FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5736, 832 aa
1>>>pF1KE5736 832 - 832 aa - 832 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5196+/-0.000499; mu= 19.9732+/- 0.031
mean_var=85.3884+/-17.667, 0's: 0 Z-trim(108.9): 407 B-trim: 80 in 1/52
Lambda= 0.138795
statistics sampled from 16559 (16983) to 16559 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 9.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004054 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Ho ( 832) 5468 1106.0 0
NP_001138135 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor ( 832) 5468 1106.0 0
XP_011515092 (OMIM: 603017) PREDICTED: cadherin-17 ( 752) 4233 858.7 0
NP_004053 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 1 pre ( 829) 1288 269.0 6e-71
NP_001191674 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 3 ( 790) 1030 217.4 2.1e-55
NP_001191673 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 2 ( 807) 1030 217.4 2.1e-55
XP_005255827 (OMIM: 603118) PREDICTED: cadherin-16 ( 651) 1023 215.9 4.7e-55
NP_001191675 (OMIM: 603118) cadherin-16 isoform 4 ( 732) 938 198.9 6.9e-50
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 903 191.9 9.8e-48
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 903 192.0 1e-47
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 833 177.8 1.3e-43
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 833 177.9 1.4e-43
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2 ( 760) 833 177.9 1.5e-43
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3 ( 674) 824 176.1 4.8e-43
XP_006714498 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864421 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864413 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864414 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_005248285 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864415 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864419 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864417 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864418 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864416 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
NP_001278885 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
NP_004925 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 1 pre ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_016864420 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 790) 791 169.5 5.3e-41
XP_011512230 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 724) 784 168.1 1.3e-40
XP_011521109 (OMIM: 603118) PREDICTED: cadherin-16 ( 766) 772 165.7 7.2e-40
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 724 156.1 6.1e-37
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 724 156.1 6.4e-37
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4 ( 459) 705 152.1 5.3e-36
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 698 150.9 2.2e-35
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 698 150.9 2.3e-35
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 698 150.9 2.4e-35
NP_001161139 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 2 ( 574) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864429 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864428 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864430 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864427 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
NP_001278886 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 3 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864425 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
XP_011512232 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864424 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
XP_016864426 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 673 145.8 5.4e-34
XP_011512231 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 622) 630 137.2 2.2e-31
XP_016878318 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8 ( 621) 594 130.0 3.3e-29
XP_016864422 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567) 582 127.5 1.6e-28
XP_016864423 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 567) 582 127.5 1.6e-28
XP_011538341 (OMIM: 601067,601386,605516) PREDICTE (3418) 548 121.3 7.2e-26
>>NP_004054 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Homo s (832 aa)
initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468 Z-score: 5918.2 bits: 1106.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5468; 99.8% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_004 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 INGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 INGTHARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE5 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
790 800 810 820 830
>>NP_001138135 (OMIM: 603017) cadherin-17 precursor [Hom (832 aa)
initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468 Z-score: 5918.2 bits: 1106.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5468; 99.8% identity (100.0% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-832)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
430 440 450 460 470 480
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pF1KE5 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTGSSKILYHIIKGDSEGRLGVDTDPHTNTGYVIIKKPLDFETAAVSNIVFKAENPEPLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLDREAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGSLIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSGSLQNDWEVSK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 INGTHARLSTRHTDFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INGTHARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE5 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
790 800 810 820 830
>>XP_011515092 (OMIM: 603017) PREDICTED: cadherin-17 iso (752 aa)
initn: 4213 init1: 4213 opt: 4233 Z-score: 4582.3 bits: 858.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4746; 90.1% identity (90.4% similar) in 832 aa overlap (1-832:1-752)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MILQAHLHSLCLLMLYLATGYGQEGKFSGPLKPMTFSIYEGQEPSQIIFQFKANPPAVTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIEVKDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
XP_011 ELTGETDNIFVIEREGLLYYNRALDRETRSTHNLQVAALDANGIIVEGPVPITIKVKDIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNRPTFLQSKYEGSVRQNSRPGKPFLYVNATDLDDPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVKDMGGQSENSFSDTTSVDIIVTENIWK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APKPVEMVENSTDPHPIKITQVRWNDPGAQYSLVDKEKLPRFPFSIDQEGDIYVTQPLDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEKDAYVFYAVAKDEYGKPLSYPLEIHVKVKDINDNPPTCPSPVTVFEVQENERLGNSIG
310 320 330 340 350 360
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XP_011 TLTAHDRDEENTANSFLNYRIVEQTPKLPMDGLFLIQTYAGMLQLAKQSLKKQDTPQYNL
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XP_011 TIEVSDKDFKTLCFVQINVIDINDQIPIFEKSDYGNLTLAEDTNIGSTILTIQATDADEP
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XP_011 FGVKYNASSFAKFTLIVTDVNEAPQFSQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISY
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XP_011 ---THARLSTRHTEFEEREYVVLIRINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSCVEGSCFRPAGHQT
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XP_011 GIPTVGMAVGILLTTLLVIGIILAVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
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::: :. .. . :..:.. . :. : . .:....:: .: ...::.:. ..: :
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..:.: .. : :..:.: ..: ... :: : . .. : :..: : :..
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.:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :.
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..:.: .. : :..:.: ..: ... :: : . .. : :..: : :..
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.:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :
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....: :.. . .:....:. :. ::. .:.:..
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pF1KE5 DPATPNGQLYYQIVIQLPMINNVMYFQINNKTGAISLTREGSQELNPAKNPSYNLVISVK
.:.: :..: ..:. : : . .::.. . ::..:. .:: :. : . .:.:...::
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NP_001 DMGDQA-SGHQATATVEVSIIESTWVSLEPIHLAENLKVLYPHHMAQVHWSGGDVHYHL-
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:: : :: . . : :. . :.:.: : .. :: . :... :. ..:
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: .. .: . :. :. :. :..... . :.. : :.. : ::::. : :
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..:.: .. : :..:.: ..: ... :: : . .. : :..: : :..
NP_001 DSGHVRLRLCKNLSYEAAPSHEVVVVVQSVAKLV-GPGPGPGATATVTVLVERVMPPPKL
510 520 530 540 550 560
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pF1KE5 SQHVFQAKVSEDVAIGTKVGNVTAKDPEGLDISYSLRGDTRGWLKIDHVTGEIFSVAPLD
.:. ..:.: .. :. . .. .:: . . .:: .:..::: :.. .::. .. :.
NP_001 DQESYEASVPISAPAGSFLLTIQPSDPISRTLRFSLVNDSEGWLCIEKFSGEVHTAQSLQ
570 580 590 600 610 620
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pF1KE5 -REAGSPYRVQVVATEVGGSSLSSVSEFHLILMDVNDNPPRLAKDYTGLFFCHPLSAPGS
. :. : : : : ... .:. : .: :: .:. ::. .:.:..
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pF1KE5 LIFEATDDDQHLFRGPHFTFSLGSG-SLQNDWEVSKINGTHARLSTRHTDFEEREYVVLI
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NP_001 ------DPDLASGHGP-YSFTLGPNPTVQRDWRLQTLNGSHAYLTLALHWVEPREHIIPV
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pF1KE5 RINDGGRPPLEGIVSLPVTFCSC-VEGSCFRPAGHQTGIPTVGMAVGILLTTLLVIGIIL
.. ... . .. . : : : :::.:.: .:.. :.:: :::::. ::..:::.:
NP_001 VVSHNAQ--MWQLL-VRVIVCRCNVEGQCMRKVGRMKGMPTKLSAVGILVGTLVAIGIFL
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pF1KE5 AVVFIRIKKDKGKDNVESAQASEVKPLRS
..: . .. :: . :.. .:
NP_001 ILIFTHWTMSRKKDPDQPADSVPLKATV
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