGIRFVNTFNELITITMSGKVY
:. : : :..: .:: ... .: . .:::::... ..:..: .
CCDS30 HS--VQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 ANIS-SYNASTYQFFPSGIKGFTISSTEIPP-QCQP---NF--NTFYLEFGSAYTYIVQR
:.. .:..:.:. :.. : : .:. :: : :.::.:: ...
CCDS30 LNVGEDYGVSAYR---------TVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITN
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 KNDSCPEVKVFEDISANTVNMALQIPQYFLLTCGEVVFSVTGLEFSYSQAPSNMKSVLQA
.... .. .::: :: ...: :.::: :.: :::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS30 NTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQA
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670
pF1KE5 GWLLTVAVGNIIVLIVAGAGQFSK--QWAEYILFAALLLVVCVIFAIMARFYTYINPAEI
.::::.::::::::.:: ::: ::::.:::. ::::.:.::.::. .:. .. ..
CCDS30 AWLLTIAVGNIIVLVVA---QFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDM
650 660 670 680 690 700
680 690 700
pF1KE5 EAQFDEDEKKNRLEKSNPYFMSGANSQKQM
.. :.
CCDS30 RGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL
710 720
>>CCDS54631.1 SLC15A2 gene_id:6565|Hs108|chr3 (698 aa)
initn: 1776 init1: 891 opt: 1668 Z-score: 2145.9 bits: 407.6 E(32554): 3.3e-113
Smith-Waterman score: 2005; 48.3% identity (72.4% similar) in 696 aa overlap (12-684:42-679)
10 20 30 40
pF1KE5 MGMSKSHSFFGYPLSIFFIVVNEFCERFSYYGMRAILILYF
::::: ::::::::::::::::.:.:::::
CCDS54 TLFSPVSIEEVPPRPPSPPKKPSPTICGSNYPLSIAFIVVNEFCERFSYYGMKAVLILYF
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 TNFISWDDNLSTAIYHTFVALCYLTPILGALIADSWLGKFKTIVSLSIVYTIGQAVTSVS
:. :... ::.:::.: .:::.:::::: ::::::::::
CCDS54 LYFLHWNEDTSTSIYHAFSSLCYFTPILGAAIADSWLGKFK-------------------
80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SINDLTDHNHDGTPDSLPVHVVLSLIGLALIALGTGGIKPCVSAFGGDQFEEGQEKQRNR
:::::::.:::::::::::::.::::::::: . ..:.:
CCDS54 ---------------------VLSLIGLSLIALGTGGIKPCVAAFGGDQFEEKHAEERTR
120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FFSIFYLAINAGSLLSTIITPMLRVQ-QCGIHSKQACYPLAFGVPAALMAVALIVFVLGS
.::.:::.::::::.::.:::::: . :: . :: ::::::. ::..::.::..::
CCDS54 YFSVFYLSINAGSLISTFITPMLRGDVQC---FGEDCYALAFGVPGLLMVIALVVFAMGS
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 GMYKKFKPQGNIMGKVAKCIGFAIKNRFRHRSKAFPKREHWLDWAKEKYDERLISQIKMV
.:.: :.:::...: ::: :::.:::..:: .:::.:::::: ::: ..:: ..: .
CCDS54 KIYNKPPPEGNIVAQVFKCIWFAISNRFKNRSGDIPKRQHWLDWAAEKYPKQLIMDVKAL
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 TRVMFLYIPLPMFWALFDQQGSRWTLQATTMSGKIGAVEIQPDQMQTVNAILIVIMVPIF
:::.::::::::::::.::::::::::: :. ..: .::::::..: .:..:..:.:
CCDS54 TRVLFLYIPLPMFWALLDQQGSRWTLQAIRMNRNLGFFVLQPDQMQVLNPLLVLIFIPLF
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 DAVLYPLIAKCGFNFTSLKKMAVGMVLASMAFVVAAIVQVEIDKTLPVFPKGNEVQIKVL
: :.: :..:::.::.::.::::::.:: .::.::: :...:.. :. : .:: ..::
CCDS54 DFVIYRLVSKCGINFSSLRKMAVGMILACLAFAVAAAVEIKINEMAPAQPGPQEVFLQVL
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KE5 NIGNNTMNISLPGEMVTLGPMSQTNAFM-TFDVNKLTRINISSPGSPVTAVTDDFKQGQR
:.... ..... :. . . . ..:. : .:: ... .: ... .
CCDS54 NLADDEVKVTVVGNENNSLLIESIKSFQKTPHYSKL-HLKTKSQDFHFHLKYHNLSLYTE
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KE5 HTLLVWAPNHYQVV--KDG----------LNQKPEKGENGIRFVNTFNELITITMSGKVY
:. : : :..: .:: ... .: . .:::::... ..:..: .
CCDS54 HS--VQEKNWYSLVIREDGNSISSMMVKDTESRTTNGMTTVRFVNTLHKDVNISLSTDTS
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 ANIS-SYNASTYQFFPSGIKGFTISSTEIPP-QCQP---NF--NTFYLEFGSAYTYIVQR
:.. .:..:.:. :.. : : .:. :: : :.::.:: ...
CCDS54 LNVGEDYGVSAYR---------TVQRGEYPAVHCRTEDKNFSLNLGLLDFGAAYLFVITN
510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 KNDSCPEVKVFEDISANTVNMALQIPQYFLLTCGEVVFSVTGLEFSYSQAPSNMKSVLQA
.... .. .::: :: ...: :.::: :.: :::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS54 NTNQGLQAWKIEDIPANKMSIAWQLPQYALVTAGEVMFSVTGLEFSYSQAPSSMKSVLQA
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670
pF1KE5 GWLLTVAVGNIIVLIVAGAGQFSK--QWAEYILFAALLLVVCVIFAIMARFYTYINPAEI
.::::.::::::::.:: ::: ::::.:::. ::::.:.::.::. .:. .. ..
CCDS54 AWLLTIAVGNIIVLVVA---QFSGLVQWAEFILFSCLLLVICLIFSIMGYYYVPVKTEDM
620 630 640 650 660 670
680 690 700
pF1KE5 EAQFDEDEKKNRLEKSNPYFMSGANSQKQM
.. :.
CCDS54 RGPADKHIPHIQGNMIKLETKKTKL
680 690
708 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 10:38:36 2016 done: Tue Nov 8 10:38:36 2016
Total Scan time: 2.480 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]