Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5721
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5721, 690 aa
1>>>pF1KE5721 690 - 690 aa - 690 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7756+/-0.00138; mu= -0.9900+/- 0.083
mean_var=244.1627+/-47.596, 0's: 0 Z-trim(108.0): 49 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.082079
statistics sampled from 9911 (9950) to 9911 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 690) 4507 547.7 2.1e-155
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 759) 4507 547.7 2.3e-155
CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 694) 2759 340.7 4.4e-93
CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 ( 676) 2745 339.0 1.4e-92
CCDS14701.1 CNGA2 gene_id:1260|Hs108|chrX ( 664) 2609 322.9 9.4e-88
CCDS31408.1 CNGA4 gene_id:1262|Hs108|chr11 ( 575) 1976 247.9 3.1e-65
CCDS67042.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1245) 922 123.3 2.1e-27
CCDS42169.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1251) 922 123.3 2.1e-27
CCDS6244.1 CNGB3 gene_id:54714|Hs108|chr8 ( 809) 913 122.1 3.2e-27
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 555 79.7 2e-14
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203) 546 78.8 5.3e-14
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 519 75.4 3.4e-13
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 511 74.5 7.3e-13
>>CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 (690 aa)
initn: 4507 init1: 4507 opt: 4507 Z-score: 2903.3 bits: 547.7 E(32554): 2.1e-155
Smith-Waterman score: 4507; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 HARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEPEEKKKKKKEKKSKSDDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEPEEKKKKKKEKKSKSDDKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 ENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCITLPVMYNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCITLPVMYNW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 KSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 TTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 MHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAINVHLDTLKKVRIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAINVHLDTLKKVRIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 ADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 QILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE5 KVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
670 680 690
>>CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 (759 aa)
initn: 4507 init1: 4507 opt: 4507 Z-score: 2902.7 bits: 547.7 E(32554): 2.3e-155
Smith-Waterman score: 4507; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:70-759)
10 20 30
pF1KE5 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GFHHVGQAGLELLISSDLPTSASQSAGITDMKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 IRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IRRMENGACSSFSEDDDSASTSEESENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALF
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 NVNNSSNKDQEPEEKKKKKKEKKSKSDDKNENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDKKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NVNNSSNKDQEPEEKKKKKKEKKSKSDDKNENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDKKEE
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 EKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 YLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEI
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 RLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGND
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 TWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFA
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 TIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDE
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 KEVLKYLPDKLRAEIAINVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEVLKYLPDKLRAEIAINVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKG
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 DIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DIGREMYIIKEGKLAVVADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGY
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 SDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRM
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 EGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
700 710 720 730 740 750
>>CCDS2034.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 (694 aa)
initn: 2803 init1: 2748 opt: 2759 Z-score: 1784.6 bits: 340.7 E(32554): 4.4e-93
Smith-Waterman score: 2806; 62.3% identity (84.5% similar) in 684 aa overlap (10-681:4-684)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSE-----ES
:::: : . .. : .... : ::: . : .....:. . :.
CCDS20 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMET
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSN-KDQEPEE-KKKKKKEKK
.. ..:::. ... . .: .: : .:..... :. :.. . . :: .
CCDS20 RGLADSGQGSFTGQGIAR---LSRLIFLLRRWAARHVHHQDQGPDSFPDRFRGAELKEVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 SKSDDKNENKNDPEKKKKKKD-----KEKKKKEEKSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYNW
:. .. . : .. : . .. : . . ......:. .::...:.:::.: :: :
CCDS20 SQESNAQANVGSQEPADRGRSAWPLAKCNTNTSNNTEEEKKTKKKDAIVVDPSSNLYYRW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQGL
: :.:::.::: ..: :::::::::.:: ::.::: .:..:..:..::.:::.:::::
CCDS20 LTAIALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRT
.:.. .: ..::.. :::::::::.:::: :.:.: ::::.:.::::.:::.::::.::
CCDS20 MVSDTNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 ETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARK
::::::::.:::.:::.::.::::::::....::: ::::.:.::::.:. :: :::.::
CCDS20 ETRTNYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARA
:.::::::::::::::::::::.: ::.:::::::.:::::::::::.:::::::::.::
CCDS20 YIYSLYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 EFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAIN
::::.::.:::::.::.:.::.: :::.::::::.:::::::::::: :::::.::::::
CCDS20 EFQAKIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAIN
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 VHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVA
:::::::::::: ::::::::::::::.: :.:::::::::::::.:::::.::::::::
CCDS20 VHLDTLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 DDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEY
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS20 DDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEY
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 PDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEY
:.:: :::::.::::::.:.: ..: ::.::::::::: .. .:.: :::::::.::::
CCDS20 PEAKKALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEY
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690
pF1KE5 ESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
.. :.:.::::...:. .: : ... : ::
CCDS20 NATQMKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
660 670 680 690
>>CCDS42719.1 CNGA3 gene_id:1261|Hs108|chr2 (676 aa)
initn: 2800 init1: 2745 opt: 2745 Z-score: 1775.8 bits: 339.0 E(32554): 1.4e-92
Smith-Waterman score: 2798; 62.8% identity (83.5% similar) in 680 aa overlap (10-681:4-666)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKLSMKNNIINTQQSFVTMPNVIVPDIEKEIRRMENGACSSFSEDDDSASTSE-----ES
:::: : . .. : .... : ::: . : .....:. . :.
CCDS42 MAKINTQYSHPSRTHLKVKTSDRDLNRAENGLSRAHSSSEETSSVLQPGIAMET
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 ENENPHARGSFSYKSLRKGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEPE---EKKKKKKEK
.. ..:::. ... . .: .: : .:.. .:: :. .. . . :
CCDS42 RGLADSGQGSFTGQGIAR---LSRLIFLLRRWAARHVHH---QDQGPDSFPDRFRGAELK
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 KSKSDDKNENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYNWLFCI
. .:...: . : .. . ..:: : ::...:.:::.: :: :: :
CCDS42 EVSSQESNAQANVGSQEPADRGRRKKTK-----------KKDAIVVDPSSNLYYRWLTAI
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQGLLVKE
.:::.::: ..: :::::::::.:: ::.::: .:..:..:..::.:::.:::::.:..
CCDS42 ALPVFYNWYLLICRACFDELQSEYLMLWLVLDYSADVLYVLDVLVRARTGFLEQGLMVSD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRTETRT
.: ..::.. :::::::::.:::: :.:.: ::::.:.::::.:::.::::.::::::
CCDS42 TNRLWQHYKTTTQFKLDVLSLVPTDLAYLKVGTNYPEVRFNRLLKFSRLFEFFDRTETRT
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 NYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARKYVYS
::::.:::.:::.::.::::::::....::: ::::.:.::::.:. :: :::.:::.::
CCDS42 NYPNMFRIGNLVLYILIIIHWNACIYFAISKFIGFGTDSWVYPNISIPEHGRLSRKYIYS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 LYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARAEFQA
::::::::::::::::::.: ::.:::::::.:::::::::::.:::::::::.::::::
CCDS42 LYWSTLTLTTIGETPPPVKDEEYLFVVVDFLVGVLIFATIVGNVGSMISNMNASRAEFQA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAINVHLD
.::.:::::.::.:.::.: :::.::::::.:::::::::::: :::::.::::::::::
CCDS42 KIDSIKQYMQFRKVTKDLETRVIRWFDYLWANKKTVDEKEVLKSLPDKLKAEIAINVHLD
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 TLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVVADDGV
:::::::: ::::::::::::::.: :.:::::::::::::.:::::.::::::::::::
CCDS42 TLKKVRIFQDCEAGLLVELVLKLRPTVFSPGDYICKKGDIGKEMYIINEGKLAVVADDGV
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 TQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPDAK
::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS42 TQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKSGNRRTANIRSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPEAK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 TMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEYESMQ
:::::.::::::.:.: ..: ::.::::::::: .. .:.: :::::::.::::.. :
CCDS42 KALEEKGRQILMKDNLIDEELARAGADPKDLEEKVEQLGSSLDTLQTRFARLLAEYNATQ
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690
pF1KE5 QKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
.:.::::...:. .: : ... : ::
CCDS42 MKMKQRLSQLESQVKGGGDKPLADGEVPGDATKTEDKQQ
640 650 660 670
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80 90 100 110 120 130
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CCDS14 SELQRLADVDAPQQGRSGFRRIVRLVGIIREWANKNFREEEPRPDSFLERFRGPELQTVT
50 60 70 80 90 100
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CCDS14 TQEGDGKGDKDGEDKGTKKKFELFVLDPAGDWYYCWLFVIAMPVLYNWCLLVARACFSDL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
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CCDS14 QKGYYLVWLVLDYVSDVVYIADLFIRLRTGFLEQGLLVKDTKKLRDNYIHTLQFKLDVAS
170 180 190 200 210 220
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CCDS14 IIPTDLIYFAVDIHSPEVRFNRLLHFARMFEFFDRTETRTNYPNIFRISNLVLYILVIIH
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320 330 340 350 360 370
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CCDS14 WNACIYYAISKSIGFGVDTWVYPNITDPEYGYLAREYIYCLYWSTLTLTTIGETPPPVKD
290 300 310 320 330 340
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CCDS14 EEYLFVIFDFLIGVLIFATIVGNVGSMISNMNATRAEFQAKIDAVKHYMQFRKVSKGMEA
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CCDS14 KVIRWFDYLWTNKKTVDEREILKNLPAKLRAEIAINVHLSTLKKVRIFHDCEAGLLVELV
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CCDS14 LKLRPQVFSPGDYICRKGDIGKEMYIIKEGKLAVVADDGVTQYALLSAGSCFGEISILNI
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE5 KGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALTEYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLN
:::: ::::::::.:.::::::::::::::::.::::::: .:::.:..::::.:::: :
CCDS14 KGSKMGNRRTANIRSLGYSDLFCLSKDDLMEAVTEYPDAKKVLEERGREILMKEGLLDEN
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE5 IANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILAEYESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDT
: : :..::. ..: ... : :::.:.:::: . :::::::.: .: .: .
CCDS14 -EVATSMEVDVQEKLGQLETNMETLYTRFGRLLAEYTGAQQKLKQRITVLETKMKQNNED
590 600 610 620 630 640
680 690
pF1KE5 EFSSIEGPGAESGPIDST
.. :
CCDS14 DYLSDGMNSPELAAADEP
650 660
>>CCDS31408.1 CNGA4 gene_id:1262|Hs108|chr11 (575 aa)
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110 120 130 140 150 160
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: : :.: . .: . :.::::. ::
CCDS31 MSQDTKVKTTESSPPAPSKARKLLPVLDPSGDYYY
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pF1KE5 NWLFCITLPVMYNWTMVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFVRTRTGYLEQ
:: ...::::: ... :::: .:: :: ::.:::.::..::.:: :: .::.:::
CCDS31 WWLNTMVFPVMYNLIILVCRACFPDLQHGYLVAWLVLDYTSDLLYLLDMVVRFHTGFLEQ
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pF1KE5 GLLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQ
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CCDS31 GILVVDKGRISSRYVRTWSFFLDLASLMPTDVVYVRLGPHTPTLRLNRFLRAPRLFEAFD
100 110 120 130 140 150
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pF1KE5 RTETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLA
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CCDS31 RTETRTAYPNAFRIAKLMLYIFVVIHWNSCLYFALSRYLGFGRDAWVYPDPAQPGFERLR
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pF1KE5 RKYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAA
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CCDS31 RQYLYSFYFSTLILTTVGDTPPPAREEEYLFMVGDFLLAVMGFATIMGSMSSVIYNMNTA
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 RAEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIA
: : .:.::....:.. .:.::: :...: ::: ..: .:..::..::::.:
CCDS31 DAAFYPDHALVKKYMKLQHVNRKLERRVIDWYQHLQINKKMTNEVAILQHLPERLRAEVA
280 290 300 310 320 330
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pF1KE5 INVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAV
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CCDS31 VSVHLSTLSRVQIFQNCEASLLEELVLKLQPQTYSPGEYVCRKGDIGQEMYIIREGQLAV
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pF1KE5 VADDGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALT
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CCDS31 VADDGITQYAVLGAGLYFGEISIINIKGNMSGNRRTANIKSLGYSDLFCLSKEDLREVLS
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pF1KE5 EYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTR-MEGSVDLLQTRFARIL
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CCDS31 EYPQAQTIMEEKGREILLKMNKLDVNAEAAEIALQEATESRLRGLDQQLDDLQTKFARLL
460 470 480 490 500 510
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pF1KE5 AEYESMQQKLKQRLTKVEKFLKPLIDTEFSSIEGPGAESGPIDST
:: :: :. :. ..:
CCDS31 AELESSALKIAYRIERLEWQTREWPMPEDLAEADDEGEPEEGTSKDEEGRASQEGPPGPE
520 530 540 550 560 570
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::::.. . : :.: . ..: .
CCDS67 STVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVV--AWSDPTTP
490 500 510 520 530
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pF1KE5 KGGPSQREQYLPGAIALFNVNNSSNKDQEP----EEKKKKKKEKKSKSD---DKNENKND
: .: . .. : : ... :: .:. .: ::: : :.. : .
CCDS67 KDTDGQDRA---ASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKPS
540 550 560 570 580 590
130 140 150 160 170
pF1KE5 PEKKKKK-----KDKEKKKKEE---------KSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYN-WLF
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CCDS67 PAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWLF
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pF1KE5 CITLPVMYNWT--MVIARACFDELQSDYLEYWLILDYVSDIVYLIDMFV-RTRTGYLEQG
... .::. .. .: : : ...::..::. :..:..:. : .:: ... :
CCDS67 FVVMA--WNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGG
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pF1KE5 LLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQR
.. .. . :.: .. .::.:.:::.: :.::.:.: : : .:: : :.. .::: .:
CCDS67 DIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVN-PLLRLPRCLKYMAFFEFNSR
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290 300 310 320 330 340
pF1KE5 TETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISKAIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLAR
:. . ..:. . :.. .: :.:..: : :.:. ::: ...
CCDS67 LESILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGN--------
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pF1KE5 KYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFLIGVLIFATIVGNIGSMISNMNAAR
.:. :... :: ::: : : : :: ..... ::. :....:.. .... .:..
CCDS67 SYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQ
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pF1KE5 AEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAI
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CCDS67 TYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAI
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CCDS67 DVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVL
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pF1KE5 AD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALT
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pF1KE5 EYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILA
.::... .:..:....:
CCDS67 HYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGG
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>>CCDS42169.1 CNGB1 gene_id:1258|Hs108|chr16 (1251 aa)
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::::.. . : :.: . ..: .
CCDS42 STVLPPPSPAKSDTLIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVV--AWSDPTTP
490 500 510 520 530 540
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CCDS42 KDTDGQDRA---ASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKPS
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pF1KE5 PEKKKKK-----KDKEKKKKEE---------KSKDKKEEEKKEVVVIDPSGNTYYN-WLF
: :: . : : . :: : : . .. . ::: : .: :::
CCDS42 PAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDPLTNLMYVLWLF
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CCDS42 FVVMA--WNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDLIYFLDITVFQTRLQFVRGG
670 680 690 700 710
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKLGWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQR
.. .. . :.: .. .::.:.:::.: :.::.:.: : : .:: : :.. .::: .:
CCDS42 DIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDFLYLKVGVN-PLLRLPRCLKYMAFFEFNSR
720 730 740 750 760 770
290 300 310 320 330 340
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CCDS42 LESILSKAYVYRVIRTTAYLLYSLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGN--------
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.:. :... :: ::: : : : :: ..... ::. :....:.. .... .:..
CCDS42 SYIRCYYFAVKTLITIGGLPDPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQ
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pF1KE5 AEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWTNKKTVDEKEVLKYLPDKLRAEIAI
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CCDS42 TYYRSCMDSTVKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAI
900 910 920 930 940 950
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pF1KE5 NVHLDTLKKVRIFADCEAGLLVELVLKLQPQVYSPGDYICKKGDIGREMYIIKEGKLAVV
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CCDS42 DVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMYIIQAGQVQVL
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KE5 AD-DGVTQFVVLSDGSYFGEISILNIKGSKAGNRRTANIKSIGYSDLFCLSKDDLMEALT
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CCDS42 GGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGG---GNRRTANVVAHGFTNLFILDKKDLNEILV
1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KE5 EYPDAKTMLEEKGKQILMKDGLLDLNIANAGSDPKDLEEKVTRMEGSVDLLQTRFARILA
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CCDS42 HYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILPPRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGG
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>>CCDS6244.1 CNGB3 gene_id:54714|Hs108|chr8 (809 aa)
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10 20
pF1KE5 MKLSMKNN----IINTQQSFVTMPNVIVPDI
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CCDS62 AQEENKGEEKSLKTKSTPVTSEEPHTNIQDKLSKKNSSGDLTTNPDPQNAAEPTGTVPE-
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30 40 50 60 70 80
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.::. ..: .: .. .: . .: . . : : .:. ... . : .
CCDS62 QKEMDPGKEGP-NSPQNKPPAAPVINEYADAQLHNL----VKRMRQRTALYKKKLVEGDL
110 120 130 140 150
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pF1KE5 ALFNVNNSSNKDQEPEEKKKKKKEKKSKSDDKNENKNDPEKKKKKKDKEKKKKEEKSKDK
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CCDS62 --------SSPEASPQTAKPTAVPPVKESDDK------PTEHYYRLLWFKVKKMPLTEYL
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pF1KE5 KEEEKKEVVVIDP-SGNTYYNWLFCITLPVMYNWT--MVIARACFDELQSDYLEYWLILD
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CCDS62 KR--IKLPNSIDSYTDRLYLLWLLLVTLA--YNWNCCFIPLRLVFPYQTADNIHYWLIAD
210 220 230 240 250
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pF1KE5 YVSDIVYLIDM-FVRTRTGYLEQGLLVKEELKLINKYKSNLQFKLDVLSLIPTDLLYFKL
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CCDS62 IICDIIYLYDMLFIQPRLQFVRGGDIIVDSNELRKHYRTSTKFQLDVASIIPFDICYLFF
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pF1KE5 GWNYPEIRLNRLLRFSRMFEFFQRTETRTNYPNIFRISNLVMYIVIIIHWNACVFYSISK
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CCDS62 GFN-PMFRANRMLKYTSFFEFNHHLESIMDKAYIYRVIRTTGYLLFILHINACVYYWASN
320 330 340 350 360 370
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pF1KE5 AIGFGNDTWVYPDINDPEFGRLARKYVYSLYWSTLTLTTIGETPPPVRDSEYVFVVVDFL
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CCDS62 YEGIGTTRWVY----DGE----GNEYLRCYYWAVRTLITIGGLPEPQTLFEIVFQLLNFF
380 390 400 410 420
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pF1KE5 IGVLIFATIVGNIGSMISNMNAARAEFQARIDAIKQYMHFRNVSKDMEKRVIKWFDYLWT
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CCDS62 SGVFVFSSLIGQMRDVIGAATANQNYFRACMDDTIAYMNNYSIPKLVQKRVRTWYEYTWD
430 440 450 460 470 480
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