Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5711, 805 aa
1>>>pF1KE5711 805 - 805 aa - 805 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8203+/-0.000984; mu= 13.6877+/- 0.059
mean_var=104.8101+/-20.311, 0's: 0 Z-trim(108.0): 47 B-trim: 72 in 1/50
Lambda= 0.125277
statistics sampled from 9861 (9901) to 9861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 ( 805) 5401 987.3 0
CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 ( 968) 2496 462.3 1.7e-129
CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 613) 1904 355.2 1.9e-97
CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 624) 1904 355.2 1.9e-97
CCDS58971.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 523) 1221 231.7 2.4e-60
CCDS58972.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 602) 831 161.3 4.5e-39
CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253) 407 84.9 1.6e-15
CCDS45385.1 PKD1 gene_id:5310|Hs108|chr16 (4302) 358 76.2 1.3e-12
CCDS32369.1 PKD1 gene_id:5310|Hs108|chr16 (4303) 358 76.2 1.3e-12
>>CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 (805 aa)
initn: 5401 init1: 5401 opt: 5401 Z-score: 5276.9 bits: 987.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5401; 100.0% identity (100.0% similar) in 805 aa overlap (1-805:1-805)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKKPEDEPQET
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CCDS74 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKKPEDEPQET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 AYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 MTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MTSSSAYYYTKVMSELFLHTPSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 GHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIFC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 VFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 QPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 AVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPAY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 FVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLRKE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 RVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 MRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLETV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 LEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWKHPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEV
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE5 PYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
:::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
790 800
>>CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 (968 aa)
initn: 1314 init1: 1054 opt: 2496 Z-score: 2438.2 bits: 462.3 E(32554): 1.7e-129
Smith-Waterman score: 2582; 52.9% identity (80.5% similar) in 733 aa overlap (27-740:161-872)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKK-P-E
::: : : .: .: .. : :
CCDS36 VSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCP---------SPVGGGDPLHRHLPLE
140 150 160 170 180
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 DEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDI
.: ..:. . . .:.:::::: : :... ::: :.:..::::..:..::. .
CCDS36 GQPPRVAWAER-------LVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVL
190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTP-SDT-GVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWT
:.::::: ::..::::..::.::: :: : : ..:...::: ::: :..: :::.:::
CCDS36 CILTYGMMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWK
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKE
.::. . ..:::.:::.::::::.:::.::: :: . .:.:..: :::::: ..:
CCDS36 MQPSNQTEAD-NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSE
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 EQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGL
.. :::: ::::: : :. .:.: :::: ...:::.:::::: .:. .: . .:....
CCDS36 DRAPFGPRNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNV
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 WLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFI
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CCDS36 WLDRGTRATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFL
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 VGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVN
..::.::: ::::::::::::..::.:.:. :.:: ::.:...::.::.:..:.:: .:.
CCDS36 AACEIIFCFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVE
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 RLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLAR
:. ..:.. ::. .:: ::.:: :.::. ::..::.:::.::.:.::.::.:::.:..:
CCDS36 VLL-QFLEDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSR
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 CAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNA
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CCDS36 CAKDLFGFAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEA
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 NRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTL
::.::: ::.:.:::.::.::::::::::::::::: .:: :: :..::::...::.:.:
CCDS36 NRVLGPIYFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKAL
660 670 680 690 700 710
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 LRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRI
..:.:.:. :.:... :. : ...:... . :. ::.. :: : :::.:.::..
CCDS36 VKLKLKKNTVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEI---EAIFTKYDQDGDQE
720 730 740 750 760
660 670 680 690 700
pF1KE5 LDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSS--PQG----------KSGPEAARAGG
: :.:...::.:::.:: :. . .: : . : :.. :: . : :.
CCDS36 LTEHEHQQMRDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGS
770 780 790 800 810 820
710 720 730 740 750
pF1KE5 WVSG---EEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWK
:: ::: .:.::: ..: . ..::.:::: ::...::
CCDS36 ISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVA
830 840 850 860 870 880
760 770 780 790 800
pF1KE5 HPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS
CCDS36 EDERLGRDSEIHREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSS
890 900 910 920 930 940
>>CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (613 aa)
initn: 1746 init1: 1403 opt: 1904 Z-score: 1862.9 bits: 355.2 E(32554): 1.9e-97
Smith-Waterman score: 1904; 50.6% identity (79.5% similar) in 547 aa overlap (93-635:21-559)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYGMT
.:. : :::.:::.:..::...:.::.::.
CCDS43 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SSSAYYYTKVMSELFLHT--PSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
. :: .:::: ::: : :.. ..:..: :..::: : .::::..::: .:::::.:
CCDS43 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230
pF1KE5 GH-GSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGP
. . : :::::.::::::.:::::::..: :. .:. . :: :. .:. ::
CCDS43 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTR
.: : : ... . . ::: : : .::: . : :.. . . . :. . :. ::::
CCDS43 QINTEWRYSTSNTNSPW-HWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIF
:.:::::.::::.::::..:::.::::::: . :::. .:::.:::: .:.::..::. :
CCDS43 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLL
:.:.: ....:. ... . :..:::: :.:...:: .:::.:. . .... :.:.::
CCDS43 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 QQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILG
.. . :.:: ::: :. :::. :...:::::::::.:::::::.::::::.::.:::.:
CCDS43 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 FAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPA
::.::::.::::::::.:.::.::..:::: . ::.::::.::::.. .:..:: ::::
CCDS43 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 YFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELA-GQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLR
::.:..::::::::::::::::::::::: . . :.. ...:. ..::.:...: ..::.
CCDS43 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK
470 480 490 500 510 520
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 KERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRILDEKEQ
: . .. .:. .: :... :. : :.::
CCDS43 KAQKDEDKKTKGSG-------DLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQ
530 540 550 560 570 580
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 EKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSSPQGKSGPEAARAGGWVSGEEFYMLTRRVLQLE
CCDS43 DDYQPVTQEEFRDGTTTKYKMRFSECLTKRI
590 600 610
>>CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (624 aa)
initn: 1746 init1: 1403 opt: 1904 Z-score: 1862.8 bits: 355.2 E(32554): 1.9e-97
Smith-Waterman score: 1904; 50.6% identity (79.5% similar) in 547 aa overlap (93-635:21-559)
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDICLLTYGMT
.:. : :::.:::.:..::...:.::.::.
CCDS78 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SSSAYYYTKVMSELFLHT--PSDTGVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWTKWYNNQSL
. :: .:::: ::: : :.. ..:..: :..::: : .::::..::: .:::::.:
CCDS78 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230
pF1KE5 GH-GSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKEEQLPFGP
. . : :::::.::::::.:::::::..: :. .:. . :: :. .:. ::
CCDS78 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGLWLDRGTR
.: : : ... . . ::: : : .::: . : :.. . . . :. . :. ::::
CCDS78 QINTEWRYSTSNTNSPW-HWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFIVGCEVIF
:.:::::.::::.::::..:::.::::::: . :::. .:::.:::: .:.::..::. :
CCDS78 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 CVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVNRLMGKLL
:.:.: ....:. ... . :..:::: :.:...:: .:::.:. . .... :.:.::
CCDS78 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 QQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLARCAKDILG
.. . :.:: ::: :. :::. :...:::::::::.:::::::.::::::.::.:::.:
CCDS78 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 FAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNANRILGPA
::.::::.::::::::.:.::.::..:::: . ::.::::.::::.. .:..:: ::::
CCDS78 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 YFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELA-GQKDELQLSDLLKQGYNKTLLRLRLR
::.:..::::::::::::::::::::::: . . :.. ...:. ..::.:...: ..::.
CCDS78 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK
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CCDS58 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL
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CCDS58 QINTEWRYSTSNTNSPW-HWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR
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CCDS58 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLL----------------------L
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CCDS58 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG
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CCDS58 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI
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. :..:.:.... . : . . . . . .. .. :..:. . :. . .: ...
CCDS14 VRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIRFYLSNPEDFIPFHAV----SQVDHI
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. : :. .. :.: . ... . .. . . :. : :.: ::.: .:::
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.:: . :.:..:. : : .. :. . ..: ::::: .. .... .. ::.:.:
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CCDS14 AVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKL-RTMFSFLTSQSKAKDEPEFFIDMLYGQ
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CCDS14 PEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV
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CCDS45 VRLAQLGAADRQWTRFVRGRPRRFTSFDQVAQLSSAARGLAASLLFLLLVKAAQQLRFVR
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CCDS32 SLVAKRLHPDEDDTLVESPAVTPVSARVPRVRPPHGFALFLAKEEARKVKRLHGMLRSLL
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CCDS32 VYMLFLLVTLLASYGDASCHGHAY-RLQSAIKQELHSR---AFLAITRSEELWPWMAHVL
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: . ::..: . :: :::::..... : :
CCDS32 LPYV------------HGNQS-----SPELGPPRLRQVRLQEALYPDPPGPRVHTCSAAG
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pF1KE5 VYSPDKEEQLPFGPFNGTA-WTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEA
.: . . .: ::.. :.: . : ::..: :: . :..::: .: : . : .
CCDS32 GFSTSDYDVGWESPHNGSGTWAYSAPDLLGAWS-WGSCAVYDSGGYVQELGLSLEESRDR
3780 3790 3800 3810 3820 3830
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:: :: ::: .:.::.... :. ..: .. : .::::.: :. . ..: : :
CCDS32 LRFLQLHNWLDNRSRAVFLELTRYSPAVGLHAAVTLRLEFPAAGRALAALSVRPFALRRL
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.. .. .. : . .: ...: : : . : : : . : :.: : . .:.
CCDS32 SAGLSLPLL-TSVCLLLFAVHFAVAEARTWHREGRWRVLRLGAWARW-LLVALTAATAL-
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.. . ..: .... .: ...:. .: .. .. : ::. .: . . : .
CCDS32 VRLAQLGAADRQWTRFVRGRPRRFTSFDQVAQLSSAARGLAASLLFLLLVKAAQQLRFVR
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pF1KE5 TMTQLSSTLARCAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIIL
. ...:: : ..:: .. . .. :::::. :: .. :...
CCDS32 QWSVFGKTLCRALPELLGVTLGLVVLGVAYAQLAILLVSSCVDSLWSVAQALLVLCPGTG
4020 4030 4040 4050 4060 4070
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pF1KE5 GDFDYNAIDNANRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLS
CCDS32 LSTLCPAESWHLSPLLCVGLWALRLWGALRLGAVILRWRYHALRGELYRPAWEPQDYEMV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]