Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5683
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5683, 552 aa
1>>>pF1KE5683 552 - 552 aa - 552 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3331+/-0.000536; mu= 18.3790+/- 0.033
mean_var=68.6288+/-14.364, 0's: 0 Z-trim(106.6): 35 B-trim: 650 in 1/49
Lambda= 0.154818
statistics sampled from 14721 (14735) to 14721 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 7.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005319 (OMIM: 601636) hyaluronan synthase 2 [Ho ( 552) 3718 840.4 0
NP_005320 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 iso ( 553) 2735 620.8 3.4e-177
XP_011521363 (OMIM: 602428) PREDICTED: hyaluronan ( 553) 2735 620.8 3.4e-177
XP_005255978 (OMIM: 602428) PREDICTED: hyaluronan ( 553) 2735 620.8 3.4e-177
NP_001186209 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 ( 553) 2735 620.8 3.4e-177
NP_001284365 (OMIM: 601463) hyaluronan synthase 1 ( 577) 1675 384.1 6.5e-106
NP_001514 (OMIM: 601463) hyaluronan synthase 1 iso ( 578) 1675 384.1 6.5e-106
NP_619515 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 iso ( 281) 1041 242.3 1.5e-63
XP_011525186 (OMIM: 601463) PREDICTED: hyaluronan ( 328) 612 146.5 1.2e-34
>>NP_005319 (OMIM: 601636) hyaluronan synthase 2 [Homo s (552 aa)
initn: 3718 init1: 3718 opt: 3718 Z-score: 4488.9 bits: 840.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3718; 100.0% identity (100.0% similar) in 552 aa overlap (1-552:1-552)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKSLETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVVMVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SLFAFLEHRKMKKSLETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVVMVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVLSNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVLSNKS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVGGVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVGGVGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 DVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFVEDWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFVEDWY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 NQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSKSYFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSKSYFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 EWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLVGLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLVGLIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 SSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFIGLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFIGLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 VSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINKCGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINKCGRR
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE5 KKGQQYDMVLDV
::::::::::::
NP_005 KKGQQYDMVLDV
550
>>NP_005320 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 isoform (553 aa)
initn: 2720 init1: 2048 opt: 2735 Z-score: 3302.3 bits: 620.8 E(85289): 3.4e-177
Smith-Waterman score: 2735; 70.5% identity (90.1% similar) in 546 aa overlap (10-550:9-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::..::.::....: :: :::..:::::.:...:.:::::::.:. ::.::
NP_005 MPVQLTTALRVVGTSLFALAVLGGILAAYVTGYQFIHTEKHYLSFGLYGAILGLHLLIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKS---LETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVV
:::::::::.:... :. : .:::::::::::::::::::.:..:...: .:::
NP_005 SLFAFLEHRRMRRAGQALKLPSPRRGSVALCIAAYQEDPDYLRKCLRSAQRISFPDLKVV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMG-RDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVL
::.::: ..: ::.::: ::.: .... ..:..:::: : :::. : .:. ..: ..:
NP_005 MVVDGNRQEDAYMLDIFHEVLGGTEQAGFFVWRSNFHEAGEGETEASLQEGMDRVRDVVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVG
.. :::::::::::::::::.::: ::::.:::::::.:::: ..::..::::::.::
NP_005 ASTFSCIMQKWGGKREVMYTAFKALGDSVDYIQVCDSDTVLDPACTIEMLRVLEEDPQVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:.
NP_005 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNVERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLQQFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSK
::::.:.:.:..:::::::::::::::::: :::::::::::::: .:::::::::::::
NP_005 EDWYHQKFLGSKCSFGDDRHLTNRVLSLGYRTKYTARSKCLTETPTKYLRWLNQQTRWSK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLV
:::::::::..::::::::::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_005 SYFREWLYNSLWFHKHHLWMTYESVVTGFFPFFLIATVIQLFYRGRIWNILLFLLTVQLV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFI
:.::...: :::: :.::::::.::::::::::.::::::::.:::::::::::::::
NP_005 GIIKATYACFLRGNAEMIFMSLYSLLYMSSLLPAKIFAIATINKSGWGTSGRKTIVVNFI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINK
::::::.: ..::::. .: : .. :::.. . :. :..::.:::: :: ::...: .
NP_005 GLIPVSIWVAVLLGGLAYTAYCQDL--FSETELAFLVSGAILYGCYWVALLMLYLAIIAR
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE5 -CGRRKKGQQYDMVLDV
:: :: .::....
NP_005 RCG--KKPEQYSLAFAEV
540 550
>>XP_011521363 (OMIM: 602428) PREDICTED: hyaluronan synt (553 aa)
initn: 2720 init1: 2048 opt: 2735 Z-score: 3302.3 bits: 620.8 E(85289): 3.4e-177
Smith-Waterman score: 2735; 70.5% identity (90.1% similar) in 546 aa overlap (10-550:9-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::..::.::....: :: :::..:::::.:...:.:::::::.:. ::.::
XP_011 MPVQLTTALRVVGTSLFALAVLGGILAAYVTGYQFIHTEKHYLSFGLYGAILGLHLLIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKS---LETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVV
:::::::::.:... :. : .:::::::::::::::::::.:..:...: .:::
XP_011 SLFAFLEHRRMRRAGQALKLPSPRRGSVALCIAAYQEDPDYLRKCLRSAQRISFPDLKVV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMG-RDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVL
::.::: ..: ::.::: ::.: .... ..:..:::: : :::. : .:. ..: ..:
XP_011 MVVDGNRQEDAYMLDIFHEVLGGTEQAGFFVWRSNFHEAGEGETEASLQEGMDRVRDVVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVG
.. :::::::::::::::::.::: ::::.:::::::.:::: ..::..::::::.::
XP_011 ASTFSCIMQKWGGKREVMYTAFKALGDSVDYIQVCDSDTVLDPACTIEMLRVLEEDPQVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:.
XP_011 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNVERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLQQFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSK
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XP_011 EDWYHQKFLGSKCSFGDDRHLTNRVLSLGYRTKYTARSKCLTETPTKYLRWLNQQTRWSK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLV
:::::::::..::::::::::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_011 SYFREWLYNSLWFHKHHLWMTYESVVTGFFPFFLIATVIQLFYRGRIWNILLFLLTVQLV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFI
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XP_011 GIIKATYACFLRGNAEMIFMSLYSLLYMSSLLPAKIFAIATINKSGWGTSGRKTIVVNFI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINK
::::::.: ..::::. .: : .. :::.. . :. :..::.:::: :: ::...: .
XP_011 GLIPVSIWVAVLLGGLAYTAYCQDL--FSETELAFLVSGAILYGCYWVALLMLYLAIIAR
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE5 -CGRRKKGQQYDMVLDV
:: :: .::....
XP_011 RCG--KKPEQYSLAFAEV
540 550
>>XP_005255978 (OMIM: 602428) PREDICTED: hyaluronan synt (553 aa)
initn: 2720 init1: 2048 opt: 2735 Z-score: 3302.3 bits: 620.8 E(85289): 3.4e-177
Smith-Waterman score: 2735; 70.5% identity (90.1% similar) in 546 aa overlap (10-550:9-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::..::.::....: :: :::..:::::.:...:.:::::::.:. ::.::
XP_005 MPVQLTTALRVVGTSLFALAVLGGILAAYVTGYQFIHTEKHYLSFGLYGAILGLHLLIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKS---LETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVV
:::::::::.:... :. : .:::::::::::::::::::.:..:...: .:::
XP_005 SLFAFLEHRRMRRAGQALKLPSPRRGSVALCIAAYQEDPDYLRKCLRSAQRISFPDLKVV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMG-RDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVL
::.::: ..: ::.::: ::.: .... ..:..:::: : :::. : .:. ..: ..:
XP_005 MVVDGNRQEDAYMLDIFHEVLGGTEQAGFFVWRSNFHEAGEGETEASLQEGMDRVRDVVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVG
.. :::::::::::::::::.::: ::::.:::::::.:::: ..::..::::::.::
XP_005 ASTFSCIMQKWGGKREVMYTAFKALGDSVDYIQVCDSDTVLDPACTIEMLRVLEEDPQVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:.
XP_005 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNVERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLQQFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 EDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSK
::::.:.:.:..:::::::::::::::::: :::::::::::::: .:::::::::::::
XP_005 EDWYHQKFLGSKCSFGDDRHLTNRVLSLGYRTKYTARSKCLTETPTKYLRWLNQQTRWSK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLV
:::::::::..::::::::::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_005 SYFREWLYNSLWFHKHHLWMTYESVVTGFFPFFLIATVIQLFYRGRIWNILLFLLTVQLV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 GLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFI
:.::...: :::: :.::::::.::::::::::.::::::::.:::::::::::::::
XP_005 GIIKATYACFLRGNAEMIFMSLYSLLYMSSLLPAKIFAIATINKSGWGTSGRKTIVVNFI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINK
::::::.: ..::::. .: : .. :::.. . :. :..::.:::: :: ::...: .
XP_005 GLIPVSIWVAVLLGGLAYTAYCQDL--FSETELAFLVSGAILYGCYWVALLMLYLAIIAR
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE5 -CGRRKKGQQYDMVLDV
:: :: .::....
XP_005 RCG--KKPEQYSLAFAEV
540 550
>>NP_001186209 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 isof (553 aa)
initn: 2720 init1: 2048 opt: 2735 Z-score: 3302.3 bits: 620.8 E(85289): 3.4e-177
Smith-Waterman score: 2735; 70.5% identity (90.1% similar) in 546 aa overlap (10-550:9-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::..::.::....: :: :::..:::::.:...:.:::::::.:. ::.::
NP_001 MPVQLTTALRVVGTSLFALAVLGGILAAYVTGYQFIHTEKHYLSFGLYGAILGLHLLIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKS---LETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVV
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NP_001 SLFAFLEHRRMRRAGQALKLPSPRRGSVALCIAAYQEDPDYLRKCLRSAQRISFPDLKVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMG-RDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVL
::.::: ..: ::.::: ::.: .... ..:..:::: : :::. : .:. ..: ..:
NP_001 MVVDGNRQEDAYMLDIFHEVLGGTEQAGFFVWRSNFHEAGEGETEASLQEGMDRVRDVVR
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pF1KE5 SNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVG
.. :::::::::::::::::.::: ::::.:::::::.:::: ..::..::::::.::
NP_001 ASTFSCIMQKWGGKREVMYTAFKALGDSVDYIQVCDSDTVLDPACTIEMLRVLEEDPQVG
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pF1KE5 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:.
NP_001 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNVERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLQQFL
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pF1KE5 EDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARSKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSK
::::.:.:.:..:::::::::::::::::: :::::::::::::: .:::::::::::::
NP_001 EDWYHQKFLGSKCSFGDDRHLTNRVLSLGYRTKYTARSKCLTETPTKYLRWLNQQTRWSK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 SYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATVIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLV
:::::::::..::::::::::::...:::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 SYFREWLYNSLWFHKHHLWMTYESVVTGFFPFFLIATVIQLFYRGRIWNILLFLLTVQLV
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pF1KE5 GLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFAIATINKAGWGTSGRKTIVVNFI
:.::...: :::: :.::::::.::::::::::.::::::::.:::::::::::::::
NP_001 GIIKATYACFLRGNAEMIFMSLYSLLYMSSLLPAKIFAIATINKSGWGTSGRKTIVVNFI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 GLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTVLIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINK
::::::.: ..::::. .: : .. :::.. . :. :..::.:::: :: ::...: .
NP_001 GLIPVSIWVAVLLGGLAYTAYCQDL--FSETELAFLVSGAILYGCYWVALLMLYLAIIAR
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KE5 -CGRRKKGQQYDMVLDV
:: :: .::....
NP_001 RCG--KKPEQYSLAFAEV
540 550
>>NP_001284365 (OMIM: 601463) hyaluronan synthase 1 isof (577 aa)
initn: 2062 init1: 1607 opt: 1675 Z-score: 2022.5 bits: 384.1 E(85289): 6.5e-106
Smith-Waterman score: 2085; 54.3% identity (78.7% similar) in 554 aa overlap (11-543:20-571)
10 20 30 40
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGI-TAAYIVGYQFIQTDNY-YFSFGLY
: . : :.. :.::. : :: .: . .: : ..::::
NP_001 MRQDAPKPTPAACRCSGLARRVLTIAFAL-LILGLMTWAYAAGVP-LASDRYGLLAFGLY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 GAFLASHLIIQSLFAFLEHRKMKKSLETPIK--LNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVK
::::..::. :::::.::::.. . . :. ..::: :.:::::: :::.:: :..
NP_001 GAFLSAHLVAQSLFAYLEHRRVAAAARGPLDAATARSVALTISAYQEDPAYLRQCLASAR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 RLTYPG--IKVVMVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEK---------G
: :: ..:.::.::: .::::.:.: ::.. . :::.: .:.:. :
NP_001 ALLYPRARLRVLMVVDGNRAEDLYMVDMFREVFADEDPATYVWDGNYHQPWEPAAAGAVG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 PGETDESHKESSQH--VTQLVLSNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSD
: : . :. . : :: . . .:. :.::::::::::::.::: :::::::::::
NP_001 AGAYREVEAEDPGRLAVEALVRTRRCVCVAQRWGGKREVMYTAFKALGDSVDYVQVCDSD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TMLDPASSVEMVKVLEEDPMVGGVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYF
: ::: . .:.:.::.::: ::.:::::.::: :::.:::::.:::.:::.::::::::
NP_001 TRLDPMALLELVRVLDEDPRVGAVGGDVRILNPLDSWVSFLSSLRYWVAFNVERACQSYF
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GCVQCISGPLGMYRNSLLHEFVEDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTARS
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NP_001 HCVSCISGPLGLYRNNLLQQFLEAWYNQKFLGTHCTFGDDRHLTNRMLSMGYATKYTSRS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 KCLTETPIEYLRWLNQQTRWSKSYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIATV
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NP_001 RCYSETPSSFLRWLSQQTRWSKSYFREWLYNALWWHRHHAWMTYEAVVSGLFPFFVAATV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 IQLFYRGKIWNILLFLLTVQLVGLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMFA
..::: :. : .: :: :: :.: :..::. ::: . ::..:::. ::: .:::::..:
NP_001 LRLFYAGRPWALLWVLLCVQGVALAKAAFAAWLRGCLRMVLLSLYAPLYMCGLLPAKFLA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 IATINKAGWGTSGRKTIVVNFIGLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTV---
..:.:..:::::::. ...:.. :.:...: .::::.. .. .:.. .: ....
NP_001 LVTMNQSGWGTSGRRKLAANYVPLLPLALWALLLLGGLVRSVAHEARADWSGPSRAAEAY
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KE5 -LIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINKCGRRKKGQQYDMVLDV
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NP_001 HLAAGAGAYVGYWVAMLTLYWVGVRRLCRRRTGGYRVQV
540 550 560 570
>>NP_001514 (OMIM: 601463) hyaluronan synthase 1 isoform (578 aa)
initn: 2062 init1: 1607 opt: 1675 Z-score: 2022.5 bits: 384.1 E(85289): 6.5e-106
Smith-Waterman score: 2085; 54.3% identity (78.7% similar) in 554 aa overlap (11-543:21-572)
10 20 30 40
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGI-TAAYIVGYQFIQTDNY-YFSFGL
: . : :.. :.::. : :: .: . .: : ..:::
NP_001 MRQQDAPKPTPAACRCSGLARRVLTIAFAL-LILGLMTWAYAAGVP-LASDRYGLLAFGL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YGAFLASHLIIQSLFAFLEHRKMKKSLETPIK--LNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSV
:::::..::. :::::.::::.. . . :. ..::: :.:::::: :::.:: :.
NP_001 YGAFLSAHLVAQSLFAYLEHRRVAAAARGPLDAATARSVALTISAYQEDPAYLRQCLASA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 KRLTYPG--IKVVMVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEK---------
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NP_001 RALLYPRARLRVLMVVDGNRAEDLYMVDMFREVFADEDPATYVWDGNYHQPWEPAAAGAV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 GPGETDESHKESSQH--VTQLVLSNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDS
: : : . :. . : :: . . .:. :.::::::::::::.::: ::::::::::
NP_001 GAGAYREVEAEDPGRLAVEALVRTRRCVCVAQRWGGKREVMYTAFKALGDSVDYVQVCDS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 DTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVGGVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSY
:: ::: . .:.:.::.::: ::.:::::.::: :::.:::::.:::.:::.:::::::
NP_001 DTRLDPMALLELVRVLDEDPRVGAVGGDVRILNPLDSWVSFLSSLRYWVAFNVERACQSY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFVEDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTAR
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NP_001 FHCVSCISGPLGLYRNNLLQQFLEAWYNQKFLGTHCTFGDDRHLTNRMLSMGYATKYTSR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 SKCLTETPIEYLRWLNQQTRWSKSYFREWLYNAMWFHKHHLWMTYEAIITGFFPFFLIAT
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NP_001 SRCYSETPSSFLRWLSQQTRWSKSYFREWLYNALWWHRHHAWMTYEAVVSGLFPFFVAAT
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 VIQLFYRGKIWNILLFLLTVQLVGLIKSSFASCLRGNIVMVFMSLYSVLYMSSLLPAKMF
:..::: :. : .: :: :: :.: :..::. ::: . ::..:::. ::: .:::::..
NP_001 VLRLFYAGRPWALLWVLLCVQGVALAKAAFAAWLRGCLRMVLLSLYAPLYMCGLLPAKFL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 AIATINKAGWGTSGRKTIVVNFIGLIPVSVWFTILLGGVIFTIYKESKRPFSESKQTV--
:..:.:..:::::::. ...:.. :.:...: .::::.. .. .:.. .: ....
NP_001 ALVTMNQSGWGTSGRRKLAANYVPLLPLALWALLLLGGLVRSVAHEARADWSGPSRAAEA
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KE5 --LIVGTLLYACYWVMLLTLYVVLINKCGRRKKGQQYDMVLDV
: .:. :. ::: .:::: : . . ::. :
NP_001 YHLAAGAGAYVGYWVAMLTLYWVGVRRLCRRRTGGYRVQV
540 550 560 570
>>NP_619515 (OMIM: 602428) hyaluronan synthase 3 isoform (281 aa)
initn: 764 init1: 483 opt: 1041 Z-score: 1261.8 bits: 242.3 E(85289): 1.5e-63
Smith-Waterman score: 1041; 61.8% identity (87.0% similar) in 238 aa overlap (10-243:9-246)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGITAAYIVGYQFIQTDNYYFSFGLYGAFLASHLIIQ
::..::.::....: :: :::..:::::.:...:.:::::::.:. ::.::
NP_619 MPVQLTTALRVVGTSLFALAVLGGILAAYVTGYQFIHTEKHYLSFGLYGAILGLHLLIQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 SLFAFLEHRKMKKS---LETPIKLNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSVKRLTYPGIKVV
:::::::::.:... :. : .:::::::::::::::::::.:..:...: .:::
NP_619 SLFAFLEHRRMRRAGQALKLPSPRRGSVALCIAAYQEDPDYLRKCLRSAQRISFPDLKVV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMG-RDKSATYIWKNNFHEKGPGETDESHKESSQHVTQLVL
::.::: ..: ::.::: ::.: .... ..:..:::: : :::. : .:. ..: ..:
NP_619 MVVDGNRQEDAYMLDIFHEVLGGTEQAGFFVWRSNFHEAGEGETEASLQEGMDRVRDVVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDSDTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVG
.. :::::::::::::::::.::: ::::.:::::::.:::: ..::..::::::.::
NP_619 ASTFSCIMQKWGGKREVMYTAFKALGDSVDYIQVCDSDTVLDPACTIEMLRVLEEDPQVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSYFGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFV
:::::::
NP_619 GVGGDVQPPGKGMAVEDDQVQAAQVRATEAWSVHQRHVSREQ
240 250 260 270 280
>>XP_011525186 (OMIM: 601463) PREDICTED: hyaluronan synt (328 aa)
initn: 1003 init1: 610 opt: 612 Z-score: 743.0 bits: 146.5 E(85289): 1.2e-34
Smith-Waterman score: 1022; 54.1% identity (74.7% similar) in 292 aa overlap (11-285:21-310)
10 20 30 40
pF1KE5 MHCERFLCILRIIGTTLFGVSLLLGI-TAAYIVGYQFIQTDNY-YFSFGL
: . : :.. :.::. : :: .: . .: : ..:::
XP_011 MRQQDAPKPTPAACRCSGLARRVLTIAFAL-LILGLMTWAYAAGVP-LASDRYGLLAFGL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YGAFLASHLIIQSLFAFLEHRKMKKSLETPIK--LNKTVALCIAAYQEDPDYLRKCLQSV
:::::..::. :::::.::::.. . . :. ..::: :.:::::: :::.:: :.
XP_011 YGAFLSAHLVAQSLFAYLEHRRVAAAARGPLDAATARSVALTISAYQEDPAYLRQCLASA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 KRLTYPG--IKVVMVIDGNSEDDLYMMDIFSEVMGRDKSATYIWKNNFHEK---------
. : :: ..:.::.::: .::::.:.: ::.. . :::.: .:.:.
XP_011 RALLYPRARLRVLMVVDGNRAEDLYMVDMFREVFADEDPATYVWDGNYHQPWEPAAAGAV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 GPGETDESHKESSQH--VTQLVLSNKSICIMQKWGGKREVMYTAFRALGRSVDYVQVCDS
: : : . :. . : :: . . .:. :.::::::::::::.::: ::::::::::
XP_011 GAGAYREVEAEDPGRLAVEALVRTRRCVCVAQRWGGKREVMYTAFKALGDSVDYVQVCDS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 DTMLDPASSVEMVKVLEEDPMVGGVGGDVQILNKYDSWISFLSSVRYWMAFNIERACQSY
:: ::: . .:.:.::.::: ::.:::::.::: :::.:::::.:::.:::.:::::::
XP_011 DTRLDPMALLELVRVLDEDPRVGAVGGDVRILNPLDSWVSFLSSLRYWVAFNVERACQSY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FGCVQCISGPLGMYRNSLLHEFVEDWYNQEFMGNQCSFGDDRHLTNRVLSLGYATKYTAR
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XP_011 FHCVSCISGPLGTPPGPAATQRRPRPSCGG
300 310 320
552 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:29:18 2016 done: Tue Nov 8 03:29:20 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]