FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5668, 528 aa
1>>>pF1KE5668 528 - 528 aa - 528 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3639+/-0.000937; mu= 18.0000+/- 0.056
mean_var=67.0932+/-13.220, 0's: 0 Z-trim(105.2): 24 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.156580
statistics sampled from 8272 (8290) to 8272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 528) 3621 827.2 0
CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 574) 2971 680.4 1.5e-195
CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 2522 579.0 5e-165
CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 2356 541.4 9e-154
CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 1975 455.4 7.9e-128
CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 1006 236.5 5.9e-62
CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 1006 236.5 6e-62
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 1006 236.5 6.1e-62
CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 643 154.5 2.7e-37
CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 583 141.0 4.1e-33
CCDS10608.1 SCNN1G gene_id:6340|Hs108|chr16 ( 649) 275 71.4 3.6e-12
>>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa)
initn: 3621 init1: 3621 opt: 3621 Z-score: 4418.3 bits: 827.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3621; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 EQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 DKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
490 500 510 520
>>CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (574 aa)
initn: 2971 init1: 2971 opt: 2971 Z-score: 3624.2 bits: 680.4 E(32554): 1.5e-195
Smith-Waterman score: 3406; 91.8% identity (91.8% similar) in 560 aa overlap (1-514:1-560)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE5 EQKKAYEIAGLLG----------------------------------------------D
::::::::::::: :
CCDS87 EQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGCSLLSHEGPPPQRPFPKPCCLGD
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE5 IGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 IGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRH
490 500 510 520 530 540
500 510 520
pF1KE5 NPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
::::::::::::::::::::
CCDS87 NPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
550 560 570
>>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa)
initn: 2814 init1: 2515 opt: 2522 Z-score: 3076.2 bits: 579.0 E(32554): 5e-165
Smith-Waterman score: 2794; 78.9% identity (88.7% similar) in 522 aa overlap (7-528:53-562)
10 20 30
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSY
.: : .:... :::.: :::: :::
CCDS58 DIWGPHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPMDLVAFANSCTLHGTNHIFVE
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 ERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLN
. ...:::. :. .:...:: .:: ::. : ::: :.:::...:.:::::::: :
CCDS58 GGPGPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTN
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 EFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMRE
:.::.: :: . . .:.: .. . : . .: ..:. .:::...
CCDS58 AVRLSQLSYPDLLYLAPMLGL--DESDDPGVPLAPPGP----------EAFSGEPFNLHR
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 FYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
::.:. : ..:::: : ..: :. ..:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FYNRSCHRLEDMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGN
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQ
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPY
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNK
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDY
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 AYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPH
500 510 520 530 540 550
520
pF1KE5 HPARGTFEDFTC
::::::::::::
CCDS58 HPARGTFEDFTC
560
>>CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (512 aa)
initn: 1378 init1: 1378 opt: 2356 Z-score: 2874.2 bits: 541.4 E(32554): 9e-154
Smith-Waterman score: 2387; 66.1% identity (84.8% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLCV
:.:: : :..:: ::: ::..:::::. ::: : :...:.:::. :.:::..::
CCDS42 MDLKESPSE-GSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 CTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLNN
.:::.::: :.::::.:::.:..:.:::::::::: ::::... :::::::::::::.
CCDS42 SSERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKPFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCS
.::: ..:: . :: :..::::. .::: :.: :: :.:::..::.: :.:.:. :.
CCDS42 NLQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQFSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETS
.:: .:::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::::::::::::.::::.::.
CCDS42 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 FEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: ::::: ::::::: :.. : ::
CCDS42 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEM--GLD
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEY
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::.::::.::: .:.:::..:
CCDS42 FFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 CVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETI
:.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::.:::::::::::.::::::
CCDS42 CLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 EQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSA
:::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.::.:: :: ..:
CCDS42 EQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLL--DLLGKEEDEGSH
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KE5 DKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
:..:. :... .: .....:. : . . ::.:...:
CCDS42 DENVS----------TCDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
480 490 500 510
>>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa)
initn: 1235 init1: 979 opt: 1975 Z-score: 2408.4 bits: 455.4 E(32554): 7.9e-128
Smith-Waterman score: 2022; 59.8% identity (79.5% similar) in 517 aa overlap (23-528:62-563)
10 20 30 40
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLS----LKRALWAL
: . :::: :. . . . .::::.:
CCDS11 LAAAGQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSLSRAKLHGLRHMCAGRTAAGGSFQRRALWVL
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 CFLGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDL
: :...:: ..:. :.. . :.. . . :: :::::.:: : .:: ..::.::
CCDS11 AFCTSFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFPAVTVCNNNPLRFPRLSKGDL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YHAGELLALL-NNRYEIP---DTQMADEKQLEILQDKANFRSF-KPKPFN--MREFYDRA
:.::. :.:: :: : . .:: . . .. :.:: : :. :. :.::
CCDS11 YYAGHWLGLLLPNRTARPLVSELLRGDEPRRQWFRKLADFRLFLPPRHFEGISAAFMDRL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 GHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIM
::...::::::..:::.:. ..:. :::.::::: ::::.::.: : :.:::::::::::
CCDS11 GHQLEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIM
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 LDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLI
::::::::::.::::.::.::::.:::::::.:::::..:::::::::::::: :::::
CCDS11 LDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLT
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 YLPPPWGTCKAVTMDSDLDFFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQ
::::::: :.. : :::: ::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::
CCDS11 YLPPPWGECRSSEMG--LDFFPVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQ
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 YKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYI
.::::.::: .:.:::..::.:. :::::::.:::::::::::.::::: :::::::.::
CCDS11 HKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYI
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 GENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVI
.:::::::::::.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::::.:::::: ::.:
CCDS11 SENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELI
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 KHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARG
:.:: :: ..: :..:. :... .: .....:. : . . :
CCDS11 KEKLL--DLLGKEEDEGSHDENVST----------CDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLG
510 520 530 540 550
pF1KE5 TFEDFTC
:.:...:
CCDS11 TLEEIAC
560
>>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 1479 init1: 687 opt: 1006 Z-score: 1225.8 bits: 236.5 E(32554): 5.9e-62
Smith-Waterman score: 1731; 51.0% identity (76.5% similar) in 506 aa overlap (14-504:12-507)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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530
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CCDS59 SSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
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CCDS59 PPTAPATLSHSSRPAVCVLGAPP
530 540
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CCDS24 TYIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIY
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:: .: : . : :.:. .:.:...:...:: : ::. : ....::.:
CCDS24 EVSWDRLKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPS-RGRVEG-GGVSSLLPNHH
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: : ::::.:
CCDS24 HPHGPPGGLFEDFAC
640
528 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Tue Nov 8 05:42:18 2016 done: Tue Nov 8 05:42:19 2016
Total Scan time: 2.640 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]